MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus plantarum subsp. plantarum ST-III chromosome

Total Repeats: 12441

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_014554	CAT	2	6	397543	397548	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1502	NC_014554	AAG	2	6	397574	397579	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1503	NC_014554	TAA	2	6	397610	397615	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1504	NC_014554	AGT	2	6	397761	397766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1505	NC_014554	TGCC	2	8	397767	397774	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1506	NC_014554	GTT	2	6	397812	397817	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1507	NC_014554	TGG	2	6	398316	398321	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1508	NC_014554	TTGG	2	8	398322	398329	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1509	NC_014554	TAA	2	6	398407	398412	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_014554	GTT	2	6	398486	398491	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_014554	A	6	6	400645	400650	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_014554	T	6	6	400677	400682	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1513	NC_014554	GTT	2	6	400707	400712	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1514	NC_014554	AGT	2	6	400740	400745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_014554	ATTA	2	8	400833	400840	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1516	NC_014554	TTAA	2	8	400853	400860	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1517	NC_014554	TTTTA	2	10	402077	402086	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1518	NC_014554	TCT	2	6	402096	402101	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1519	NC_014554	TTA	2	6	402161	402166	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1520	NC_014554	ATA	2	6	404428	404433	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1521	NC_014554	T	6	6	404439	404444	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1522	NC_014554	GAG	2	6	404472	404477	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1523	NC_014554	CAAG	2	8	404772	404779	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1524	NC_014554	AAGT	2	8	404819	404826	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1525	NC_014554	GTA	2	6	405740	405745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1526	NC_014554	CCG	2	6	405748	405753	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1527	NC_014554	TGG	2	6	405757	405762	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1528	NC_014554	T	7	7	405765	405771	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1529	NC_014554	CAT	2	6	405958	405963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1530	NC_014554	TTAAA	2	10	406996	407005	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1531	NC_014554	T	8	8	407060	407067	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1532	NC_014554	GAT	2	6	407131	407136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1533	NC_014554	GTAG	2	8	408781	408788	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1534	NC_014554	T	6	6	408873	408878	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1535	NC_014554	G	6	6	408912	408917	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1536	NC_014554	CA	3	6	408923	408928	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1537	NC_014554	TCT	2	6	408934	408939	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1538	NC_014554	ATT	2	6	409056	409061	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1539	NC_014554	AAG	2	6	409313	409318	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1540	NC_014554	A	6	6	409342	409347	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1541	NC_014554	GCAAG	2	10	409355	409364	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
1542	NC_014554	AAT	2	6	409471	409476	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1543	NC_014554	GAC	2	6	409523	409528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1544	NC_014554	GAA	2	6	409542	409547	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1545	NC_014554	A	6	6	409546	409551	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1546	NC_014554	TA	3	6	409571	409576	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1547	NC_014554	AAAGG	2	10	409654	409663	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
1548	NC_014554	TA	3	6	409712	409717	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1549	NC_014554	TGT	2	6	410744	410749	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1550	NC_014554	GAC	2	6	410769	410774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1551	NC_014554	AATAA	2	10	410797	410806	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1552	NC_014554	CAAT	2	8	410873	410880	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1553	NC_014554	CGT	2	6	410899	410904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1554	NC_014554	A	7	7	411044	411050	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1555	NC_014554	A	6	6	411055	411060	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1556	NC_014554	ATG	2	6	411110	411115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1557	NC_014554	GT	3	6	411978	411983	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1558	NC_014554	T	6	6	411996	412001	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1559	NC_014554	ATG	2	6	412005	412010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1560	NC_014554	GTT	2	6	413466	413471	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1561	NC_014554	TAA	2	6	413518	413523	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1562	NC_014554	GCT	2	6	413534	413539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1563	NC_014554	TTAA	2	8	413591	413598	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1564	NC_014554	GAG	2	6	413622	413627	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1565	NC_014554	ACGGG	2	10	413631	413640	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
1566	NC_014554	GT	3	6	414485	414490	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1567	NC_014554	TAG	2	6	414509	414514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1568	NC_014554	GT	3	6	414628	414633	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1569	NC_014554	TTG	3	9	414774	414782	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1570	NC_014554	TAT	2	6	414810	414815	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1571	NC_014554	AGTA	2	8	414818	414825	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1572	NC_014554	GGA	2	6	414840	414845	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1573	NC_014554	GTT	2	6	415911	415916	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1574	NC_014554	TGG	2	6	415917	415922	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1575	NC_014554	TGGAC	2	10	415944	415953	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1576	NC_014554	ATTA	2	8	415994	416001	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1577	NC_014554	T	7	7	416051	416057	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1578	NC_014554	A	7	7	417165	417171	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1579	NC_014554	AGG	2	6	417210	417215	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1580	NC_014554	T	6	6	418253	418258	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1581	NC_014554	A	6	6	418308	418313	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1582	NC_014554	TAG	2	6	418373	418378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1583	NC_014554	TCC	2	6	419199	419204	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1584	NC_014554	CTT	2	6	420570	420575	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1585	NC_014554	CAT	2	6	421531	421536	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1586	NC_014554	CG	3	6	421770	421775	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1587	NC_014554	TAT	2	6	422317	422322	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1588	NC_014554	TAT	2	6	423006	423011	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1589	NC_014554	CT	3	6	423022	423027	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1590	NC_014554	CTTT	2	8	423087	423094	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1591	NC_014554	ACC	2	6	423101	423106	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1592	NC_014554	AAAT	2	8	423112	423119	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1593	NC_014554	ATA	2	6	424902	424907	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1594	NC_014554	ATA	2	6	424921	424926	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1595	NC_014554	A	6	6	424926	424931	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1596	NC_014554	AAT	2	6	424940	424945	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1597	NC_014554	AGG	2	6	424950	424955	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1598	NC_014554	TAG	2	6	424998	425003	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1599	NC_014554	ATT	2	6	425012	425017	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1600	NC_014554	GTTG	2	8	425041	425048	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1601	NC_014554	TGA	2	6	425056	425061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1602	NC_014554	GGT	2	6	425135	425140	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1603	NC_014554	A	7	7	425152	425158	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1604	NC_014554	TTTTAA	2	12	425194	425205	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1605	NC_014554	ATT	2	6	426492	426497	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1606	NC_014554	AAT	2	6	426519	426524	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1607	NC_014554	ATA	2	6	426669	426674	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1608	NC_014554	GAA	2	6	426684	426689	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1609	NC_014554	AAC	2	6	426814	426819	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1610	NC_014554	ATT	2	6	428163	428168	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1611	NC_014554	CGAAT	2	10	428249	428258	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
1612	NC_014554	CGG	2	6	428288	428293	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1613	NC_014554	TCA	2	6	428340	428345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1614	NC_014554	TGCT	2	8	428358	428365	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1615	NC_014554	AAG	2	6	428425	428430	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1616	NC_014554	TGA	2	6	428464	428469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1617	NC_014554	AGG	2	6	428477	428482	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1618	NC_014554	GAT	2	6	430078	430083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1619	NC_014554	ATC	2	6	430102	430107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1620	NC_014554	T	6	6	430108	430113	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1621	NC_014554	ATA	2	6	430165	430170	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1622	NC_014554	A	7	7	430188	430194	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1623	NC_014554	GTGAG	2	10	430197	430206	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
1624	NC_014554	CAC	2	6	431057	431062	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1625	NC_014554	TG	3	6	431094	431099	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1626	NC_014554	AGT	2	6	431117	431122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1627	NC_014554	TAAA	2	8	431123	431130	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1628	NC_014554	GTT	2	6	431150	431155	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1629	NC_014554	GTG	2	6	431158	431163	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1630	NC_014554	GT	3	6	431203	431208	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1631	NC_014554	TTA	2	6	431325	431330	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1632	NC_014554	ATC	2	6	431350	431355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1633	NC_014554	ATA	2	6	431356	431361	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1634	NC_014554	ATT	2	6	431427	431432	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1635	NC_014554	TAT	2	6	431491	431496	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1637	NC_014554	TTA	2	6	431726	431731	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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