MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus plantarum subsp. plantarum ST-III chromosome

Total Repeats: 12441

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_014554	TGC	2	6	3002975	3002980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11502	NC_014554	T	6	6	3003041	3003046	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11503	NC_014554	TCT	2	6	3003051	3003056	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11504	NC_014554	ATTAC	2	10	3003647	3003656	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
11505	NC_014554	ATTT	2	8	3003666	3003673	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11506	NC_014554	TAA	2	6	3003713	3003718	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11507	NC_014554	AT	3	6	3003734	3003739	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11508	NC_014554	GGCG	2	8	3003758	3003765	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
11509	NC_014554	ATC	2	6	3003776	3003781	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11510	NC_014554	CTA	2	6	3003813	3003818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11511	NC_014554	TTAAC	2	10	3003841	3003850	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
11512	NC_014554	AGG	2	6	3003860	3003865	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11513	NC_014554	A	7	7	3003877	3003883	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11514	NC_014554	TAT	2	6	3003891	3003896	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11515	NC_014554	CA	4	8	3003959	3003966	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11516	NC_014554	ATC	2	6	3004018	3004023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11517	NC_014554	AGTAA	2	10	3004096	3004105	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
11518	NC_014554	ATTAT	2	10	3004139	3004148	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
11519	NC_014554	A	6	6	3004167	3004172	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11520	NC_014554	A	6	6	3004174	3004179	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11521	NC_014554	TGC	2	6	3004691	3004696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11522	NC_014554	ATT	2	6	3004725	3004730	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11523	NC_014554	ATT	2	6	3004754	3004759	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11524	NC_014554	AAT	2	6	3004780	3004785	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11525	NC_014554	TTC	2	6	3004816	3004821	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11526	NC_014554	A	6	6	3004842	3004847	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11527	NC_014554	TCC	2	6	3005496	3005501	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11528	NC_014554	TAT	2	6	3006883	3006888	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11529	NC_014554	A	6	6	3006906	3006911	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11530	NC_014554	AC	3	6	3007553	3007558	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11531	NC_014554	GCC	2	6	3007571	3007576	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11532	NC_014554	GTC	2	6	3007597	3007602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11533	NC_014554	ATT	2	6	3007603	3007608	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11534	NC_014554	CCG	2	6	3007614	3007619	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11535	NC_014554	ACC	2	6	3007645	3007650	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11536	NC_014554	GGA	2	6	3007680	3007685	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11537	NC_014554	A	6	6	3008703	3008708	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11538	NC_014554	TAA	2	6	3008728	3008733	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11539	NC_014554	TAG	2	6	3008878	3008883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11540	NC_014554	AGG	2	6	3008901	3008906	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11541	NC_014554	TAG	2	6	3010342	3010347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11542	NC_014554	CCA	2	6	3010350	3010355	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11543	NC_014554	A	6	6	3010355	3010360	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11544	NC_014554	GCA	2	6	3010373	3010378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11545	NC_014554	CCT	2	6	3011401	3011406	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11546	NC_014554	ATC	2	6	3011431	3011436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11547	NC_014554	TTC	2	6	3011444	3011449	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11548	NC_014554	GAA	2	6	3011629	3011634	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11549	NC_014554	AAT	2	6	3011652	3011657	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11550	NC_014554	ATT	2	6	3011818	3011823	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11551	NC_014554	ATG	2	6	3011910	3011915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11552	NC_014554	GTG	2	6	3011994	3011999	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11553	NC_014554	T	6	6	3012059	3012064	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11554	NC_014554	CAC	2	6	3012082	3012087	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11555	NC_014554	ACGA	2	8	3012128	3012135	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
11556	NC_014554	GCTG	2	8	3012181	3012188	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
11557	NC_014554	A	6	6	3012200	3012205	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11558	NC_014554	TAATCA	2	12	3012216	3012227	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11559	NC_014554	TCA	2	6	3012314	3012319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11560	NC_014554	A	6	6	3014280	3014285	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11561	NC_014554	CCG	2	6	3014293	3014298	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11562	NC_014554	CGG	2	6	3014319	3014324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11563	NC_014554	AAT	3	9	3014361	3014369	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11564	NC_014554	TTAA	2	8	3014387	3014394	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11565	NC_014554	TCC	2	6	3015161	3015166	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11566	NC_014554	TAA	2	6	3015256	3015261	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11567	NC_014554	AGA	2	6	3015369	3015374	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11568	NC_014554	CAA	2	6	3015398	3015403	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11569	NC_014554	TTA	2	6	3015408	3015413	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11570	NC_014554	TACT	2	8	3015514	3015521	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11571	NC_014554	CAT	2	6	3015871	3015876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11572	NC_014554	A	6	6	3016156	3016161	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11573	NC_014554	TCC	2	6	3016462	3016467	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11574	NC_014554	TAATT	2	10	3016472	3016481	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
11575	NC_014554	CA	3	6	3016538	3016543	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11576	NC_014554	TTC	2	6	3016565	3016570	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11577	NC_014554	TTGA	2	8	3017418	3017425	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
11578	NC_014554	A	6	6	3017454	3017459	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11579	NC_014554	TTA	2	6	3017479	3017484	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11580	NC_014554	AGG	2	6	3017558	3017563	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11581	NC_014554	ACT	2	6	3018240	3018245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11582	NC_014554	AATTA	2	10	3018246	3018255	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
11583	NC_014554	GAT	2	6	3018440	3018445	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11584	NC_014554	T	6	6	3018454	3018459	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11585	NC_014554	GAT	2	6	3018475	3018480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11586	NC_014554	AAT	2	6	3018490	3018495	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11587	NC_014554	TTA	2	6	3018527	3018532	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11588	NC_014554	CAT	2	6	3020538	3020543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11589	NC_014554	ATTC	2	8	3020554	3020561	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11590	NC_014554	AAC	2	6	3020778	3020783	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11591	NC_014554	T	6	6	3020812	3020817	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11592	NC_014554	TTAG	2	8	3020877	3020884	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
11593	NC_014554	GTT	2	6	3021067	3021072	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11594	NC_014554	TCAA	2	8	3021093	3021100	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11595	NC_014554	ACCG	2	8	3021280	3021287	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
11596	NC_014554	ATT	2	6	3021319	3021324	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11597	NC_014554	CGGG	2	8	3021377	3021384	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
11598	NC_014554	ATT	2	6	3023648	3023653	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11599	NC_014554	ATT	3	9	3023679	3023687	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11600	NC_014554	TAA	2	6	3023706	3023711	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11601	NC_014554	AAAGCA	2	12	3023716	3023727	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
11602	NC_014554	CTC	2	6	3025938	3025943	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11603	NC_014554	CCTT	2	8	3026974	3026981	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11604	NC_014554	TATG	2	8	3027004	3027011	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
11605	NC_014554	AGC	2	6	3027037	3027042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11606	NC_014554	ATT	2	6	3028690	3028695	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11607	NC_014554	AT	3	6	3028748	3028753	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11608	NC_014554	TGA	2	6	3028778	3028783	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11609	NC_014554	ACT	2	6	3028872	3028877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11610	NC_014554	ATTAT	2	10	3028968	3028977	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
11611	NC_014554	TGA	2	6	3028988	3028993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11612	NC_014554	CA	3	6	3028997	3029002	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11613	NC_014554	TA	4	8	3029041	3029048	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11614	NC_014554	AAT	2	6	3029206	3029211	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11615	NC_014554	AAGC	2	8	3029918	3029925	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
11616	NC_014554	GCTT	2	8	3029949	3029956	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
11617	NC_014554	T	6	6	3029959	3029964	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11618	NC_014554	TA	4	8	3029969	3029976	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11619	NC_014554	CCTT	2	8	3032874	3032881	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11620	NC_014554	CCA	2	6	3032959	3032964	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11621	NC_014554	CA	3	6	3032999	3033004	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11622	NC_014554	ACT	2	6	3033017	3033022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11623	NC_014554	TATT	2	8	3033054	3033061	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11624	NC_014554	CAAA	2	8	3033170	3033177	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
11625	NC_014554	CGT	2	6	3033181	3033186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11626	NC_014554	ATT	2	6	3033225	3033230	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11627	NC_014554	TAA	2	6	3033957	3033962	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11628	NC_014554	TGA	2	6	3033976	3033981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11630	NC_014554	CTC	2	6	3035858	3035863	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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