MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus plantarum subsp. plantarum ST-III chromosome

Total Repeats: 12441

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_014554	TCGG	2	8	172409	172416	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
502	NC_014554	TGG	2	6	172446	172451	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
503	NC_014554	CCA	2	6	172517	172522	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
504	NC_014554	ACG	2	6	172547	172552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
505	NC_014554	CGA	2	6	172599	172604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
506	NC_014554	AAT	2	6	172693	172698	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
507	NC_014554	CGG	2	6	172812	172817	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
508	NC_014554	AAAC	2	8	172865	172872	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
509	NC_014554	CCA	2	6	172905	172910	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
510	NC_014554	GCG	2	6	172937	172942	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
511	NC_014554	CAT	2	6	172968	172973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
512	NC_014554	GGTTA	2	10	173038	173047	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
513	NC_014554	TAA	2	6	173065	173070	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
514	NC_014554	TTC	2	6	173107	173112	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
515	NC_014554	CTC	2	6	173168	173173	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
516	NC_014554	GTG	2	6	173196	173201	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
517	NC_014554	TTA	2	6	173214	173219	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
518	NC_014554	TAAA	2	8	173221	173228	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
519	NC_014554	CAG	2	6	173292	173297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
520	NC_014554	ATTAA	2	10	173352	173361	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
521	NC_014554	CAG	2	6	174808	174813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
522	NC_014554	ATA	2	6	174857	174862	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
523	NC_014554	A	6	6	174875	174880	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
524	NC_014554	ATA	2	6	174894	174899	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
525	NC_014554	GATT	2	8	174913	174920	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
526	NC_014554	ACC	2	6	174931	174936	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
527	NC_014554	CACT	2	8	174960	174967	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
528	NC_014554	GTT	2	6	174985	174990	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
529	NC_014554	CCG	2	6	174993	174998	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
530	NC_014554	GCA	2	6	175052	175057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
531	NC_014554	TCGT	2	8	175108	175115	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
532	NC_014554	ATA	2	6	175132	175137	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
533	NC_014554	AAAT	2	8	175193	175200	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
534	NC_014554	T	6	6	175287	175292	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
535	NC_014554	T	6	6	175302	175307	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
536	NC_014554	GCT	2	6	177013	177018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
537	NC_014554	CGG	2	6	177042	177047	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
538	NC_014554	TG	3	6	177049	177054	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
539	NC_014554	TGA	2	6	177090	177095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
540	NC_014554	TATGAT	2	12	177174	177185	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
541	NC_014554	GTTG	2	8	178141	178148	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
542	NC_014554	TGAT	2	8	178183	178190	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
543	NC_014554	TTA	2	6	178200	178205	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
544	NC_014554	AATT	2	8	178262	178269	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
545	NC_014554	ATT	2	6	178302	178307	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
546	NC_014554	TA	3	6	178372	178377	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
547	NC_014554	A	7	7	178450	178456	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
548	NC_014554	TAA	2	6	178564	178569	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
549	NC_014554	A	6	6	178576	178581	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
550	NC_014554	TA	3	6	178604	178609	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
551	NC_014554	AAT	2	6	178624	178629	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
552	NC_014554	CAT	2	6	178736	178741	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
553	NC_014554	ATT	2	6	178785	178790	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
554	NC_014554	AAC	2	6	178801	178806	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
555	NC_014554	AT	3	6	178893	178898	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
556	NC_014554	ATTA	2	8	178905	178912	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
557	NC_014554	ATAA	2	8	178920	178927	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
558	NC_014554	TA	3	6	178932	178937	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
559	NC_014554	CGA	2	6	178992	178997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
560	NC_014554	TA	3	6	179076	179081	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
561	NC_014554	G	6	6	179087	179092	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
562	NC_014554	GCC	2	6	179137	179142	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
563	NC_014554	ATTG	2	8	179151	179158	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
564	NC_014554	AGTG	2	8	179172	179179	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
565	NC_014554	CGG	2	6	179180	179185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
566	NC_014554	CCACTG	2	12	179195	179206	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
567	NC_014554	ACG	2	6	179209	179214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
568	NC_014554	GTG	2	6	179248	179253	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
569	NC_014554	AGCAGT	11	66	179269	179334	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
570	NC_014554	GCG	2	6	179359	179364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
571	NC_014554	CAC	2	6	179391	179396	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
572	NC_014554	TCA	2	6	179404	179409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
573	NC_014554	ATC	2	6	179415	179420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
574	NC_014554	CTA	2	6	179432	179437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
575	NC_014554	CAA	2	6	179471	179476	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
576	NC_014554	AAC	2	6	179557	179562	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
577	NC_014554	AGCA	2	8	179564	179571	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
578	NC_014554	CAA	2	6	179587	179592	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
579	NC_014554	TTTA	2	8	182004	182011	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
580	NC_014554	CCT	2	6	182175	182180	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
581	NC_014554	TTA	2	6	182227	182232	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
582	NC_014554	ATT	2	6	182243	182248	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
583	NC_014554	TA	3	6	183174	183179	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
584	NC_014554	AT	3	6	183220	183225	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
585	NC_014554	TA	3	6	183232	183237	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
586	NC_014554	A	6	6	183237	183242	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
587	NC_014554	CGCT	2	8	183243	183250	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
588	NC_014554	C	6	6	184961	184966	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
589	NC_014554	TAA	2	6	185023	185028	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
590	NC_014554	A	7	7	185068	185074	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
591	NC_014554	TTG	2	6	185085	185090	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
592	NC_014554	ATT	2	6	186888	186893	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
593	NC_014554	T	7	7	186892	186898	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
594	NC_014554	ATT	2	6	186909	186914	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
595	NC_014554	TTAA	2	8	186957	186964	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
596	NC_014554	TCC	2	6	188594	188599	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
597	NC_014554	AGT	2	6	189695	189700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
598	NC_014554	TAA	2	6	189711	189716	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
599	NC_014554	A	6	6	189715	189720	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
600	NC_014554	ATA	2	6	189753	189758	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
601	NC_014554	GT	3	6	189849	189854	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
602	NC_014554	AGG	2	6	189860	189865	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
603	NC_014554	ATG	2	6	189873	189878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
604	NC_014554	TTAG	2	8	189889	189896	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
605	NC_014554	AGCA	2	8	189968	189975	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
606	NC_014554	TAT	2	6	190026	190031	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
607	NC_014554	TAA	3	9	190032	190040	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
608	NC_014554	AACG	2	8	190698	190705	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
609	NC_014554	TGG	2	6	190728	190733	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
610	NC_014554	TCAAA	2	10	190766	190775	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
611	NC_014554	GCA	2	6	190786	190791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
612	NC_014554	CAG	2	6	190793	190798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
613	NC_014554	GGT	2	6	190824	190829	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
614	NC_014554	TATAA	2	10	190902	190911	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
615	NC_014554	TTA	2	6	191980	191985	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
616	NC_014554	TTA	2	6	191997	192002	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
617	NC_014554	TTC	2	6	192047	192052	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
618	NC_014554	AAT	2	6	192056	192061	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
619	NC_014554	AAT	2	6	192257	192262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
620	NC_014554	TTAG	2	8	192303	192310	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
621	NC_014554	TCA	2	6	192354	192359	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
622	NC_014554	ACGT	2	8	192381	192388	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
623	NC_014554	ATG	2	6	192403	192408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
624	NC_014554	CTA	2	6	192412	192417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
625	NC_014554	TAA	3	9	193906	193914	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
626	NC_014554	GTTA	2	8	193924	193931	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
627	NC_014554	GAAT	2	8	193954	193961	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
628	NC_014554	A	6	6	193985	193990	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
629	NC_014554	TTGA	2	8	194035	194042	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
630	NC_014554	AAAGAT	2	12	195548	195559	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
631	NC_014554	GTT	2	6	195564	195569	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
632	NC_014554	GGC	2	6	195602	195607	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
633	NC_014554	TTG	2	6	195608	195613	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
634	NC_014554	AGTT	2	8	195650	195657	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
635	NC_014554	T	6	6	195673	195678	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
636	NC_014554	A	6	6	196454	196459	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
637	NC_014554	A	6	6	196465	196470	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
638	NC_014554	TAAT	2	8	196553	196560	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
639	NC_014554	ATTA	2	8	196616	196623	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
640	NC_014554	TGG	2	6	196630	196635	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
641	NC_014554	T	7	7	196668	196674	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
642	NC_014554	TTA	2	6	196710	196715	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
643	NC_014554	TTG	2	6	198255	198260	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
644	NC_014554	ACC	2	6	198869	198874	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
645	NC_014554	AAT	2	6	198924	198929	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
646	NC_014554	TGAA	2	8	198959	198966	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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648	NC_014554	AGT	2	6	198985	198990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
649	NC_014554	AAT	3	9	198991	198999	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
650	NC_014554	TCC	2	6	201026	201031	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
651	NC_014554	AGT	2	6	201036	201041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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657	NC_014554	ATG	2	6	201282	201287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
658	NC_014554	AGG	2	6	201346	201351	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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664	NC_014554	GTA	2	6	202878	202883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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672	NC_014554	A	7	7	204540	204546	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
673	NC_014554	AATT	2	8	204643	204650	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
674	NC_014554	A	6	6	204696	204701	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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678	NC_014554	A	6	6	205597	205602	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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691	NC_014554	AAGT	2	8	213216	213223	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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774	NC_014554	TGT	2	6	241484	241489	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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