MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus plantarum subsp. plantarum ST-III chromosome

Total Repeats: 12441

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_014554	ATT	2	6	1590368	1590373	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6002	NC_014554	TGA	2	6	1590509	1590514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6003	NC_014554	GT	3	6	1590698	1590703	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6004	NC_014554	GTC	2	6	1590717	1590722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6005	NC_014554	TGA	2	6	1590902	1590907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6006	NC_014554	TGC	2	6	1590927	1590932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6007	NC_014554	TTTA	2	8	1590945	1590952	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6008	NC_014554	ATT	2	6	1590986	1590991	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6009	NC_014554	CAA	2	6	1591019	1591024	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6010	NC_014554	ATT	2	6	1591044	1591049	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6011	NC_014554	AAT	2	6	1591063	1591068	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6012	NC_014554	AATTG	2	10	1591080	1591089	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
6013	NC_014554	AATA	2	8	1591103	1591110	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6014	NC_014554	TAA	2	6	1591169	1591174	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6015	NC_014554	GCTAG	2	10	1591195	1591204	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
6016	NC_014554	TGA	2	6	1591383	1591388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6017	NC_014554	A	6	6	1591466	1591471	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6018	NC_014554	CAT	2	6	1591598	1591603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6019	NC_014554	ATG	2	6	1591626	1591631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6020	NC_014554	TGG	2	6	1591634	1591639	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6021	NC_014554	AATCAT	2	12	1591650	1591661	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
6022	NC_014554	AT	3	6	1591660	1591665	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6023	NC_014554	AATT	2	8	1591728	1591735	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6024	NC_014554	TGA	2	6	1591773	1591778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6025	NC_014554	TGT	2	6	1591802	1591807	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6026	NC_014554	ATG	2	6	1591812	1591817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6027	NC_014554	TG	3	6	1591823	1591828	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6028	NC_014554	CTAG	2	8	1591843	1591850	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6029	NC_014554	G	6	6	1591850	1591855	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6030	NC_014554	T	7	7	1591857	1591863	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6031	NC_014554	ATA	2	6	1591880	1591885	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6032	NC_014554	TA	3	6	1591884	1591889	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6033	NC_014554	T	6	6	1591955	1591960	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6034	NC_014554	CTTAA	2	10	1592059	1592068	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
6035	NC_014554	ATT	2	6	1592069	1592074	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6036	NC_014554	T	6	6	1592073	1592078	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6037	NC_014554	TGCA	2	8	1592213	1592220	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6038	NC_014554	TAAC	2	8	1592238	1592245	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6039	NC_014554	TTTA	2	8	1592259	1592266	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6040	NC_014554	TAA	2	6	1592284	1592289	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6041	NC_014554	TC	3	6	1592312	1592317	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6042	NC_014554	TGT	2	6	1592342	1592347	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6043	NC_014554	CTA	2	6	1592396	1592401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6044	NC_014554	T	6	6	1593292	1593297	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6045	NC_014554	GTT	2	6	1593315	1593320	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6046	NC_014554	TTAA	2	8	1593378	1593385	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6047	NC_014554	GAT	2	6	1593463	1593468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6048	NC_014554	CTA	2	6	1593700	1593705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6049	NC_014554	CGA	2	6	1593712	1593717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6050	NC_014554	GGTT	2	8	1593732	1593739	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6051	NC_014554	TCC	2	6	1594358	1594363	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6052	NC_014554	TTA	2	6	1594367	1594372	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6053	NC_014554	CTAG	2	8	1594878	1594885	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6054	NC_014554	A	6	6	1594891	1594896	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6055	NC_014554	CAA	2	6	1594904	1594909	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6056	NC_014554	CTT	2	6	1594917	1594922	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6057	NC_014554	TCT	2	6	1596871	1596876	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6058	NC_014554	GTT	2	6	1596933	1596938	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6059	NC_014554	TAAA	2	8	1596944	1596951	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6060	NC_014554	TAA	2	6	1601568	1601573	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6061	NC_014554	AC	3	6	1601680	1601685	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6062	NC_014554	TTA	2	6	1601772	1601777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6063	NC_014554	ACC	2	6	1601840	1601845	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6064	NC_014554	ATA	2	6	1601859	1601864	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6065	NC_014554	A	6	6	1601871	1601876	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6066	NC_014554	ATTTT	2	10	1601879	1601888	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
6067	NC_014554	ATC	2	6	1601905	1601910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6068	NC_014554	T	6	6	1601912	1601917	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6069	NC_014554	TAAT	2	8	1601922	1601929	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6070	NC_014554	AGG	2	6	1601977	1601982	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6071	NC_014554	ATA	2	6	1601997	1602002	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6072	NC_014554	ATC	2	6	1602012	1602017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6073	NC_014554	ATT	2	6	1602051	1602056	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6074	NC_014554	TTTC	2	8	1602065	1602072	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6075	NC_014554	TTTA	2	8	1602658	1602665	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6076	NC_014554	T	7	7	1602697	1602703	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6077	NC_014554	GAT	2	6	1602721	1602726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6078	NC_014554	A	6	6	1602763	1602768	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6079	NC_014554	TCC	2	6	1605145	1605150	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6080	NC_014554	GGA	2	6	1606663	1606668	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6081	NC_014554	TTG	2	6	1608048	1608053	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6082	NC_014554	TTG	2	6	1608071	1608076	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6083	NC_014554	TCA	2	6	1608077	1608082	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6084	NC_014554	AGA	2	6	1608099	1608104	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6085	NC_014554	ATT	2	6	1608257	1608262	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6086	NC_014554	A	7	7	1608274	1608280	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6087	NC_014554	ATC	2	6	1608282	1608287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6088	NC_014554	T	7	7	1608299	1608305	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6089	NC_014554	T	6	6	1610361	1610366	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6090	NC_014554	GCC	2	6	1610422	1610427	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6091	NC_014554	TCATTA	2	12	1610478	1610489	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
6092	NC_014554	TTG	2	6	1611438	1611443	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6093	NC_014554	GTC	2	6	1611450	1611455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6094	NC_014554	AACGG	2	10	1611456	1611465	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
6095	NC_014554	CTT	2	6	1611466	1611471	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6096	NC_014554	AGT	2	6	1611477	1611482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6097	NC_014554	AGC	2	6	1613170	1613175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6098	NC_014554	TGC	2	6	1613193	1613198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6099	NC_014554	AC	3	6	1613540	1613545	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6100	NC_014554	CTA	2	6	1613553	1613558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6101	NC_014554	TCA	3	9	1613589	1613597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6102	NC_014554	ATC	2	6	1614820	1614825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6103	NC_014554	GTCT	2	8	1614832	1614839	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6104	NC_014554	TAT	2	6	1614849	1614854	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6105	NC_014554	TGA	2	6	1614892	1614897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6106	NC_014554	AAT	2	6	1614923	1614928	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6107	NC_014554	AGG	2	6	1614989	1614994	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6108	NC_014554	T	6	6	1615962	1615967	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6109	NC_014554	AAC	2	6	1615971	1615976	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6110	NC_014554	A	6	6	1615989	1615994	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6111	NC_014554	TTTTG	2	10	1617807	1617816	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
6112	NC_014554	AT	3	6	1617844	1617849	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6113	NC_014554	TAT	2	6	1617852	1617857	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6114	NC_014554	GTA	2	6	1617945	1617950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6115	NC_014554	GTT	2	6	1618014	1618019	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6116	NC_014554	ATC	2	6	1618028	1618033	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6117	NC_014554	CTT	2	6	1619546	1619551	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6118	NC_014554	GCAAG	2	10	1619677	1619686	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
6119	NC_014554	ATG	2	6	1619708	1619713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6120	NC_014554	ACA	2	6	1619941	1619946	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6121	NC_014554	TCA	2	6	1621294	1621299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6122	NC_014554	TTC	2	6	1624702	1624707	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6123	NC_014554	ATC	2	6	1627252	1627257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6124	NC_014554	T	7	7	1629187	1629193	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6125	NC_014554	CAT	2	6	1629195	1629200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6126	NC_014554	ATC	2	6	1629276	1629281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6127	NC_014554	A	7	7	1629305	1629311	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6128	NC_014554	GTT	2	6	1629338	1629343	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6129	NC_014554	TCC	2	6	1631879	1631884	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6130	NC_014554	TA	3	6	1632123	1632128	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6131	NC_014554	GCC	2	6	1632134	1632139	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6132	NC_014554	GAA	2	6	1633052	1633057	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6133	NC_014554	TCA	2	6	1634387	1634392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6134	NC_014554	GAC	2	6	1634473	1634478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6135	NC_014554	A	6	6	1634482	1634487	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6136	NC_014554	GAT	2	6	1634884	1634889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6137	NC_014554	GA	3	6	1634912	1634917	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6138	NC_014554	CAT	2	6	1634930	1634935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6139	NC_014554	TTC	2	6	1634936	1634941	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6140	NC_014554	T	6	6	1634977	1634982	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6141	NC_014554	GAT	2	6	1635011	1635016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6146	NC_014554	A	7	7	1636465	1636471	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6147	NC_014554	AATC	2	8	1636504	1636511	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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6149	NC_014554	CAA	2	6	1637823	1637828	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6150	NC_014554	AGCT	2	8	1637867	1637874	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6151	NC_014554	TAAC	2	8	1638583	1638590	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6152	NC_014554	A	6	6	1638604	1638609	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6153	NC_014554	TCC	2	6	1639257	1639262	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6154	NC_014554	A	6	6	1639265	1639270	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6155	NC_014554	TGT	2	6	1641805	1641810	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6166	NC_014554	ATTT	2	8	1642920	1642927	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6167	NC_014554	CCGCA	2	10	1645416	1645425	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
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6200	NC_014554	T	7	7	1655633	1655639	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6201	NC_014554	TG	3	6	1655642	1655647	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6202	NC_014554	GCCA	2	8	1655656	1655663	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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6205	NC_014554	TCG	2	6	1655866	1655871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6211	NC_014554	A	7	7	1656094	1656100	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6222	NC_014554	ATA	2	6	1662405	1662410	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6223	NC_014554	ATT	2	6	1662438	1662443	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6244	NC_014554	TGA	2	6	1670365	1670370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6247	NC_014554	GC	3	6	1671621	1671626	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6248	NC_014554	AAT	2	6	1671738	1671743	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6249	NC_014554	TGGTC	2	10	1671798	1671807	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
6250	NC_014554	GAA	2	6	1671853	1671858	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6251	NC_014554	T	6	6	1673107	1673112	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6252	NC_014554	ACC	2	6	1673310	1673315	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6253	NC_014554	CGTT	2	8	1674306	1674313	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6254	NC_014554	AATT	2	8	1674356	1674363	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6255	NC_014554	CAC	2	6	1676704	1676709	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6256	NC_014554	TC	3	6	1678043	1678048	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6257	NC_014554	CTT	2	6	1678049	1678054	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6258	NC_014554	AAAAG	2	10	1678060	1678069	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
6259	NC_014554	AAAC	2	8	1678086	1678093	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
6260	NC_014554	TCA	2	6	1678102	1678107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6261	NC_014554	ATT	2	6	1678120	1678125	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6262	NC_014554	AAC	2	6	1678158	1678163	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6263	NC_014554	GAAC	2	8	1679736	1679743	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6264	NC_014554	CAT	2	6	1679749	1679754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6265	NC_014554	ACTG	2	8	1680243	1680250	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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6382	NC_014554	TTG	2	6	1717340	1717345	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6385	NC_014554	CAG	2	6	1720263	1720268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6388	NC_014554	ATCA	2	8	1720387	1720394	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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6392	NC_014554	CTC	2	6	1720971	1720976	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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6395	NC_014554	TAT	2	6	1721396	1721401	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6396	NC_014554	GCC	2	6	1722268	1722273	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6397	NC_014554	GC	4	8	1722317	1722324	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6398	NC_014554	T	6	6	1722325	1722330	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6399	NC_014554	CAT	2	6	1722332	1722337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6400	NC_014554	ATTA	2	8	1722348	1722355	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6401	NC_014554	CTA	2	6	1722362	1722367	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6402	NC_014554	ATC	2	6	1722368	1722373	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6405	NC_014554	AAAT	2	8	1724156	1724163	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6422	NC_014554	AT	3	6	1730760	1730765	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6431	NC_014554	T	6	6	1732928	1732933	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6432	NC_014554	ATC	2	6	1732941	1732946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6442	NC_014554	GTCC	2	8	1739383	1739390	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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6465	NC_014554	A	7	7	1748368	1748374	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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