MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus plantarum subsp. plantarum ST-III chromosome

Total Repeats: 12441

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_014554	T	6	6	1154472	1154477	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4502	NC_014554	AT	3	6	1154483	1154488	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4503	NC_014554	GAAG	2	8	1154511	1154518	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4504	NC_014554	CAT	2	6	1154621	1154626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4505	NC_014554	CTG	2	6	1154636	1154641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4506	NC_014554	CGG	2	6	1154675	1154680	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4507	NC_014554	TAG	2	6	1154685	1154690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4508	NC_014554	AGT	2	6	1154701	1154706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4509	NC_014554	TAG	2	6	1154712	1154717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4510	NC_014554	TCT	2	6	1154740	1154745	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4511	NC_014554	GCA	2	6	1154746	1154751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4512	NC_014554	GCG	2	6	1154758	1154763	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4513	NC_014554	GCT	2	6	1154770	1154775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4514	NC_014554	AGT	2	6	1154785	1154790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4515	NC_014554	TAC	2	6	1154802	1154807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4516	NC_014554	TCT	2	6	1154827	1154832	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4517	NC_014554	AGC	2	6	1154884	1154889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4518	NC_014554	GCGA	2	8	1154917	1154924	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4519	NC_014554	TAG	3	9	1154961	1154969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4520	NC_014554	AGT	3	9	1155013	1155021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4521	NC_014554	AGC	2	6	1155061	1155066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4522	NC_014554	TTC	2	6	1155069	1155074	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4523	NC_014554	AGCT	2	8	1155078	1155085	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4524	NC_014554	ACG	2	6	1155091	1155096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4525	NC_014554	TAGCG	2	10	1155114	1155123	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
4526	NC_014554	AGCA	2	8	1155141	1155148	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4527	NC_014554	CGG	2	6	1155179	1155184	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4528	NC_014554	TCG	2	6	1155211	1155216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4529	NC_014554	GGC	2	6	1155258	1155263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4530	NC_014554	CAG	2	6	1155306	1155311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4531	NC_014554	ACG	2	6	1155337	1155342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4532	NC_014554	AGC	2	6	1155345	1155350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4533	NC_014554	AGTG	2	8	1155351	1155358	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4534	NC_014554	AAG	2	6	1155377	1155382	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4535	NC_014554	AGGG	2	8	1168624	1168631	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
4536	NC_014554	TAAGT	2	10	1168851	1168860	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
4537	NC_014554	TTG	2	6	1169511	1169516	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4538	NC_014554	T	6	6	1170221	1170226	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4539	NC_014554	GAT	2	6	1170248	1170253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4540	NC_014554	A	7	7	1170286	1170292	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4541	NC_014554	CTA	2	6	1170305	1170310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4542	NC_014554	TAG	2	6	1170344	1170349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4543	NC_014554	GGT	2	6	1170502	1170507	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4544	NC_014554	T	7	7	1170554	1170560	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4545	NC_014554	T	6	6	1170562	1170567	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4546	NC_014554	TACA	2	8	1170641	1170648	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4547	NC_014554	GCA	2	6	1170651	1170656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4548	NC_014554	ACT	2	6	1170667	1170672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4549	NC_014554	TGAC	2	8	1173153	1173160	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4550	NC_014554	TTG	2	6	1173163	1173168	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4551	NC_014554	T	6	6	1173182	1173187	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4552	NC_014554	ACT	2	6	1173189	1173194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4553	NC_014554	GATT	2	8	1173219	1173226	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4554	NC_014554	TGG	2	6	1173293	1173298	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4555	NC_014554	GT	3	6	1173304	1173309	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4556	NC_014554	CTTAA	2	10	1173323	1173332	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
4557	NC_014554	GGC	2	6	1173375	1173380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4558	NC_014554	CTG	2	6	1173384	1173389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4559	NC_014554	T	6	6	1173442	1173447	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4560	NC_014554	CGG	2	6	1173472	1173477	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4561	NC_014554	GAATT	2	10	1173552	1173561	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
4562	NC_014554	TTGT	2	8	1173567	1173574	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4563	NC_014554	TAAAT	2	10	1176071	1176080	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4564	NC_014554	AACT	2	8	1176092	1176099	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4565	NC_014554	T	6	6	1176127	1176132	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4566	NC_014554	TTAC	2	8	1177071	1177078	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4567	NC_014554	ATT	2	6	1177080	1177085	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4568	NC_014554	GAC	2	6	1177091	1177096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4569	NC_014554	GGA	2	6	1177128	1177133	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4570	NC_014554	ATC	2	6	1179179	1179184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4571	NC_014554	GTT	2	6	1179220	1179225	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4572	NC_014554	T	6	6	1179256	1179261	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4573	NC_014554	TGG	2	6	1179279	1179284	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4574	NC_014554	A	7	7	1179298	1179304	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4575	NC_014554	TAA	2	6	1179380	1179385	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4576	NC_014554	AGTGGC	2	12	1182315	1182326	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
4577	NC_014554	ATG	2	6	1182335	1182340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4578	NC_014554	GTGG	2	8	1182356	1182363	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
4579	NC_014554	TAG	2	6	1182397	1182402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4580	NC_014554	GTG	2	6	1182413	1182418	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4581	NC_014554	CAA	2	6	1182446	1182451	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4582	NC_014554	A	6	6	1182543	1182548	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4583	NC_014554	CCA	2	6	1182606	1182611	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4584	NC_014554	CAAT	2	8	1182721	1182728	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4585	NC_014554	TAT	2	6	1182767	1182772	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4586	NC_014554	CGC	2	6	1182804	1182809	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4587	NC_014554	GAT	2	6	1182830	1182835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4588	NC_014554	AGC	2	6	1182922	1182927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4589	NC_014554	TGC	3	9	1183088	1183096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4590	NC_014554	AGC	2	6	1183103	1183108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4591	NC_014554	TTCT	2	8	1183109	1183116	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4592	NC_014554	AG	3	6	1183225	1183230	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4593	NC_014554	TGG	2	6	1183247	1183252	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4594	NC_014554	GGC	2	6	1183253	1183258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4595	NC_014554	TAA	2	6	1183379	1183384	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4596	NC_014554	A	6	6	1183410	1183415	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4597	NC_014554	AAG	2	6	1183422	1183427	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4598	NC_014554	ACGA	2	8	1183463	1183470	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4599	NC_014554	TAA	2	6	1183475	1183480	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4600	NC_014554	GTC	2	6	1183639	1183644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4601	NC_014554	GAA	2	6	1183662	1183667	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4602	NC_014554	AAG	2	6	1184449	1184454	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4603	NC_014554	A	6	6	1185202	1185207	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4604	NC_014554	AT	3	6	1185215	1185220	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4605	NC_014554	A	7	7	1185229	1185235	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4606	NC_014554	TTA	2	6	1185686	1185691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4607	NC_014554	TCAA	2	8	1185730	1185737	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4608	NC_014554	CTAA	2	8	1185770	1185777	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4609	NC_014554	GGT	2	6	1185799	1185804	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4610	NC_014554	TTTG	2	8	1185817	1185824	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4611	NC_014554	TGT	2	6	1185838	1185843	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4612	NC_014554	ATGA	2	8	1185845	1185852	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4613	NC_014554	TTG	2	6	1185853	1185858	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4614	NC_014554	TGAC	2	8	1185903	1185910	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4615	NC_014554	GT	3	6	1185928	1185933	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4616	NC_014554	TAG	2	6	1185997	1186002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4617	NC_014554	TAA	2	6	1186019	1186024	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4618	NC_014554	GTA	2	6	1186029	1186034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4619	NC_014554	GTC	2	6	1186085	1186090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4620	NC_014554	TTAG	2	8	1186094	1186101	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4621	NC_014554	CT	4	8	1186115	1186122	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4622	NC_014554	TTGC	2	8	1189128	1189135	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4623	NC_014554	GT	3	6	1189169	1189174	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4624	NC_014554	CAC	2	6	1189207	1189212	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4625	NC_014554	ATC	2	6	1189213	1189218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4626	NC_014554	TCA	2	6	1189329	1189334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4627	NC_014554	TCA	2	6	1189367	1189372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4628	NC_014554	AAG	2	6	1189468	1189473	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4629	NC_014554	CCT	2	6	1189700	1189705	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4630	NC_014554	ATTTG	2	10	1191325	1191334	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
4631	NC_014554	TCG	2	6	1191376	1191381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4633	NC_014554	GTT	2	6	1192452	1192457	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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