MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus casei str. Zhang chromosome

Total Repeats: 8681

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_014334	TA	3	6	443916	443921	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1502	NC_014334	AAG	2	6	443987	443992	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1503	NC_014334	GGT	2	6	443995	444000	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1504	NC_014334	AGG	2	6	444043	444048	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1505	NC_014334	AGCT	2	8	444166	444173	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1506	NC_014334	AGC	2	6	444221	444226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1507	NC_014334	TTG	2	6	444228	444233	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1508	NC_014334	AT	4	8	444278	444285	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1509	NC_014334	TTGA	2	8	444352	444359	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_014334	GTG	2	6	444367	444372	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_014334	CTC	2	6	447211	447216	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1512	NC_014334	ATTTGT	2	12	447230	447241	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1513	NC_014334	T	6	6	447269	447274	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1514	NC_014334	GTT	2	6	447284	447289	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_014334	ATC	2	6	447295	447300	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1516	NC_014334	CAA	2	6	447351	447356	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1517	NC_014334	GGT	2	6	447610	447615	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1518	NC_014334	ACA	2	6	447641	447646	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1519	NC_014334	AGT	2	6	447649	447654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1520	NC_014334	T	7	7	447664	447670	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1521	NC_014334	AAAT	2	8	447692	447699	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1522	NC_014334	GTT	2	6	447704	447709	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1523	NC_014334	GGA	3	9	447749	447757	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1524	NC_014334	AGC	2	6	448674	448679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1525	NC_014334	ATTT	2	8	448761	448768	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1526	NC_014334	CAT	2	6	449809	449814	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1528	NC_014334	GA	3	6	449841	449846	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1529	NC_014334	GTG	2	6	449906	449911	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1530	NC_014334	TTGG	2	8	450922	450929	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1531	NC_014334	ATT	2	6	450981	450986	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1532	NC_014334	TAT	2	6	452915	452920	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1533	NC_014334	AAG	2	6	452933	452938	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1534	NC_014334	TGTT	2	8	452959	452966	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1535	NC_014334	TC	3	6	453550	453555	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1536	NC_014334	GTT	2	6	453600	453605	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1537	NC_014334	GCG	2	6	453617	453622	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1538	NC_014334	AAGT	2	8	455899	455906	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1539	NC_014334	ACA	2	6	455940	455945	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1540	NC_014334	TTG	2	6	455955	455960	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1541	NC_014334	AGA	2	6	455975	455980	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1542	NC_014334	CCT	2	6	456460	456465	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1543	NC_014334	ATTGAA	2	12	456532	456543	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1544	NC_014334	TGC	2	6	456934	456939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1545	NC_014334	T	6	6	456940	456945	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1546	NC_014334	TCAT	2	8	456986	456993	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1547	NC_014334	A	6	6	457002	457007	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1548	NC_014334	CAT	2	6	457906	457911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1549	NC_014334	CCATC	2	10	458076	458085	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
1550	NC_014334	TGGCA	2	10	458106	458115	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1551	NC_014334	TGG	2	6	458223	458228	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1552	NC_014334	CCT	2	6	459654	459659	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1553	NC_014334	ATT	2	6	459726	459731	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1554	NC_014334	T	6	6	459828	459833	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1555	NC_014334	AAAG	2	8	459835	459842	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1556	NC_014334	TGT	2	6	459873	459878	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1557	NC_014334	T	6	6	460192	460197	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1558	NC_014334	T	7	7	461459	461465	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1559	NC_014334	GCC	2	6	461483	461488	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1560	NC_014334	GAA	2	6	461532	461537	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1561	NC_014334	A	6	6	462839	462844	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1562	NC_014334	TCC	2	6	463734	463739	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1563	NC_014334	ATG	2	6	463804	463809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1564	NC_014334	CATA	2	8	463851	463858	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1565	NC_014334	TG	3	6	463863	463868	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1566	NC_014334	A	6	6	463944	463949	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1567	NC_014334	TTTG	2	8	463967	463974	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1568	NC_014334	TG	3	6	463986	463991	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1569	NC_014334	AAG	2	6	464040	464045	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1570	NC_014334	CTAA	2	8	464089	464096	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1571	NC_014334	GTT	2	6	464142	464147	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1572	NC_014334	A	6	6	464158	464163	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1573	NC_014334	GTT	2	6	464274	464279	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1575	NC_014334	A	6	6	466085	466090	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1576	NC_014334	T	7	7	466122	466128	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1579	NC_014334	ACCTGA	2	12	468324	468335	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1581	NC_014334	TGTT	2	8	468416	468423	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1582	NC_014334	GAT	2	6	468467	468472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1583	NC_014334	TAGAA	2	10	469262	469271	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1584	NC_014334	AAAT	2	8	469274	469281	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1593	NC_014334	TGG	2	6	474598	474603	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1597	NC_014334	AAT	2	6	475080	475085	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1598	NC_014334	TGA	2	6	475177	475182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1602	NC_014334	A	6	6	477754	477759	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1603	NC_014334	T	7	7	477781	477787	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1605	NC_014334	TAT	2	6	481846	481851	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1606	NC_014334	GAG	2	6	481859	481864	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1607	NC_014334	A	7	7	481879	481885	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1608	NC_014334	GCAA	2	8	481932	481939	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1609	NC_014334	T	6	6	481945	481950	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1610	NC_014334	ATG	2	6	483934	483939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1614	NC_014334	TTA	2	6	484771	484776	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1615	NC_014334	GAG	2	6	484859	484864	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1616	NC_014334	TAA	2	6	489333	489338	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1618	NC_014334	AGC	2	6	490609	490614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1619	NC_014334	ATC	2	6	493034	493039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1622	NC_014334	GTT	2	6	493282	493287	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1623	NC_014334	ACG	2	6	495118	495123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1624	NC_014334	A	8	8	495138	495145	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1625	NC_014334	TTG	2	6	495149	495154	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1628	NC_014334	ACC	2	6	497092	497097	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1629	NC_014334	A	6	6	497109	497114	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1630	NC_014334	AG	3	6	497161	497166	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1631	NC_014334	TAT	2	6	498104	498109	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1634	NC_014334	GAG	2	6	498863	498868	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1635	NC_014334	TGG	2	6	498906	498911	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1637	NC_014334	TGC	2	6	498976	498981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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