MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus casei str. Zhang chromosome

Total Repeats: 8681

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_014334	TAT	2	6	291528	291533	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_014334	ACCAT	2	10	291716	291725	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
1003	NC_014334	TGA	2	6	291744	291749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_014334	TCT	2	6	291775	291780	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1005	NC_014334	AGATA	2	10	291783	291792	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_014334	T	7	7	294503	294509	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_014334	A	6	6	294591	294596	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_014334	GGA	2	6	294611	294616	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_014334	AAATT	2	10	296123	296132	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_014334	T	7	7	296159	296165	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_014334	T	7	7	296168	296174	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_014334	A	6	6	296186	296191	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_014334	ATGG	2	8	296318	296325	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_014334	CAT	2	6	296382	296387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1015	NC_014334	TTG	2	6	296469	296474	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_014334	CTG	2	6	296506	296511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1017	NC_014334	TAGA	2	8	296529	296536	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_014334	GGC	2	6	296577	296582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1019	NC_014334	T	6	6	296586	296591	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_014334	TGC	2	6	296619	296624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1021	NC_014334	TCG	2	6	296629	296634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1022	NC_014334	A	6	6	296646	296651	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_014334	ACG	2	6	296660	296665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1024	NC_014334	A	6	6	296666	296671	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_014334	TC	3	6	296714	296719	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1026	NC_014334	T	6	6	296752	296757	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_014334	G	6	6	296763	296768	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_014334	CAT	2	6	296847	296852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1029	NC_014334	TCC	2	6	297053	297058	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1030	NC_014334	CAC	2	6	297238	297243	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1031	NC_014334	T	6	6	297455	297460	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_014334	TAC	2	6	297474	297479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1033	NC_014334	CAG	2	6	297505	297510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1034	NC_014334	ATA	2	6	297711	297716	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_014334	GCA	2	6	297740	297745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1036	NC_014334	CGA	2	6	297808	297813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1037	NC_014334	A	6	6	297813	297818	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_014334	T	6	6	297838	297843	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_014334	AAC	2	6	297908	297913	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1040	NC_014334	A	6	6	297941	297946	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_014334	CCT	2	6	298147	298152	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1042	NC_014334	CTT	2	6	298153	298158	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1043	NC_014334	T	6	6	298235	298240	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_014334	AAG	2	6	298292	298297	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_014334	TTG	2	6	298301	298306	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_014334	AT	3	6	299720	299725	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_014334	GTT	2	6	299760	299765	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_014334	TTA	2	6	299803	299808	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_014334	CAA	2	6	299820	299825	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1050	NC_014334	CAA	2	6	299840	299845	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1051	NC_014334	A	6	6	299844	299849	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_014334	CTTG	2	8	303782	303789	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1053	NC_014334	GTTA	2	8	303795	303802	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_014334	ACAT	2	8	303813	303820	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1055	NC_014334	CCGG	2	8	303891	303898	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1056	NC_014334	ATA	2	6	303988	303993	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_014334	CGG	2	6	304017	304022	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1058	NC_014334	TTTA	2	8	305366	305373	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_014334	A	7	7	305373	305379	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_014334	TTGC	2	8	305397	305404	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1061	NC_014334	T	6	6	305415	305420	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_014334	TGCT	2	8	305431	305438	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1063	NC_014334	GTG	2	6	305439	305444	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_014334	ATG	2	6	305449	305454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_014334	GCT	2	6	306185	306190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1066	NC_014334	CAA	2	6	306242	306247	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1067	NC_014334	AAT	2	6	306304	306309	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_014334	TTGAA	2	10	306353	306362	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_014334	TTG	2	6	306386	306391	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_014334	TTG	2	6	306408	306413	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_014334	AGG	2	6	306431	306436	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_014334	TGA	2	6	308257	308262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_014334	GAT	2	6	308280	308285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_014334	GTT	2	6	308290	308295	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_014334	AAT	2	6	308328	308333	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_014334	ACG	2	6	308434	308439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1077	NC_014334	AGC	2	6	308444	308449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1078	NC_014334	ATGA	2	8	308489	308496	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_014334	GAT	2	6	308497	308502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_014334	TCA	2	6	308510	308515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1081	NC_014334	ATC	2	6	309563	309568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1082	NC_014334	GAA	2	6	309659	309664	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_014334	GCTT	2	8	310975	310982	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1084	NC_014334	AGCAT	2	10	311001	311010	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
1085	NC_014334	T	7	7	311247	311253	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_014334	TGT	2	6	311270	311275	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_014334	TAAAAA	2	12	311299	311310	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_014334	TGGT	2	8	311359	311366	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_014334	ATA	2	6	312103	312108	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_014334	AGG	2	6	312155	312160	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_014334	GAA	2	6	312163	312168	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_014334	AGC	2	6	313370	313375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1093	NC_014334	AGG	2	6	313394	313399	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_014334	GT	3	6	314611	314616	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_014334	GCA	2	6	314631	314636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1096	NC_014334	ATGA	2	8	314646	314653	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_014334	AGG	2	6	314655	314660	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_014334	TTTTG	2	10	320195	320204	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_014334	GAT	2	6	320209	320214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_014334	TCC	2	6	321037	321042	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1101	NC_014334	CCT	2	6	322438	322443	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1102	NC_014334	AAAAC	2	10	322454	322463	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
1103	NC_014334	ATG	2	6	322469	322474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_014334	AATT	2	8	322551	322558	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_014334	GAT	2	6	322571	322576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_014334	ATG	2	6	322597	322602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_014334	T	6	6	322611	322616	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_014334	A	6	6	322638	322643	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_014334	AT	3	6	322706	322711	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_014334	ATG	2	6	322755	322760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_014334	CA	3	6	323604	323609	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1112	NC_014334	TAA	2	6	323650	323655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_014334	GTTTA	2	10	323668	323677	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_014334	T	9	9	323719	323727	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_014334	AAAC	2	8	324655	324662	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1116	NC_014334	TTG	2	6	324677	324682	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_014334	ACC	2	6	324688	324693	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1118	NC_014334	TGG	2	6	324704	324709	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_014334	ACC	2	6	324757	324762	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1120	NC_014334	AATC	2	8	324850	324857	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1121	NC_014334	TCG	2	6	326176	326181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1122	NC_014334	AGA	2	6	326204	326209	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_014334	CCT	2	6	328515	328520	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1124	NC_014334	GC	3	6	328541	328546	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1125	NC_014334	GC	3	6	328661	328666	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1126	NC_014334	TCC	2	6	330387	330392	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1127	NC_014334	TTAGGT	2	12	330393	330404	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_014334	AGCC	2	8	330785	330792	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1129	NC_014334	ATG	2	6	333880	333885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_014334	AAC	2	6	333914	333919	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1131	NC_014334	ATA	2	6	333977	333982	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_014334	AAT	2	6	333988	333993	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_014334	GTT	2	6	334003	334008	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_014334	TGT	2	6	334033	334038	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_014334	GCA	2	6	334050	334055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1136	NC_014334	CAAA	2	8	334077	334084	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
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1408	NC_014334	TGC	2	6	419252	419257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1410	NC_014334	AGC	2	6	419336	419341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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