MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus casei str. Zhang chromosome

Total Repeats: 8681

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_014334	ATA	2	6	141659	141664	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
502	NC_014334	GTT	2	6	141677	141682	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
503	NC_014334	TTAG	2	8	141699	141706	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
504	NC_014334	TTA	2	6	141826	141831	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
505	NC_014334	AGC	2	6	141901	141906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
506	NC_014334	CAA	2	6	141926	141931	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
507	NC_014334	TCAA	2	8	142014	142021	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
508	NC_014334	TTA	2	6	142055	142060	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
509	NC_014334	TTA	2	6	142090	142095	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
510	NC_014334	GCC	2	6	142192	142197	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
511	NC_014334	ACC	2	6	142378	142383	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
512	NC_014334	A	6	6	142395	142400	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
513	NC_014334	AG	3	6	142447	142452	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
514	NC_014334	TAT	2	6	143390	143395	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
515	NC_014334	ACTAAC	2	12	143426	143437	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
516	NC_014334	AAC	2	6	143459	143464	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
517	NC_014334	ACAA	2	8	143503	143510	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
518	NC_014334	AGA	2	6	143549	143554	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
519	NC_014334	ATTGC	2	10	143565	143574	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
520	NC_014334	AAC	2	6	143601	143606	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
521	NC_014334	GAAG	2	8	143676	143683	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
522	NC_014334	GAA	2	6	143747	143752	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
523	NC_014334	TGTA	2	8	143848	143855	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
524	NC_014334	A	6	6	143945	143950	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
525	NC_014334	CAA	2	6	143995	144000	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
526	NC_014334	TCAT	2	8	144003	144010	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
527	NC_014334	ATC	2	6	144118	144123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
528	NC_014334	TGAC	2	8	144180	144187	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
529	NC_014334	TGT	2	6	144207	144212	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
530	NC_014334	ATT	2	6	145074	145079	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
531	NC_014334	GAG	2	6	145204	145209	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
532	NC_014334	TCC	2	6	146656	146661	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
533	NC_014334	T	6	6	146668	146673	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
534	NC_014334	TGGT	2	8	146676	146683	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
535	NC_014334	A	6	6	146706	146711	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
536	NC_014334	TCA	3	9	146716	146724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
537	NC_014334	GTC	2	6	146731	146736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
538	NC_014334	TTA	2	6	146754	146759	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
539	NC_014334	CATTCT	2	12	146775	146786	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
540	NC_014334	A	7	7	146810	146816	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
541	NC_014334	TGTT	2	8	146888	146895	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
542	NC_014334	CAG	2	6	146899	146904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
543	NC_014334	CAGA	2	8	146972	146979	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
544	NC_014334	GCT	2	6	147079	147084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
545	NC_014334	GGC	2	6	147104	147109	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
546	NC_014334	C	7	7	147946	147952	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
547	NC_014334	AACTTT	2	12	147953	147964	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
548	NC_014334	CAA	2	6	148041	148046	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
549	NC_014334	A	6	6	148045	148050	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
550	NC_014334	AAAT	2	8	148082	148089	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
551	NC_014334	CCT	2	6	149116	149121	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
552	NC_014334	TCGCAG	2	12	149131	149142	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
553	NC_014334	ATTA	2	8	150430	150437	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
554	NC_014334	TCG	2	6	150484	150489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
555	NC_014334	AGA	2	6	150546	150551	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
556	NC_014334	TTAA	2	8	150570	150577	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
557	NC_014334	AT	3	6	151006	151011	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
558	NC_014334	TAT	2	6	152118	152123	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
559	NC_014334	A	6	6	152183	152188	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
560	NC_014334	AAG	2	6	152201	152206	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
561	NC_014334	T	6	6	153892	153897	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
562	NC_014334	GATT	2	8	153906	153913	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
563	NC_014334	TCC	2	6	154220	154225	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
564	NC_014334	GTGAGC	2	12	154232	154243	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
565	NC_014334	TGA	2	6	154282	154287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
566	NC_014334	CGA	2	6	154305	154310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
567	NC_014334	CCT	2	6	154886	154891	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
568	NC_014334	AT	3	6	154906	154911	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
569	NC_014334	ACA	2	6	154916	154921	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
570	NC_014334	AT	3	6	154947	154952	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
571	NC_014334	GGT	2	6	154980	154985	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
572	NC_014334	TTTC	2	8	156422	156429	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
573	NC_014334	CTT	2	6	156942	156947	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
574	NC_014334	TGT	2	6	156960	156965	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
575	NC_014334	TCA	2	6	156970	156975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
576	NC_014334	A	8	8	157039	157046	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
577	NC_014334	AAG	2	6	158610	158615	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
578	NC_014334	CTT	2	6	158675	158680	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
579	NC_014334	GTA	2	6	159065	159070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
580	NC_014334	A	6	6	159070	159075	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
581	NC_014334	TGA	2	6	159088	159093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
582	NC_014334	ATT	2	6	159100	159105	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
583	NC_014334	A	6	6	159149	159154	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
584	NC_014334	TA	3	6	159165	159170	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
585	NC_014334	AGG	2	6	159175	159180	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
586	NC_014334	TGT	2	6	159565	159570	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
587	NC_014334	CTG	2	6	159572	159577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
588	NC_014334	T	7	7	159580	159586	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
589	NC_014334	A	6	6	159603	159608	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
590	NC_014334	CAA	2	6	159609	159614	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
591	NC_014334	C	6	6	162245	162250	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
592	NC_014334	AAT	2	6	165397	165402	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
593	NC_014334	T	6	6	165450	165455	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
594	NC_014334	G	6	6	165456	165461	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
595	NC_014334	AAT	2	6	166387	166392	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
596	NC_014334	TC	3	6	167330	167335	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
597	NC_014334	T	6	6	167383	167388	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
598	NC_014334	GGT	2	6	167400	167405	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
599	NC_014334	ATG	2	6	167484	167489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
600	NC_014334	CTT	3	9	167546	167554	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
601	NC_014334	AGC	2	6	167558	167563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
602	NC_014334	TAC	2	6	167588	167593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
603	NC_014334	A	7	7	167597	167603	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
604	NC_014334	TTTC	2	8	167906	167913	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
605	NC_014334	A	6	6	167927	167932	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
606	NC_014334	TTTA	2	8	167954	167961	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
607	NC_014334	TCTTT	2	10	168076	168085	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
608	NC_014334	ATG	2	6	168106	168111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
609	NC_014334	TTCC	2	8	168229	168236	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
610	NC_014334	AGA	2	6	168248	168253	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
611	NC_014334	AGCA	2	8	168290	168297	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
612	NC_014334	A	6	6	168351	168356	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
613	NC_014334	ATT	2	6	168370	168375	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
614	NC_014334	AGTA	2	8	169494	169501	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
615	NC_014334	AAC	2	6	170022	170027	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
616	NC_014334	T	7	7	170074	170080	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
617	NC_014334	GTGATG	2	12	170799	170810	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
618	NC_014334	ATT	2	6	170882	170887	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
619	NC_014334	A	6	6	170888	170893	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
620	NC_014334	TG	3	6	170988	170993	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
621	NC_014334	T	6	6	171011	171016	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
622	NC_014334	T	6	6	171018	171023	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
623	NC_014334	A	6	6	171042	171047	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
624	NC_014334	TA	3	6	171069	171074	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
625	NC_014334	AGC	2	6	171111	171116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
626	NC_014334	T	8	8	171117	171124	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
627	NC_014334	AGC	2	6	174378	174383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
628	NC_014334	TCA	2	6	174416	174421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
629	NC_014334	ACA	2	6	174425	174430	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
630	NC_014334	ACAT	2	8	175279	175286	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
631	NC_014334	GAATAA	2	12	176443	176454	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
632	NC_014334	GAAT	2	8	176518	176525	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
633	NC_014334	AAG	2	6	176639	176644	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
634	NC_014334	GAGGC	2	10	178477	178486	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
635	NC_014334	CAC	2	6	179478	179483	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
636	NC_014334	A	7	7	179493	179499	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
637	NC_014334	T	6	6	179516	179521	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
638	NC_014334	TCC	2	6	179887	179892	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
639	NC_014334	CAG	2	6	179933	179938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
640	NC_014334	TTA	2	6	179949	179954	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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