MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus casei str. Zhang chromosome

Total Repeats: 8681

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8501	NC_014334	ACT	2	6	2813009	2813014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8502	NC_014334	AGT	2	6	2813030	2813035	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8503	NC_014334	GAAT	2	8	2813049	2813056	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8504	NC_014334	GCC	2	6	2813110	2813115	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8505	NC_014334	CAA	2	6	2813116	2813121	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8506	NC_014334	AAT	2	6	2813138	2813143	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8507	NC_014334	T	7	7	2813152	2813158	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8508	NC_014334	CAA	2	6	2813177	2813182	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8509	NC_014334	CCT	2	6	2813254	2813259	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8510	NC_014334	GCA	2	6	2813260	2813265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8511	NC_014334	GAC	2	6	2813278	2813283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8512	NC_014334	A	7	7	2813301	2813307	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8513	NC_014334	A	6	6	2813344	2813349	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8514	NC_014334	AGG	2	6	2813375	2813380	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8515	NC_014334	ACTGG	2	10	2814617	2814626	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
8516	NC_014334	TTAC	2	8	2816115	2816122	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8517	NC_014334	ATT	2	6	2816153	2816158	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8518	NC_014334	TTA	2	6	2816163	2816168	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8519	NC_014334	ATTT	2	8	2816181	2816188	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8520	NC_014334	GGC	2	6	2816260	2816265	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8521	NC_014334	GGCT	2	8	2816271	2816278	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
8522	NC_014334	TTA	2	6	2816304	2816309	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8523	NC_014334	GAA	2	6	2816331	2816336	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8524	NC_014334	GCTT	2	8	2817647	2817654	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
8525	NC_014334	AGCAT	2	10	2817673	2817682	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
8526	NC_014334	ATT	2	6	2817741	2817746	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8527	NC_014334	TTA	2	6	2817774	2817779	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8528	NC_014334	CAT	2	6	2819927	2819932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8529	NC_014334	TGT	2	6	2819983	2819988	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8530	NC_014334	TACA	2	8	2820006	2820013	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8531	NC_014334	CTC	2	6	2820062	2820067	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8532	NC_014334	CA	3	6	2820132	2820137	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8533	NC_014334	TTC	3	9	2821039	2821047	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8534	NC_014334	A	6	6	2821087	2821092	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8535	NC_014334	GAA	2	6	2821107	2821112	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8536	NC_014334	GTC	2	6	2821235	2821240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8537	NC_014334	T	6	6	2821241	2821246	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8538	NC_014334	CAA	2	6	2821271	2821276	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8539	NC_014334	ATA	2	6	2821866	2821871	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8540	NC_014334	AATT	2	8	2822443	2822450	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8541	NC_014334	AAC	2	6	2823874	2823879	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8542	NC_014334	TGT	2	6	2823881	2823886	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8543	NC_014334	CCT	2	6	2824833	2824838	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8544	NC_014334	TAAT	2	8	2824852	2824859	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8545	NC_014334	AT	3	6	2824923	2824928	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8546	NC_014334	TCC	2	6	2826249	2826254	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8547	NC_014334	TAT	2	6	2826315	2826320	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8548	NC_014334	A	6	6	2826333	2826338	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8549	NC_014334	AAC	2	6	2826340	2826345	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8550	NC_014334	GAA	2	6	2826365	2826370	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8551	NC_014334	AAT	2	6	2826398	2826403	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8552	NC_014334	T	6	6	2826424	2826429	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8553	NC_014334	AAGC	2	8	2826489	2826496	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
8554	NC_014334	ACA	2	6	2826596	2826601	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8555	NC_014334	ATT	2	6	2826625	2826630	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8556	NC_014334	TCT	2	6	2826750	2826755	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8557	NC_014334	CAA	2	6	2826762	2826767	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8558	NC_014334	TCT	2	6	2826921	2826926	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8559	NC_014334	TCAC	2	8	2826941	2826948	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
8560	NC_014334	ATC	2	6	2826968	2826973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8561	NC_014334	CGG	2	6	2827143	2827148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8562	NC_014334	A	6	6	2827180	2827185	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8563	NC_014334	CTG	2	6	2827191	2827196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8564	NC_014334	AGA	2	6	2827222	2827227	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8565	NC_014334	ATATCG	2	12	2827229	2827240	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
8566	NC_014334	CAAG	2	8	2827262	2827269	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
8567	NC_014334	TTA	2	6	2827299	2827304	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8568	NC_014334	AG	3	6	2827528	2827533	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8569	NC_014334	GGT	2	6	2827684	2827689	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8570	NC_014334	ACC	2	6	2827748	2827753	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8571	NC_014334	TGC	2	6	2827756	2827761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8572	NC_014334	TGTC	2	8	2827765	2827772	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
8573	NC_014334	ATA	2	6	2827791	2827796	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8574	NC_014334	T	6	6	2827834	2827839	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8575	NC_014334	CTGC	2	8	2827859	2827866	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
8576	NC_014334	TCA	2	6	2827876	2827881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8577	NC_014334	TCG	2	6	2827900	2827905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8578	NC_014334	GTT	2	6	2827942	2827947	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8579	NC_014334	A	7	7	2828083	2828089	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8580	NC_014334	CGC	2	6	2828099	2828104	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8581	NC_014334	AGC	2	6	2829162	2829167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8582	NC_014334	CAG	2	6	2829172	2829177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8583	NC_014334	CCG	2	6	2829193	2829198	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8584	NC_014334	CAC	2	6	2830217	2830222	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8585	NC_014334	GCA	2	6	2830260	2830265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8586	NC_014334	ACCG	2	8	2835033	2835040	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
8587	NC_014334	AC	3	6	2836876	2836881	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8588	NC_014334	TAT	2	6	2836902	2836907	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8589	NC_014334	CTT	2	6	2836939	2836944	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8590	NC_014334	T	6	6	2837079	2837084	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8591	NC_014334	CAT	2	6	2837090	2837095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8592	NC_014334	TGT	2	6	2837117	2837122	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8593	NC_014334	CTA	2	6	2837126	2837131	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8594	NC_014334	T	6	6	2837226	2837231	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8595	NC_014334	TTTC	2	8	2837987	2837994	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
8596	NC_014334	T	7	7	2838034	2838040	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8597	NC_014334	AGC	2	6	2838079	2838084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8598	NC_014334	TGA	2	6	2838093	2838098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8599	NC_014334	AGT	2	6	2838169	2838174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8600	NC_014334	GGA	2	6	2838263	2838268	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8601	NC_014334	T	7	7	2839103	2839109	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8602	NC_014334	CAG	2	6	2839122	2839127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8603	NC_014334	ATA	3	9	2839172	2839180	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8604	NC_014334	AATTT	2	10	2839202	2839211	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
8605	NC_014334	AAT	2	6	2839356	2839361	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8606	NC_014334	ACA	2	6	2839365	2839370	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8607	NC_014334	CTG	2	6	2839380	2839385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8608	NC_014334	TC	3	6	2839395	2839400	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8609	NC_014334	A	7	7	2839920	2839926	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8610	NC_014334	TTA	2	6	2839927	2839932	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8611	NC_014334	TA	3	6	2839938	2839943	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8612	NC_014334	CTT	2	6	2840003	2840008	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8613	NC_014334	ATTTT	2	10	2840045	2840054	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
8614	NC_014334	GAT	2	6	2840063	2840068	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8615	NC_014334	ACT	2	6	2840096	2840101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8616	NC_014334	TTC	2	6	2840103	2840108	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8617	NC_014334	CCCT	2	8	2840132	2840139	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
8618	NC_014334	GAC	2	6	2840200	2840205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8619	NC_014334	CAA	2	6	2840379	2840384	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8620	NC_014334	AGG	2	6	2840406	2840411	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8621	NC_014334	GTA	2	6	2843362	2843367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8622	NC_014334	TTTCTA	2	12	2843374	2843385	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8623	NC_014334	A	7	7	2843409	2843415	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8624	NC_014334	T	6	6	2843441	2843446	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8625	NC_014334	TACTGC	2	12	2843456	2843467	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
8626	NC_014334	TCC	2	6	2849462	2849467	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8627	NC_014334	ACG	2	6	2849496	2849501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8628	NC_014334	GAT	2	6	2849524	2849529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8629	NC_014334	TA	3	6	2849569	2849574	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8630	NC_014334	A	7	7	2849587	2849593	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8631	NC_014334	AAT	2	6	2849622	2849627	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8673	NC_014334	T	6	6	2861344	2861349	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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