MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus casei str. Zhang chromosome

Total Repeats: 8681

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8001	NC_014334	CG	3	6	2614857	2614862	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8002	NC_014334	TATTTT	2	12	2614929	2614940	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8003	NC_014334	AAC	2	6	2614969	2614974	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8004	NC_014334	TGC	2	6	2614988	2614993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8005	NC_014334	A	6	6	2615050	2615055	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8006	NC_014334	AGC	2	6	2615069	2615074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8007	NC_014334	TTC	2	6	2615082	2615087	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8008	NC_014334	CGA	2	6	2615232	2615237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8009	NC_014334	CA	3	6	2615250	2615255	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8010	NC_014334	CGT	2	6	2615264	2615269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8011	NC_014334	CATT	2	8	2615276	2615283	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8012	NC_014334	GAA	2	6	2615289	2615294	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8013	NC_014334	TCAT	2	8	2615416	2615423	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8014	NC_014334	T	6	6	2615614	2615619	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8015	NC_014334	CTT	2	6	2615633	2615638	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8016	NC_014334	AGC	2	6	2615641	2615646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8017	NC_014334	TTG	2	6	2617186	2617191	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8018	NC_014334	TGGT	2	8	2621476	2621483	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8019	NC_014334	TCA	2	6	2621521	2621526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8020	NC_014334	AAAT	2	8	2621538	2621545	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8021	NC_014334	TCC	2	6	2623784	2623789	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8022	NC_014334	AGC	2	6	2623894	2623899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8023	NC_014334	AG	3	6	2623922	2623927	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8024	NC_014334	AAG	2	6	2623984	2623989	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8025	NC_014334	AAT	2	6	2624021	2624026	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8026	NC_014334	CTC	2	6	2624041	2624046	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8027	NC_014334	TTG	2	6	2627159	2627164	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8028	NC_014334	TGT	2	6	2627362	2627367	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8029	NC_014334	GAT	2	6	2630508	2630513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8030	NC_014334	ATC	2	6	2630519	2630524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8031	NC_014334	TCAAA	2	10	2633640	2633649	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
8032	NC_014334	TC	4	8	2633784	2633791	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8033	NC_014334	CT	4	8	2633829	2633836	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8034	NC_014334	ACTTCT	2	12	2633867	2633878	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8035	NC_014334	GCC	2	6	2633978	2633983	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8036	NC_014334	TTC	2	6	2634050	2634055	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8037	NC_014334	A	6	6	2634072	2634077	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8038	NC_014334	T	6	6	2634094	2634099	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8039	NC_014334	TCC	2	6	2635136	2635141	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8040	NC_014334	AAG	2	6	2635826	2635831	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8041	NC_014334	A	6	6	2637362	2637367	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8042	NC_014334	GC	3	6	2637393	2637398	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8043	NC_014334	TAA	2	6	2637442	2637447	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8044	NC_014334	CAA	2	6	2637458	2637463	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8045	NC_014334	A	6	6	2638253	2638258	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8046	NC_014334	GCC	2	6	2638259	2638264	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8047	NC_014334	TGG	2	6	2638884	2638889	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8048	NC_014334	CA	3	6	2638929	2638934	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8049	NC_014334	TGC	2	6	2639109	2639114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8050	NC_014334	CATT	2	8	2639233	2639240	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8051	NC_014334	T	6	6	2639289	2639294	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8052	NC_014334	GAA	2	6	2639317	2639322	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8053	NC_014334	GCTT	2	8	2640633	2640640	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
8054	NC_014334	AGCAT	2	10	2640659	2640668	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
8055	NC_014334	ATT	2	6	2640727	2640732	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8056	NC_014334	ATC	2	6	2640895	2640900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8057	NC_014334	T	6	6	2641018	2641023	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8058	NC_014334	T	6	6	2643483	2643488	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8059	NC_014334	TCC	2	6	2644894	2644899	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8060	NC_014334	GC	3	6	2644937	2644942	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8061	NC_014334	CT	3	6	2644952	2644957	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8062	NC_014334	AAC	2	6	2644961	2644966	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8063	NC_014334	TGC	2	6	2644972	2644977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8064	NC_014334	CCT	2	6	2647369	2647374	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8065	NC_014334	ATAGT	2	10	2647398	2647407	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
8066	NC_014334	TTA	2	6	2647564	2647569	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8067	NC_014334	AAT	2	6	2647589	2647594	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8068	NC_014334	GAA	2	6	2647630	2647635	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8069	NC_014334	TCT	2	6	2647664	2647669	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8070	NC_014334	TAT	2	6	2648911	2648916	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8071	NC_014334	ATA	2	6	2648973	2648978	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8072	NC_014334	T	6	6	2648980	2648985	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8073	NC_014334	A	7	7	2648988	2648994	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8074	NC_014334	AAGC	2	8	2649007	2649014	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
8075	NC_014334	AAC	2	6	2649039	2649044	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8076	NC_014334	CCT	2	6	2652317	2652322	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8077	NC_014334	A	6	6	2652354	2652359	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8078	NC_014334	CT	3	6	2652388	2652393	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8079	NC_014334	AGG	2	6	2652455	2652460	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8080	NC_014334	AACA	2	8	2654269	2654276	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
8081	NC_014334	CAA	2	6	2654285	2654290	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8082	NC_014334	GTA	2	6	2654349	2654354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8083	NC_014334	ATC	2	6	2655054	2655059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8084	NC_014334	CAA	2	6	2655065	2655070	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8085	NC_014334	CTTTC	2	10	2655072	2655081	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
8086	NC_014334	GGT	2	6	2655278	2655283	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8087	NC_014334	ATG	2	6	2655394	2655399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8088	NC_014334	ATC	2	6	2655423	2655428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8089	NC_014334	TGA	2	6	2655659	2655664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8090	NC_014334	CAT	2	6	2655707	2655712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8091	NC_014334	TAA	2	6	2655722	2655727	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8092	NC_014334	TTAA	2	8	2655743	2655750	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8093	NC_014334	G	6	6	2656078	2656083	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
8094	NC_014334	GTC	2	6	2657362	2657367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8095	NC_014334	AGC	2	6	2658321	2658326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8096	NC_014334	TGA	2	6	2658335	2658340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8097	NC_014334	TTTG	2	8	2658347	2658354	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
8098	NC_014334	AGG	2	6	2658410	2658415	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8099	NC_014334	GTT	2	6	2661243	2661248	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8100	NC_014334	AGT	2	6	2661270	2661275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8101	NC_014334	CAA	2	6	2661298	2661303	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8102	NC_014334	ATT	2	6	2661358	2661363	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8103	NC_014334	TCC	2	6	2666935	2666940	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8104	NC_014334	TAT	2	6	2666941	2666946	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8105	NC_014334	T	7	7	2667068	2667074	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8106	NC_014334	AAGT	2	8	2667080	2667087	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8107	NC_014334	ACA	2	6	2667096	2667101	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8108	NC_014334	C	6	6	2669319	2669324	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
8109	NC_014334	ACA	2	6	2669369	2669374	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8110	NC_014334	CAA	2	6	2669451	2669456	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8111	NC_014334	TTTA	2	8	2669509	2669516	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8112	NC_014334	A	7	7	2669560	2669566	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8113	NC_014334	A	6	6	2669609	2669614	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8114	NC_014334	T	6	6	2669644	2669649	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8115	NC_014334	CTG	2	6	2669660	2669665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8116	NC_014334	TGAA	2	8	2669682	2669689	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8117	NC_014334	TGC	2	6	2669698	2669703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8118	NC_014334	T	6	6	2669774	2669779	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8119	NC_014334	AAATT	2	10	2669781	2669790	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
8120	NC_014334	ATT	2	6	2670505	2670510	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8121	NC_014334	CCT	2	6	2672168	2672173	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8122	NC_014334	TC	3	6	2675985	2675990	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8123	NC_014334	GA	3	6	2676024	2676029	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8124	NC_014334	A	6	6	2676063	2676068	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8125	NC_014334	AAC	2	6	2676089	2676094	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8126	NC_014334	GCTT	2	8	2676216	2676223	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
8127	NC_014334	ACTG	3	12	2677005	2677016	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8128	NC_014334	GTT	2	6	2677018	2677023	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8129	NC_014334	CGC	2	6	2677099	2677104	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8130	NC_014334	GGC	2	6	2678004	2678009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8131	NC_014334	T	6	6	2678010	2678015	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8132	NC_014334	GCG	2	6	2678021	2678026	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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