MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus casei str. Zhang chromosome

Total Repeats: 8681

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_014334	GT	3	6	1842226	1842231	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5502	NC_014334	TCA	2	6	1845881	1845886	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5503	NC_014334	CATTT	2	10	1845906	1845915	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
5504	NC_014334	ATC	2	6	1845931	1845936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5505	NC_014334	TTAC	2	8	1846370	1846377	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5506	NC_014334	CATT	2	8	1846431	1846438	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5507	NC_014334	CTT	2	6	1847292	1847297	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5508	NC_014334	ACC	2	6	1848263	1848268	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5509	NC_014334	GCA	2	6	1848302	1848307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5510	NC_014334	CTC	2	6	1851780	1851785	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5511	NC_014334	TTA	2	6	1851812	1851817	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5512	NC_014334	TTA	2	6	1851825	1851830	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5513	NC_014334	TATT	2	8	1851841	1851848	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5514	NC_014334	T	6	6	1851881	1851886	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5515	NC_014334	TAACCT	2	12	1851983	1851994	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5516	NC_014334	CAC	2	6	1853882	1853887	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5517	NC_014334	CTTTCA	2	12	1853998	1854009	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5518	NC_014334	A	10	10	1854009	1854018	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5519	NC_014334	ACGATT	2	12	1854101	1854112	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
5520	NC_014334	GA	4	8	1855749	1855756	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5521	NC_014334	TTA	2	6	1855772	1855777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5522	NC_014334	AAC	2	6	1855792	1855797	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5523	NC_014334	GTT	2	6	1855817	1855822	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5524	NC_014334	T	6	6	1855840	1855845	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5525	NC_014334	CTA	2	6	1855866	1855871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5526	NC_014334	AAG	2	6	1855879	1855884	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5527	NC_014334	TGA	2	6	1855898	1855903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5528	NC_014334	TAC	3	9	1855906	1855914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5529	NC_014334	CTG	2	6	1855953	1855958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5530	NC_014334	TCG	2	6	1855978	1855983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5531	NC_014334	TTTA	2	8	1856035	1856042	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5532	NC_014334	CCA	2	6	1856100	1856105	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5533	NC_014334	CTA	2	6	1856157	1856162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5534	NC_014334	TAT	2	6	1856225	1856230	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5535	NC_014334	TCG	2	6	1856237	1856242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5536	NC_014334	TTA	2	6	1856308	1856313	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5537	NC_014334	TAA	2	6	1856329	1856334	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5538	NC_014334	AT	4	8	1856339	1856346	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5539	NC_014334	TGCC	2	8	1856772	1856779	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5540	NC_014334	CTT	2	6	1856863	1856868	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5541	NC_014334	ATT	2	6	1856923	1856928	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5542	NC_014334	T	6	6	1856927	1856932	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5543	NC_014334	TCA	2	6	1856948	1856953	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5544	NC_014334	TAGT	2	8	1856982	1856989	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5545	NC_014334	TGC	2	6	1857014	1857019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5546	NC_014334	TTCTC	2	10	1857029	1857038	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
5547	NC_014334	TC	3	6	1857821	1857826	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5548	NC_014334	AAT	2	6	1857858	1857863	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5549	NC_014334	TGC	2	6	1857880	1857885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5550	NC_014334	AGA	2	6	1857893	1857898	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5551	NC_014334	TTAT	2	8	1857933	1857940	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5552	NC_014334	GAA	2	6	1857950	1857955	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5553	NC_014334	ATTC	2	8	1858014	1858021	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5554	NC_014334	GA	3	6	1858034	1858039	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5555	NC_014334	TCA	2	6	1858101	1858106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5556	NC_014334	TCC	2	6	1859615	1859620	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5557	NC_014334	A	7	7	1859642	1859648	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5558	NC_014334	CTAAA	2	10	1859709	1859718	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
5559	NC_014334	AAC	2	6	1859792	1859797	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5560	NC_014334	CTT	2	6	1859806	1859811	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5561	NC_014334	TCACC	2	10	1859883	1859892	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
5562	NC_014334	TGA	2	6	1859900	1859905	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5563	NC_014334	GGACAA	2	12	1859928	1859939	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
5564	NC_014334	A	6	6	1859941	1859946	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5565	NC_014334	CTT	2	6	1860209	1860214	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5566	NC_014334	TTG	2	6	1860374	1860379	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5569	NC_014334	AAG	2	6	1860476	1860481	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5572	NC_014334	GCA	2	6	1860559	1860564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5573	NC_014334	TCGG	2	8	1860570	1860577	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5574	NC_014334	GCCAAA	2	12	1860629	1860640	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
5575	NC_014334	AAACC	2	10	1860650	1860659	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
5576	NC_014334	CA	3	6	1860669	1860674	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5577	NC_014334	T	6	6	1860870	1860875	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5578	NC_014334	CTT	2	6	1860928	1860933	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5579	NC_014334	GTT	2	6	1860997	1861002	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5580	NC_014334	A	6	6	1861038	1861043	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5581	NC_014334	TCT	2	6	1861064	1861069	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5582	NC_014334	TAT	2	6	1861104	1861109	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5583	NC_014334	GAT	2	6	1861138	1861143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5585	NC_014334	ATA	2	6	1861331	1861336	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5586	NC_014334	GT	3	6	1861340	1861345	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5587	NC_014334	TACCA	2	10	1861369	1861378	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
5588	NC_014334	GCG	2	6	1861385	1861390	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5589	NC_014334	CGC	2	6	1861417	1861422	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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5591	NC_014334	GC	3	6	1861516	1861521	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5592	NC_014334	TCA	2	6	1861590	1861595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5593	NC_014334	GTT	2	6	1861615	1861620	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5594	NC_014334	AAGC	2	8	1861621	1861628	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5595	NC_014334	CAT	2	6	1861713	1861718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5598	NC_014334	CAA	2	6	1861857	1861862	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5599	NC_014334	GATT	2	8	1861900	1861907	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5600	NC_014334	ATC	2	6	1861999	1862004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5601	NC_014334	AAAAC	2	10	1863519	1863528	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
5602	NC_014334	CAAC	2	8	1863804	1863811	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5603	NC_014334	CAA	2	6	1863875	1863880	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5604	NC_014334	GTT	2	6	1865795	1865800	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5605	NC_014334	ACA	2	6	1866829	1866834	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5606	NC_014334	A	7	7	1866838	1866844	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5610	NC_014334	CAAA	2	8	1867623	1867630	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5611	NC_014334	GCA	2	6	1869132	1869137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5612	NC_014334	TTTAC	2	10	1869160	1869169	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
5613	NC_014334	CG	3	6	1869170	1869175	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5614	NC_014334	GTT	2	6	1869284	1869289	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5615	NC_014334	T	6	6	1869399	1869404	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5617	NC_014334	AGA	2	6	1872282	1872287	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5618	NC_014334	CTTT	2	8	1872613	1872620	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5619	NC_014334	TAT	2	6	1872652	1872657	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5620	NC_014334	GGA	2	6	1872666	1872671	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5621	NC_014334	ATT	2	6	1874534	1874539	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5622	NC_014334	A	7	7	1874545	1874551	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5623	NC_014334	CGC	2	6	1875479	1875484	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5624	NC_014334	A	6	6	1876024	1876029	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5625	NC_014334	AAT	2	6	1876050	1876055	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5626	NC_014334	AAT	2	6	1878429	1878434	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5627	NC_014334	GCG	2	6	1878463	1878468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5628	NC_014334	ACC	2	6	1878494	1878499	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5629	NC_014334	GAG	2	6	1878540	1878545	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5631	NC_014334	ACG	2	6	1879339	1879344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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