MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus casei str. Zhang chromosome

Total Repeats: 8681

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_014334	AAG	2	6	1672942	1672947	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5002	NC_014334	AATT	2	8	1673069	1673076	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5003	NC_014334	AATG	2	8	1673112	1673119	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5004	NC_014334	TTGT	2	8	1673128	1673135	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5005	NC_014334	A	6	6	1673143	1673148	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5006	NC_014334	ACTG	2	8	1673214	1673221	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5007	NC_014334	ACT	2	6	1674226	1674231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5008	NC_014334	AAGG	2	8	1674262	1674269	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5009	NC_014334	AAT	2	6	1674378	1674383	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5010	NC_014334	TCC	2	6	1676957	1676962	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5011	NC_014334	AGC	2	6	1677934	1677939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5012	NC_014334	TG	3	6	1677951	1677956	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5013	NC_014334	TTG	2	6	1677991	1677996	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5014	NC_014334	CCA	2	6	1678496	1678501	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5015	NC_014334	TTG	2	6	1678505	1678510	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5016	NC_014334	AGTC	2	8	1678517	1678524	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5017	NC_014334	TCC	2	6	1680343	1680348	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5018	NC_014334	ATG	3	9	1680353	1680361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5019	NC_014334	A	6	6	1680367	1680372	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5020	NC_014334	TC	3	6	1680380	1680385	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5021	NC_014334	GC	3	6	1680464	1680469	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5022	NC_014334	CGA	2	6	1680565	1680570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5023	NC_014334	TCA	2	6	1680676	1680681	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5024	NC_014334	GAC	2	6	1680684	1680689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5025	NC_014334	TGA	2	6	1680704	1680709	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5026	NC_014334	A	6	6	1680711	1680716	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5027	NC_014334	AAG	2	6	1680779	1680784	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5028	NC_014334	TCA	2	6	1681409	1681414	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5029	NC_014334	AAG	2	6	1681419	1681424	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5030	NC_014334	T	6	6	1681447	1681452	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5031	NC_014334	AATCG	2	10	1681480	1681489	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
5032	NC_014334	AAT	2	6	1681688	1681693	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5033	NC_014334	A	6	6	1684479	1684484	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5034	NC_014334	TAC	2	6	1685270	1685275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5035	NC_014334	GC	3	6	1685337	1685342	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5036	NC_014334	GCTC	2	8	1685892	1685899	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5037	NC_014334	GTATA	2	10	1685934	1685943	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
5038	NC_014334	T	6	6	1685986	1685991	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5039	NC_014334	CAA	2	6	1686040	1686045	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5040	NC_014334	AATA	2	8	1686064	1686071	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5041	NC_014334	TAA	2	6	1686082	1686087	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5042	NC_014334	TCCT	2	8	1686885	1686892	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5043	NC_014334	GGT	2	6	1686934	1686939	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5044	NC_014334	T	6	6	1687510	1687515	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5045	NC_014334	ATT	2	6	1687559	1687564	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5046	NC_014334	TGC	2	6	1690464	1690469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5047	NC_014334	TTG	2	6	1690499	1690504	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5048	NC_014334	TTAT	2	8	1690540	1690547	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5049	NC_014334	AGA	2	6	1690549	1690554	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5050	NC_014334	CTTC	2	8	1690626	1690633	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5051	NC_014334	AGT	2	6	1692478	1692483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5052	NC_014334	AGC	2	6	1692546	1692551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5053	NC_014334	T	6	6	1692564	1692569	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5054	NC_014334	CCTT	2	8	1693195	1693202	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5055	NC_014334	T	6	6	1693232	1693237	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5056	NC_014334	T	6	6	1693248	1693253	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5057	NC_014334	ATCAT	2	10	1693254	1693263	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
5058	NC_014334	AT	3	6	1693276	1693281	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5059	NC_014334	ATC	2	6	1693311	1693316	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5060	NC_014334	TGA	2	6	1693324	1693329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5061	NC_014334	AGCC	2	8	1696157	1696164	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5062	NC_014334	ATTC	2	8	1696178	1696185	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5063	NC_014334	CCT	2	6	1697434	1697439	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5064	NC_014334	TGG	2	6	1697451	1697456	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5065	NC_014334	GTCT	2	8	1697474	1697481	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5066	NC_014334	T	6	6	1697481	1697486	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5067	NC_014334	CCAG	2	8	1697571	1697578	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5068	NC_014334	CTT	2	6	1697630	1697635	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5069	NC_014334	CTTT	2	8	1707634	1707641	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5070	NC_014334	TAA	2	6	1707712	1707717	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5071	NC_014334	TCGT	2	8	1707718	1707725	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5072	NC_014334	TCGCCA	2	12	1707815	1707826	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
5073	NC_014334	GCT	2	6	1707830	1707835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5074	NC_014334	A	7	7	1707846	1707852	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5075	NC_014334	TCA	2	6	1707877	1707882	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5076	NC_014334	GTT	2	6	1707890	1707895	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5077	NC_014334	A	7	7	1708514	1708520	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5078	NC_014334	CCT	2	6	1708522	1708527	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5079	NC_014334	AAG	2	6	1708546	1708551	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5080	NC_014334	TTG	2	6	1708662	1708667	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5081	NC_014334	ACC	2	6	1710174	1710179	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5082	NC_014334	ATA	2	6	1710226	1710231	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5083	NC_014334	CAGT	2	8	1710258	1710265	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5084	NC_014334	ATCAAA	2	12	1710371	1710382	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5085	NC_014334	A	7	7	1710391	1710397	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5086	NC_014334	T	7	7	1712476	1712482	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5087	NC_014334	TG	3	6	1712493	1712498	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5088	NC_014334	T	6	6	1712537	1712542	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5089	NC_014334	CCTCA	2	10	1712782	1712791	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
5090	NC_014334	TAA	2	6	1712794	1712799	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5091	NC_014334	TGCT	2	8	1712835	1712842	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5092	NC_014334	T	6	6	1712946	1712951	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5093	NC_014334	ATT	3	9	1715275	1715283	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5094	NC_014334	TAA	2	6	1715302	1715307	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5095	NC_014334	GA	3	6	1715318	1715323	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5096	NC_014334	GAA	2	6	1715637	1715642	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5097	NC_014334	TAA	2	6	1715694	1715699	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5098	NC_014334	CA	3	6	1715703	1715708	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5099	NC_014334	TG	3	6	1715739	1715744	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5100	NC_014334	TTCC	2	8	1717353	1717360	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5101	NC_014334	AAC	2	6	1717380	1717385	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5102	NC_014334	A	8	8	1718779	1718786	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5103	NC_014334	ATC	2	6	1718793	1718798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5104	NC_014334	TTCG	2	8	1718804	1718811	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5105	NC_014334	ATT	2	6	1718812	1718817	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5106	NC_014334	CAG	2	6	1720025	1720030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5107	NC_014334	TTA	2	6	1720061	1720066	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5108	NC_014334	AAG	2	6	1720074	1720079	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5109	NC_014334	CAA	2	6	1720617	1720622	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5110	NC_014334	TTGTTT	2	12	1720640	1720651	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5111	NC_014334	TAT	2	6	1721777	1721782	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5112	NC_014334	GC	3	6	1721799	1721804	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5113	NC_014334	AGCC	2	8	1721854	1721861	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5114	NC_014334	TG	3	6	1721865	1721870	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5115	NC_014334	GCA	2	6	1721912	1721917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5116	NC_014334	CT	3	6	1722802	1722807	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5117	NC_014334	TAAA	2	8	1722840	1722847	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5118	NC_014334	TCC	2	6	1724772	1724777	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5119	NC_014334	GAT	2	6	1724779	1724784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5120	NC_014334	CAAAG	2	10	1724824	1724833	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
5121	NC_014334	TCA	2	6	1726324	1726329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5122	NC_014334	CCA	2	6	1726332	1726337	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5123	NC_014334	CAA	2	6	1726360	1726365	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5124	NC_014334	A	6	6	1726890	1726895	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5125	NC_014334	T	6	6	1726918	1726923	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5126	NC_014334	TTA	2	6	1727737	1727742	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5127	NC_014334	A	8	8	1727784	1727791	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5128	NC_014334	T	7	7	1727808	1727814	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5129	NC_014334	TCC	2	6	1729276	1729281	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5130	NC_014334	CAC	2	6	1731911	1731916	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5131	NC_014334	ATT	2	6	1733962	1733967	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5132	NC_014334	TTACGA	2	12	1733988	1733999	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
5133	NC_014334	CAC	2	6	1734144	1734149	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5134	NC_014334	ATG	2	6	1734191	1734196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5257	NC_014334	CAACA	2	10	1781218	1781227	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
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5262	NC_014334	GCAG	2	8	1782069	1782076	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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5265	NC_014334	CTT	2	6	1782144	1782149	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5266	NC_014334	CCA	2	6	1782157	1782162	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5267	NC_014334	TGC	2	6	1782210	1782215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5268	NC_014334	TCGCAG	2	12	1782249	1782260	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5269	NC_014334	CACTTC	2	12	1782412	1782423	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
5270	NC_014334	ATC	2	6	1782439	1782444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5271	NC_014334	TC	3	6	1782443	1782448	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5272	NC_014334	ATCTC	2	10	1782479	1782488	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
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5287	NC_014334	TCGC	2	8	1783582	1783589	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5288	NC_014334	CTC	2	6	1783605	1783610	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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5297	NC_014334	ACAT	2	8	1784492	1784499	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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5305	NC_014334	TCGC	2	8	1785026	1785033	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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5309	NC_014334	CTTA	2	8	1785185	1785192	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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5363	NC_014334	TCAG	2	8	1791246	1791253	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5364	NC_014334	TG	3	6	1792710	1792715	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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5370	NC_014334	TGAT	2	8	1797275	1797282	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5371	NC_014334	ATT	2	6	1797365	1797370	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5381	NC_014334	GTT	2	6	1798994	1798999	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5382	NC_014334	T	6	6	1799072	1799077	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5383	NC_014334	AG	3	6	1799081	1799086	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5384	NC_014334	TGA	2	6	1799128	1799133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5388	NC_014334	GAG	2	6	1800533	1800538	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5389	NC_014334	ATG	2	6	1800619	1800624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5392	NC_014334	CCT	2	6	1801517	1801522	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5393	NC_014334	TGG	2	6	1801538	1801543	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5394	NC_014334	T	7	7	1801553	1801559	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5395	NC_014334	CTG	2	6	1801572	1801577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5396	NC_014334	CCA	2	6	1801583	1801588	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5397	NC_014334	ATT	2	6	1801599	1801604	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5398	NC_014334	TTA	2	6	1801620	1801625	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5497	NC_014334	TGT	2	6	1841747	1841752	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5499	NC_014334	CAA	2	6	1841840	1841845	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5500	NC_014334	A	6	6	1841844	1841849	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

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