MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus casei str. Zhang chromosome

Total Repeats: 8681

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_014334	TCGT	2	8	1459462	1459469	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4502	NC_014334	ACA	2	6	1459561	1459566	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4503	NC_014334	TGT	2	6	1459590	1459595	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4504	NC_014334	AAT	2	6	1459768	1459773	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4505	NC_014334	TCT	2	6	1459818	1459823	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4506	NC_014334	TCC	2	6	1462113	1462118	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4507	NC_014334	GCC	2	6	1462954	1462959	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4508	NC_014334	CGG	2	6	1462965	1462970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4509	NC_014334	CCCTT	2	10	1463356	1463365	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
4510	NC_014334	AGCC	2	8	1463391	1463398	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4511	NC_014334	GGC	2	6	1463604	1463609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4512	NC_014334	CTATG	2	10	1463663	1463672	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
4513	NC_014334	TCC	2	6	1466713	1466718	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4514	NC_014334	GCT	2	6	1468552	1468557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4515	NC_014334	AC	3	6	1468578	1468583	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4516	NC_014334	ATA	3	9	1468652	1468660	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4517	NC_014334	A	6	6	1471782	1471787	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4518	NC_014334	TCA	2	6	1471800	1471805	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4519	NC_014334	CAA	2	6	1471828	1471833	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4520	NC_014334	TCA	2	6	1471895	1471900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4521	NC_014334	TTA	2	6	1471915	1471920	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4522	NC_014334	AGA	2	6	1471952	1471957	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4523	NC_014334	GCAG	2	8	1472035	1472042	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4524	NC_014334	GTG	2	6	1472127	1472132	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4525	NC_014334	GC	3	6	1472163	1472168	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4526	NC_014334	CAC	2	6	1472226	1472231	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4527	NC_014334	CGC	2	6	1472241	1472246	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4528	NC_014334	CT	3	6	1472255	1472260	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4529	NC_014334	AAT	2	6	1472281	1472286	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4530	NC_014334	AAT	2	6	1472310	1472315	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4531	NC_014334	CCT	2	6	1472648	1472653	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4532	NC_014334	GAT	2	6	1472675	1472680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4533	NC_014334	AAAG	2	8	1472695	1472702	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4534	NC_014334	TAC	2	6	1472707	1472712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4535	NC_014334	CTC	2	6	1473105	1473110	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4536	NC_014334	CAA	2	6	1473112	1473117	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4537	NC_014334	A	6	6	1473121	1473126	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4538	NC_014334	AATTA	2	10	1473261	1473270	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4539	NC_014334	GTTT	2	8	1473278	1473285	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4540	NC_014334	AAT	2	6	1473321	1473326	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4541	NC_014334	TTA	2	6	1477267	1477272	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4542	NC_014334	ATG	2	6	1477277	1477282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4543	NC_014334	CG	3	6	1477416	1477421	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4544	NC_014334	TCCC	2	8	1478226	1478233	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
4545	NC_014334	TTA	2	6	1478281	1478286	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4546	NC_014334	CTGTT	2	10	1478347	1478356	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
4547	NC_014334	T	6	6	1478360	1478365	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4548	NC_014334	GTT	2	6	1478367	1478372	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4549	NC_014334	GTC	2	6	1478450	1478455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4550	NC_014334	TAAT	2	8	1480248	1480255	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4551	NC_014334	TTTTGA	2	12	1480263	1480274	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4552	NC_014334	TAA	2	6	1481318	1481323	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4553	NC_014334	TGGC	2	8	1481901	1481908	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4554	NC_014334	T	6	6	1481910	1481915	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4555	NC_014334	CCT	2	6	1485023	1485028	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4556	NC_014334	AGT	2	6	1485119	1485124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4557	NC_014334	ACT	2	6	1485141	1485146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4558	NC_014334	A	7	7	1485196	1485202	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4559	NC_014334	ACC	2	6	1485239	1485244	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4560	NC_014334	T	7	7	1485248	1485254	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4561	NC_014334	CCA	2	6	1485323	1485328	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4562	NC_014334	CAA	2	6	1485448	1485453	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4563	NC_014334	A	6	6	1485488	1485493	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4564	NC_014334	T	6	6	1485873	1485878	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4565	NC_014334	CCT	2	6	1488379	1488384	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4566	NC_014334	TAA	2	6	1488401	1488406	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4567	NC_014334	ATCA	2	8	1488418	1488425	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4568	NC_014334	AAT	2	6	1488508	1488513	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4569	NC_014334	GCA	2	6	1488556	1488561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4570	NC_014334	CTA	2	6	1488590	1488595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4571	NC_014334	TTG	2	6	1489093	1489098	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4572	NC_014334	TGG	2	6	1489183	1489188	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4573	NC_014334	A	6	6	1490522	1490527	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4574	NC_014334	T	6	6	1490565	1490570	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4575	NC_014334	ATA	2	6	1490578	1490583	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4576	NC_014334	A	7	7	1491694	1491700	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4577	NC_014334	GCT	2	6	1491701	1491706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4578	NC_014334	ACC	2	6	1491732	1491737	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4579	NC_014334	CCT	2	6	1494017	1494022	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4580	NC_014334	GCACGC	2	12	1494042	1494053	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
4581	NC_014334	CGC	2	6	1494112	1494117	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4582	NC_014334	GC	3	6	1494146	1494151	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4583	NC_014334	AC	3	6	1494162	1494167	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4584	NC_014334	TCC	2	6	1495343	1495348	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4585	NC_014334	CCT	2	6	1496422	1496427	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4586	NC_014334	TTCT	2	8	1496510	1496517	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4587	NC_014334	GCA	2	6	1497669	1497674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4588	NC_014334	A	6	6	1497985	1497990	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4589	NC_014334	T	6	6	1498035	1498040	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4590	NC_014334	AAT	2	6	1498066	1498071	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4591	NC_014334	ATGCT	2	10	1498130	1498139	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
4592	NC_014334	AAGC	2	8	1498158	1498165	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4593	NC_014334	TTC	2	6	1499476	1499481	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4594	NC_014334	T	6	6	1499505	1499510	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4595	NC_014334	AATGCT	2	12	1500051	1500062	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4596	NC_014334	AACT	2	8	1500109	1500116	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4597	NC_014334	AAT	2	6	1500118	1500123	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4598	NC_014334	TTA	2	6	1500129	1500134	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4599	NC_014334	ATT	2	6	1500140	1500145	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4600	NC_014334	AAG	2	6	1500169	1500174	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4601	NC_014334	ATC	2	6	1500258	1500263	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4602	NC_014334	A	7	7	1500293	1500299	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4603	NC_014334	ACC	2	6	1500352	1500357	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4604	NC_014334	TAT	2	6	1500969	1500974	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4605	NC_014334	TTAA	2	8	1501015	1501022	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4606	NC_014334	AAT	2	6	1501023	1501028	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4607	NC_014334	TC	3	6	1501611	1501616	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4608	NC_014334	AAC	2	6	1501673	1501678	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4609	NC_014334	CA	3	6	1501709	1501714	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4610	NC_014334	GGT	2	6	1501738	1501743	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4611	NC_014334	GC	3	6	1501832	1501837	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4612	NC_014334	TTA	2	6	1501860	1501865	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4613	NC_014334	T	6	6	1501922	1501927	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4614	NC_014334	CAC	2	6	1501954	1501959	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4615	NC_014334	ATC	2	6	1502013	1502018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4616	NC_014334	GAA	2	6	1502032	1502037	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4617	NC_014334	GCA	2	6	1502068	1502073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4618	NC_014334	TCG	2	6	1502111	1502116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4619	NC_014334	GTTT	2	8	1502123	1502130	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4620	NC_014334	ATT	2	6	1502157	1502162	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4621	NC_014334	AAG	2	6	1502182	1502187	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4622	NC_014334	C	6	6	1502205	1502210	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4623	NC_014334	CTC	2	6	1502249	1502254	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4624	NC_014334	CAT	2	6	1502457	1502462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4625	NC_014334	CAAA	2	8	1502487	1502494	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4626	NC_014334	CAA	2	6	1502547	1502552	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4627	NC_014334	GTT	2	6	1502553	1502558	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4628	NC_014334	TAAC	2	8	1502567	1502574	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4629	NC_014334	AAT	2	6	1502665	1502670	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4630	NC_014334	AGA	2	6	1502689	1502694	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4631	NC_014334	AGC	2	6	1502723	1502728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4632	NC_014334	CTTG	2	8	1502754	1502761	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4633	NC_014334	TTAA	2	8	1502764	1502771	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4634	NC_014334	CAAA	2	8	1502792	1502799	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
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