MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Leuconostoc gasicomitatum LMG 18811

Total Repeats: 277

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014319	TACAA	2	10	2844	2853	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_014319	AAAAT	2	10	11732	11741	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014319	CATGT	2	10	16579	16588	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
4	NC_014319	TATAA	2	10	31918	31927	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014319	TTATA	2	10	37442	37451	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014319	TAAAC	2	10	44434	44443	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
7	NC_014319	ATGAA	2	10	52188	52197	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014319	TTAAA	2	10	52248	52257	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014319	ATCAG	2	10	53426	53435	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
10	NC_014319	AGTAT	2	10	57671	57680	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014319	TCAAA	2	10	60935	60944	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
12	NC_014319	GGTTA	2	10	62179	62188	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014319	ATTCA	2	10	63491	63500	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
14	NC_014319	TTCAC	2	10	65765	65774	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
15	NC_014319	AATTG	2	10	75351	75360	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014319	TTTAA	2	10	81332	81341	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014319	TTTGT	2	10	83399	83408	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014319	TATCA	2	10	87504	87513	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
19	NC_014319	TCACA	2	10	96360	96369	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
20	NC_014319	TTTAA	2	10	99102	99111	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014319	TAAAT	2	10	111081	111090	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014319	AATAC	2	10	111836	111845	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
23	NC_014319	AATTT	2	10	112688	112697	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014319	ATAGA	2	10	133996	134005	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014319	ACTTA	2	10	146326	146335	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
26	NC_014319	TCATT	2	10	146373	146382	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
27	NC_014319	AATTA	2	10	147185	147194	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014319	CGAAC	2	10	147325	147334	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
29	NC_014319	TATAA	2	10	161621	161630	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014319	GAATT	2	10	169149	169158	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014319	TTGTT	2	10	190315	190324	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014319	ATTAA	2	10	198527	198536	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014319	TTAAT	2	10	219426	219435	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014319	TAAGT	2	10	220427	220436	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014319	AATTA	2	10	224413	224422	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014319	AATAA	2	10	231107	231116	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014319	TGTCA	2	10	231222	231231	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
38	NC_014319	TTTTA	2	10	231343	231352	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014319	TATGT	2	10	238307	238316	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014319	TTATT	2	10	243365	243374	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014319	TCACG	2	10	266344	266353	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
42	NC_014319	ATAAA	2	10	270872	270881	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014319	CAAAA	2	10	273860	273869	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
44	NC_014319	TGAAG	2	10	276335	276344	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014319	TAACA	2	10	279232	279241	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
46	NC_014319	TATAA	2	10	307265	307274	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014319	ATATA	2	10	317133	317142	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_014319	TTACT	2	10	334287	334296	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
49	NC_014319	ATGAT	2	10	345240	345249	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014319	GATTA	2	10	347382	347391	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014319	TATAG	2	10	355282	355291	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014319	CACAA	2	10	355725	355734	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
53	NC_014319	TAAAT	2	10	363863	363872	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014319	CAGGA	2	10	366867	366876	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
55	NC_014319	TTATA	2	10	382425	382434	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_014319	TTTTA	2	10	384184	384193	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014319	TAAAC	2	10	385908	385917	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
58	NC_014319	ACATA	2	10	395550	395559	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
59	NC_014319	TGATA	2	10	441097	441106	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014319	ATGAG	2	10	444453	444462	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
61	NC_014319	ATTTA	2	10	450332	450341	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014319	TTAAT	2	10	453813	453822	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014319	TTTGT	2	10	462647	462656	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
64	NC_014319	ATTAA	2	10	463047	463056	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_014319	TGGTA	2	10	467635	467644	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
66	NC_014319	ATACG	2	10	467938	467947	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
67	NC_014319	TAAGT	2	10	480253	480262	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014319	TGCTT	2	10	481457	481466	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
69	NC_014319	ATTTG	2	10	492237	492246	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014319	TTTGT	2	10	497205	497214	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
71	NC_014319	TTTAA	2	10	499322	499331	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_014319	TTTTA	2	10	501280	501289	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014319	TCTAT	2	10	509823	509832	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
74	NC_014319	TATGA	2	10	528658	528667	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
75	NC_014319	TAAAG	2	10	530522	530531	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
76	NC_014319	ATTAT	2	10	546332	546341	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_014319	ATAAA	2	10	566875	566884	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_014319	TGATA	2	10	576492	576501	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
79	NC_014319	TAAAA	2	10	589607	589616	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_014319	ACTAT	2	10	589966	589975	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
81	NC_014319	AATAA	2	10	589981	589990	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_014319	AAATT	2	10	590036	590045	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_014319	TAATT	2	10	591542	591551	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_014319	AGTAA	2	10	602773	602782	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
85	NC_014319	TTAAA	2	10	651360	651369	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_014319	TTTTG	2	10	653634	653643	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
87	NC_014319	TACAT	2	10	666894	666903	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
88	NC_014319	AAGAT	2	10	686574	686583	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
89	NC_014319	TAAAC	2	10	703576	703585	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
90	NC_014319	ATAAA	2	10	703707	703716	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_014319	AGAAA	2	10	709344	709353	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
92	NC_014319	CCTTA	2	10	709446	709455	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
93	NC_014319	ATTTT	2	10	730154	730163	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_014319	ATTTT	2	10	740422	740431	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_014319	TGTTA	2	10	744341	744350	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
96	NC_014319	GTTAT	2	10	750858	750867	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
97	NC_014319	AATAA	2	10	752209	752218	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_014319	GTTTG	2	10	756704	756713	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
99	NC_014319	TAAAA	2	10	778101	778110	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_014319	TAATT	2	10	779071	779080	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_014319	AGAAA	2	10	795458	795467	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
102	NC_014319	TAGTG	2	10	795750	795759	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
103	NC_014319	AATTA	2	10	807986	807995	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_014319	AATTT	2	10	811587	811596	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_014319	GTAAC	2	10	817976	817985	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
106	NC_014319	ATTAA	2	10	833802	833811	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_014319	GCTTA	2	10	837761	837770	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
108	NC_014319	TATAA	2	10	838900	838909	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_014319	TCATT	2	10	845126	845135	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
110	NC_014319	TCATT	2	10	851252	851261	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
111	NC_014319	TGCTT	2	10	854206	854215	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
112	NC_014319	GTATT	2	10	857549	857558	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
113	NC_014319	GATAA	2	10	857936	857945	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
114	NC_014319	CAATA	2	10	861132	861141	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
115	NC_014319	ATTTA	2	10	861175	861184	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_014319	TAAAA	2	10	869490	869499	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_014319	ATTAA	2	10	869717	869726	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_014319	ATAAA	2	10	874360	874369	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_014319	AAACT	2	10	874641	874650	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
120	NC_014319	TAAAA	2	10	875768	875777	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_014319	AGAAA	2	10	878789	878798	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
122	NC_014319	GAAAA	2	10	885026	885035	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
123	NC_014319	GAAAA	2	10	904053	904062	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
124	NC_014319	AAGAT	2	10	918258	918267	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
125	NC_014319	AATAG	2	10	920784	920793	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
126	NC_014319	AATAA	2	10	922831	922840	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_014319	CTATA	2	10	923597	923606	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
128	NC_014319	TTATT	2	10	947128	947137	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_014319	ATAGT	2	10	950912	950921	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
130	NC_014319	ATGAT	2	10	954569	954578	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
131	NC_014319	GTTTT	2	10	959149	959158	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
132	NC_014319	TCAAA	2	10	963015	963024	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
133	NC_014319	AAGAA	2	10	965824	965833	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
134	NC_014319	TAGAG	2	10	972187	972196	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
135	NC_014319	AATGA	2	10	972346	972355	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
136	NC_014319	TGTTT	2	10	972651	972660	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
137	NC_014319	TCATT	2	10	977180	977189	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
138	NC_014319	GAAAG	2	10	984195	984204	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
139	NC_014319	GATGA	2	10	988328	988337	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
140	NC_014319	TGATA	2	10	988440	988449	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
141	NC_014319	TTTAT	2	10	1011495	1011504	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_014319	ATTTG	2	10	1011513	1011522	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
143	NC_014319	AAAAG	2	10	1011624	1011633	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
144	NC_014319	GCCCT	2	10	1012047	1012056	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
145	NC_014319	GAAAG	2	10	1012305	1012314	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
146	NC_014319	AGCAA	2	10	1017832	1017841	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
147	NC_014319	AAAAT	2	10	1018235	1018244	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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277	NC_014319	TGGTA	2	10	1934145	1934154	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.