MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Leuconostoc kimchii IMSNU 11154 plasmid LkipL4701

Total Repeats: 89

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014131	TAT	2	6	38	43	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014131	GCT	2	6	46	51	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_014131	TTA	2	6	125	130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014131	TAC	2	6	216	221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_014131	TTA	2	6	254	259	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014131	TTG	2	6	338	343	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014131	AAC	2	6	357	362	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_014131	TTA	2	6	392	397	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014131	CTTA	2	8	455	462	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_014131	GAA	3	9	468	476	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014131	GATATT	2	12	589	600	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014131	AGC	2	6	684	689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_014131	TGA	2	6	714	719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014131	A	6	6	776	781	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014131	CAT	2	6	797	802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_014131	AT	3	6	821	826	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014131	TTACTT	2	12	848	859	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_014131	ATA	2	6	890	895	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014131	AT	3	6	901	906	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014131	AGA	2	6	956	961	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014131	AGT	2	6	965	970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014131	TAAAA	2	10	1651	1660	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014131	TA	6	12	1998	2009	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014131	T	7	7	2048	2054	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014131	TGTT	2	8	3059	3066	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014131	GGGA	2	8	3090	3097	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014131	GA	4	8	3111	3118	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014131	TGA	2	6	3125	3130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014131	GA	3	6	3144	3149	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014131	T	7	7	4362	4368	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014131	CTA	2	6	4414	4419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_014131	CTTT	2	8	4437	4444	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_014131	AAT	2	6	4688	4693	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014131	TAT	2	6	4706	4711	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014131	ATT	2	6	4728	4733	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014131	CCG	2	6	4843	4848	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_014131	ATA	2	6	4866	4871	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014131	AGG	2	6	4900	4905	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014131	GAG	2	6	5031	5036	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014131	TCA	2	6	6339	6344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_014131	TAA	2	6	6371	6376	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014131	CAC	2	6	6437	6442	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_014131	TGTTT	2	10	6474	6483	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014131	T	6	6	6481	6486	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014131	ATTG	2	8	6487	6494	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014131	TAT	2	6	6512	6517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014131	TAT	2	6	6572	6577	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_014131	A	7	7	6604	6610	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014131	A	7	7	6626	6632	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014131	A	7	7	6648	6654	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014131	AAAT	2	8	6678	6685	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014131	CAA	2	6	6754	6759	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_014131	AAAG	2	8	8505	8512	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014131	CTG	2	6	8514	8519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_014131	GGA	2	6	14165	14170	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_014131	TAA	2	6	17332	17337	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014131	GGTT	2	8	17361	17368	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_014131	T	7	7	17377	17383	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014131	A	6	6	17428	17433	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014131	AGT	2	6	17446	17451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_014131	A	6	6	17529	17534	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014131	AAC	2	6	17549	17554	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_014131	AACA	2	8	17573	17580	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_014131	AAT	2	6	17599	17604	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_014131	A	6	6	17621	17626	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_014131	ATT	2	6	17688	17693	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014131	GTT	2	6	17865	17870	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014131	CAC	2	6	17881	17886	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_014131	TGA	2	6	17964	17969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014131	ATA	2	6	18009	18014	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_014131	TGAT	2	8	18015	18022	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_014131	ATT	2	6	18052	18057	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014131	T	7	7	18077	18083	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_014131	TAA	2	6	18418	18423	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_014131	TA	3	6	18433	18438	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_014131	GAA	2	6	19706	19711	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_014131	TA	3	6	20529	20534	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_014131	AGG	2	6	20536	20541	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_014131	ATT	2	6	20570	20575	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_014131	A	6	6	20624	20629	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_014131	T	7	7	20697	20703	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_014131	GA	3	6	20734	20739	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_014131	TAAA	2	8	20745	20752	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_014131	A	8	8	20799	20806	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_014131	CAA	2	6	20826	20831	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_014131	GAA	2	6	20849	20854	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_014131	TGA	2	6	20914	20919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_014131	ATTA	2	8	20923	20930	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_014131	TGA	2	6	21010	21015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.