MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Legionella pneumophila 2300/99 Alcoy chromosome

Total Repeats: 486

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014125	ACTTA	2	10	6534	6543	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_014125	CTTTC	2	10	10858	10867	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
3	NC_014125	TTTTA	2	10	20336	20345	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014125	CTATC	2	10	26609	26618	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
5	NC_014125	ATAAA	2	10	29929	29938	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014125	GTTTT	2	10	41016	41025	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014125	ATGAA	2	10	41123	41132	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014125	TGATT	2	10	50916	50925	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014125	AGGAA	2	10	56548	56557	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014125	CTTTT	2	10	57674	57683	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
11	NC_014125	ATTTG	2	10	64115	64124	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014125	TTTGA	2	10	71013	71022	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014125	ATCTT	2	10	75445	75454	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
14	NC_014125	TTGTC	2	10	85498	85507	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
15	NC_014125	ATATA	2	10	89339	89348	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014125	ATTAG	2	10	127301	127310	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014125	TCAAC	2	10	131485	131494	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
18	NC_014125	GATTT	2	10	131706	131715	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014125	GATAA	2	10	131877	131886	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014125	ATATA	2	10	145068	145077	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014125	GATTA	2	10	146517	146526	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014125	CCTCA	2	10	149682	149691	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
23	NC_014125	TTGAT	2	10	155104	155113	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014125	CAAAT	2	10	163928	163937	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
25	NC_014125	ACTGT	2	10	219027	219036	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
26	NC_014125	AATTT	2	10	219652	219661	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014125	AATTA	2	10	220050	220059	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014125	ATCAC	2	10	229786	229795	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
29	NC_014125	AGTAA	2	10	231027	231036	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014125	TAGCA	2	10	231261	231270	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
31	NC_014125	ATTAT	2	10	231340	231349	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014125	TCAGC	2	10	232410	232419	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
33	NC_014125	AAATT	2	10	235864	235873	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014125	CATAT	2	10	236434	236443	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
35	NC_014125	ATCTT	2	10	240927	240936	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
36	NC_014125	GAAAG	2	10	252249	252258	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014125	TTAAT	2	10	253801	253810	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014125	CTTAA	2	10	256881	256890	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
39	NC_014125	ACTTT	2	10	269979	269988	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
40	NC_014125	TATCT	2	10	275557	275566	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
41	NC_014125	TTTAA	2	10	281285	281294	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014125	AGTAT	2	10	314539	314548	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014125	GCGTT	2	10	329977	329986	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
44	NC_014125	AAATA	2	10	335726	335735	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014125	ACCTT	2	10	354264	354273	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
46	NC_014125	TCAAA	2	10	391054	391063	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
47	NC_014125	TTTCA	2	10	394865	394874	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
48	NC_014125	TCGTG	2	10	410013	410022	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
49	NC_014125	TTTTA	2	10	413921	413930	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014125	TAAAT	2	10	413987	413996	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014125	ATTTT	2	10	442548	442557	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014125	TAAAT	2	10	447460	447469	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014125	ACAGC	2	10	447554	447563	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
54	NC_014125	AATAT	2	10	456525	456534	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_014125	ACAAA	2	10	458271	458280	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
56	NC_014125	TCAAT	2	10	472570	472579	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
57	NC_014125	TTAAA	2	10	482174	482183	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_014125	TTTTA	2	10	484172	484181	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014125	TGAAA	2	10	491999	492008	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014125	CTTTG	2	10	494797	494806	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
61	NC_014125	AAATA	2	10	496022	496031	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014125	CATTT	2	10	500584	500593	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
63	NC_014125	GTAGA	2	10	507945	507954	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
64	NC_014125	ATTCT	2	10	509464	509473	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
65	NC_014125	GGTTT	2	10	515989	515998	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
66	NC_014125	TTTAT	2	10	519944	519953	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014125	CTTCT	2	10	524180	524189	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
68	NC_014125	ATTGT	2	10	525673	525682	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_014125	ACTTA	2	10	525688	525697	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
70	NC_014125	ATTTC	2	10	527290	527299	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
71	NC_014125	AATTT	2	10	539661	539670	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_014125	ATTAA	2	10	564752	564761	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014125	ATTTC	2	10	574622	574631	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
74	NC_014125	TCAAT	2	10	575949	575958	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
75	NC_014125	TGGTG	2	10	592408	592417	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
76	NC_014125	AAATT	2	10	602923	602932	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_014125	TGTTA	2	10	609356	609365	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
78	NC_014125	TTCTA	2	10	633032	633041	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
79	NC_014125	TTAAT	2	10	648967	648976	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_014125	AAAAT	2	10	650395	650404	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_014125	AATAT	2	10	657988	657997	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_014125	TAATG	2	10	663497	663506	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
83	NC_014125	GTTTT	2	10	664212	664221	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
84	NC_014125	TTTTG	2	10	664388	664397	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
85	NC_014125	GCATT	2	10	665889	665898	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
86	NC_014125	ATTTT	2	10	674729	674738	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_014125	TTATG	2	10	676607	676616	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
88	NC_014125	AATGA	2	10	680097	680106	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
89	NC_014125	AGATA	2	10	684435	684444	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
90	NC_014125	TCGTG	2	10	691596	691605	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
91	NC_014125	AAAAT	2	10	699298	699307	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_014125	ATTAA	2	10	704459	704468	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_014125	TAAAG	2	10	712443	712452	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
94	NC_014125	GCAAA	2	10	729298	729307	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
95	NC_014125	GAAAG	2	10	732790	732799	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
96	NC_014125	TACAT	2	10	738175	738184	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
97	NC_014125	TATCA	2	10	745715	745724	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
98	NC_014125	ATTTG	2	10	746326	746335	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
99	NC_014125	TAAAC	2	10	760051	760060	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
100	NC_014125	CAAAT	2	10	771772	771781	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
101	NC_014125	TTTTC	2	10	795858	795867	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
102	NC_014125	TTGCT	2	10	829089	829098	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
103	NC_014125	TTTAA	2	10	835162	835171	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_014125	TGGTA	2	10	842284	842293	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
105	NC_014125	GTTTA	2	10	851840	851849	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
106	NC_014125	TAAAA	2	10	871270	871279	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_014125	AATTG	2	10	888685	888694	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
108	NC_014125	TCCTT	2	10	889236	889245	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
109	NC_014125	GTGAT	2	10	893387	893396	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
110	NC_014125	ATTAG	2	10	903971	903980	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
111	NC_014125	ATCTT	2	10	911113	911122	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
112	NC_014125	TAATA	2	10	912813	912822	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_014125	TAAAC	2	10	927419	927428	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
114	NC_014125	AAAAG	2	10	936996	937005	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
115	NC_014125	CGGTT	2	10	956607	956616	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
116	NC_014125	TTGAG	2	10	972924	972933	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
117	NC_014125	CTCAA	2	10	972944	972953	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
118	NC_014125	ATGGT	2	10	978814	978823	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
119	NC_014125	CTACT	2	10	989720	989729	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
120	NC_014125	ATCAA	2	10	998165	998174	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
121	NC_014125	TAAAT	2	10	1022147	1022156	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_014125	TTGTT	2	10	1031842	1031851	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
123	NC_014125	TTTAA	2	10	1039040	1039049	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_014125	ATATA	2	10	1046992	1047001	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_014125	TTTAA	2	10	1047412	1047421	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_014125	TCAAT	2	10	1052525	1052534	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
127	NC_014125	ATTAT	2	10	1052536	1052545	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_014125	AGCTC	2	10	1054027	1054036	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
129	NC_014125	TTTAT	2	10	1060909	1060918	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_014125	CCAGG	2	10	1066030	1066039	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
131	NC_014125	TGAGA	2	10	1071450	1071459	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
132	NC_014125	TTGGG	2	10	1079249	1079258	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
133	NC_014125	TGATT	2	10	1096992	1097001	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
134	NC_014125	TGGGT	2	10	1102286	1102295	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
135	NC_014125	TTATA	2	10	1113939	1113948	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_014125	TTTAA	2	10	1117395	1117404	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_014125	TAAAG	2	10	1121551	1121560	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
138	NC_014125	ATTTG	2	10	1126365	1126374	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
139	NC_014125	TTTTG	2	10	1127317	1127326	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
140	NC_014125	TAATC	2	10	1156562	1156571	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
141	NC_014125	AGGGA	2	10	1168175	1168184	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
142	NC_014125	AAATG	2	10	1176449	1176458	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
143	NC_014125	TCATA	2	10	1178131	1178140	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
144	NC_014125	ATTTC	2	10	1179200	1179209	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
145	NC_014125	TGATA	2	10	1179354	1179363	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
146	NC_014125	GACAA	2	10	1184265	1184274	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
147	NC_014125	ATCAT	2	10	1185073	1185082	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
148	NC_014125	CAAAA	2	10	1213458	1213467	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
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159	NC_014125	TCGTT	2	10	1295934	1295943	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
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161	NC_014125	AACAA	2	10	1304128	1304137	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
162	NC_014125	TTATA	2	10	1320322	1320331	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
163	NC_014125	TAAAA	2	10	1322944	1322953	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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165	NC_014125	ATCTT	2	10	1331660	1331669	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
166	NC_014125	TGTTT	2	10	1336299	1336308	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
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169	NC_014125	ATGTA	2	10	1341874	1341883	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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183	NC_014125	ATTTT	2	10	1409939	1409948	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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191	NC_014125	TTTTA	2	10	1502300	1502309	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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253	NC_014125	TAAGT	2	10	1980221	1980230	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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272	NC_014125	ATCTA	2	10	2151897	2151906	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
273	NC_014125	TTATA	2	10	2158881	2158890	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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276	NC_014125	AAAAC	2	10	2173918	2173927	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
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281	NC_014125	TCAAT	2	10	2188395	2188404	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
282	NC_014125	ATGAT	2	10	2191599	2191608	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
283	NC_014125	TGAGA	2	10	2193507	2193516	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
284	NC_014125	CGTAC	2	10	2207519	2207528	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
285	NC_014125	ATAAA	2	10	2217465	2217474	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
286	NC_014125	AATAA	2	10	2219078	2219087	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
287	NC_014125	CAGTA	2	10	2226466	2226475	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
288	NC_014125	TCATT	2	10	2242501	2242510	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
289	NC_014125	ACCAA	2	10	2253570	2253579	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
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292	NC_014125	CATAA	2	10	2266569	2266578	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
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294	NC_014125	TATAA	2	10	2277904	2277913	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
295	NC_014125	CAATG	2	10	2281400	2281409	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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301	NC_014125	TATTT	2	10	2306761	2306770	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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304	NC_014125	ATTAT	2	10	2311824	2311833	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
305	NC_014125	TTAAT	2	10	2317859	2317868	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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411	NC_014125	CATGA	2	10	2983546	2983555	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
412	NC_014125	TTCAT	2	10	2984175	2984184	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.