MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Lactobacillus crispatus ST1

Total Repeats: 854

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014106	ATTA	2	8	1485	1492	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014106	TATT	2	8	2763	2770	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014106	AAAG	2	8	9793	9800	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014106	TAAA	3	12	11640	11651	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014106	TACA	2	8	19085	19092	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_014106	AAGA	2	8	20110	20117	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014106	ATTA	2	8	22006	22013	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014106	GATA	2	8	24726	24733	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014106	AAAC	2	8	24753	24760	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_014106	TATC	2	8	26654	26661	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_014106	TAGA	2	8	30533	30540	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014106	TTTA	2	8	31647	31654	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014106	AAAT	2	8	33632	33639	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014106	TCTT	2	8	33752	33759	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_014106	CAAA	2	8	40218	40225	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_014106	GATT	2	8	40386	40393	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014106	AGAA	2	8	43092	43099	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014106	CTTT	2	8	46433	46440	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_014106	AACC	2	8	46737	46744	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_014106	GAAA	2	8	50038	50045	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014106	AAAC	2	8	52353	52360	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_014106	AGCT	2	8	53182	53189	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
23	NC_014106	AAGC	2	8	54518	54525	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
24	NC_014106	GTTT	2	8	60149	60156	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014106	TAGC	2	8	60216	60223	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
26	NC_014106	AATT	2	8	61952	61959	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014106	CGAA	2	8	62090	62097	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
28	NC_014106	GAAA	2	8	62187	62194	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014106	GCAA	2	8	62457	62464	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
30	NC_014106	CGAG	2	8	62579	62586	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
31	NC_014106	AGCG	2	8	62625	62632	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
32	NC_014106	ATAG	2	8	64693	64700	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014106	AGAA	2	8	64752	64759	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014106	GCGA	2	8	64781	64788	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
35	NC_014106	TAGT	2	8	65003	65010	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014106	TAGG	2	8	66664	66671	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014106	CTGC	2	8	67602	67609	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
38	NC_014106	ACAA	2	8	68705	68712	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_014106	GAAA	2	8	73692	73699	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014106	AATC	2	8	74424	74431	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_014106	CTTT	2	8	75300	75307	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_014106	TTAA	2	8	81528	81535	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014106	TGAT	2	8	82921	82928	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014106	ATAA	2	8	86546	86553	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014106	TAAA	2	8	86564	86571	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014106	ATTT	2	8	89107	89114	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014106	TGCA	2	8	90358	90365	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
48	NC_014106	TAGT	2	8	90416	90423	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014106	TAAG	2	8	90449	90456	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014106	CATT	2	8	96585	96592	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_014106	TCTT	2	8	107597	107604	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_014106	TAAA	2	8	111114	111121	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014106	GTAG	2	8	117103	117110	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014106	TAAA	2	8	117361	117368	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_014106	TGAT	2	8	117525	117532	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_014106	ATAA	2	8	118750	118757	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014106	TCAA	2	8	118763	118770	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_014106	AATA	2	8	119710	119717	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014106	TGAT	2	8	122450	122457	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014106	AGAA	2	8	122478	122485	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_014106	AAAG	2	8	135917	135924	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014106	ATCA	2	8	138495	138502	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_014106	TTAA	2	8	138636	138643	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_014106	AAAT	2	8	138803	138810	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_014106	GCTA	2	8	138824	138831	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
66	NC_014106	AGTA	2	8	139019	139026	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014106	TTTA	2	8	139690	139697	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014106	AAAT	2	8	139760	139767	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_014106	GAAT	2	8	140914	140921	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014106	AGTA	2	8	142523	142530	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_014106	AGAA	2	8	142706	142713	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_014106	AGGA	2	8	143430	143437	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014106	ATTA	2	8	146806	146813	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_014106	TTAA	2	8	147851	147858	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_014106	AAAG	2	8	150272	150279	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_014106	GTAA	2	8	150895	150902	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_014106	CGGC	2	8	151543	151550	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
78	NC_014106	TTTA	2	8	167486	167493	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_014106	TAAA	2	8	167494	167501	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_014106	TGAA	2	8	167644	167651	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_014106	TAGT	2	8	167766	167773	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_014106	GATG	2	8	168766	168773	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_014106	CCTT	2	8	169430	169437	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_014106	CAAA	2	8	169488	169495	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
85	NC_014106	GTTA	2	8	170015	170022	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_014106	CTTG	2	8	170627	170634	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
87	NC_014106	GTAA	2	8	170960	170967	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_014106	AGTA	2	8	172661	172668	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
89	NC_014106	ATTT	2	8	172937	172944	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_014106	AAAT	2	8	174231	174238	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_014106	TCTT	2	8	174856	174863	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
92	NC_014106	TGTT	2	8	175923	175930	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
93	NC_014106	ATTG	2	8	176962	176969	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
94	NC_014106	CAAA	2	8	178062	178069	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
95	NC_014106	TGAT	2	8	178293	178300	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_014106	ATTA	2	8	178383	178390	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_014106	GGAC	2	8	178556	178563	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
98	NC_014106	TGGT	2	8	180998	181005	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_014106	CAAT	2	8	181489	181496	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
100	NC_014106	AGGA	2	8	181760	181767	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_014106	TACT	2	8	181823	181830	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
102	NC_014106	AATT	2	8	190270	190277	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_014106	CTTT	2	8	191094	191101	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
104	NC_014106	AAAG	2	8	192110	192117	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_014106	TAAC	2	8	199152	199159	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
106	NC_014106	GTGG	2	8	199288	199295	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
107	NC_014106	TATT	2	8	200820	200827	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_014106	TTGA	2	8	200933	200940	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
109	NC_014106	AGTA	2	8	201031	201038	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
110	NC_014106	ATAA	2	8	201475	201482	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_014106	AATG	2	8	201498	201505	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
112	NC_014106	AAAT	2	8	203661	203668	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_014106	ACAA	2	8	205447	205454	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
114	NC_014106	ATAG	2	8	205518	205525	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
115	NC_014106	AACT	2	8	214151	214158	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
116	NC_014106	AAAG	2	8	214902	214909	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
117	NC_014106	CTTT	2	8	216858	216865	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
118	NC_014106	TAGC	2	8	219242	219249	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
119	NC_014106	AATA	2	8	226347	226354	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_014106	ATTT	2	8	228267	228274	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_014106	ATTA	2	8	228310	228317	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_014106	AGGT	2	8	230726	230733	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_014106	TAGT	2	8	233502	233509	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
124	NC_014106	AGAT	2	8	234728	234735	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
125	NC_014106	CTAA	2	8	237488	237495	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
126	NC_014106	TAAA	2	8	241716	241723	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_014106	TTTA	2	8	242353	242360	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_014106	AAGA	2	8	246716	246723	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
129	NC_014106	TTCA	2	8	246782	246789	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
130	NC_014106	AATG	2	8	247443	247450	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_014106	TTGA	2	8	247466	247473	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
132	NC_014106	AGTT	2	8	247496	247503	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
133	NC_014106	TGTT	2	8	249362	249369	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
134	NC_014106	TGAA	2	8	249475	249482	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
135	NC_014106	ATTT	2	8	249541	249548	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_014106	CAGC	2	8	251242	251249	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
137	NC_014106	TAAT	2	8	251771	251778	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_014106	CAAT	2	8	251802	251809	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
139	NC_014106	ACTT	2	8	251872	251879	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
140	NC_014106	TACC	2	8	252942	252949	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
141	NC_014106	CTTT	2	8	256780	256787	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
142	NC_014106	AATT	2	8	257581	257588	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_014106	TTTG	2	8	257947	257954	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
144	NC_014106	CTTA	2	8	258448	258455	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
145	NC_014106	AATT	2	8	258457	258464	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_014106	AAGG	2	8	258472	258479	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
147	NC_014106	AAGG	2	8	261324	261331	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
148	NC_014106	TTTG	2	8	263919	263926	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
149	NC_014106	CCAT	2	8	264522	264529	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
150	NC_014106	ATTA	2	8	265096	265103	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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152	NC_014106	TTAA	2	8	281904	281911	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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