MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus crispatus ST1

Total Repeats: 6410

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_014106	AT	3	6	139873	139878	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
502	NC_014106	AAT	2	6	139931	139936	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
503	NC_014106	ATT	2	6	139973	139978	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
504	NC_014106	AAT	2	6	139990	139995	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
505	NC_014106	TGA	2	6	140003	140008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
506	NC_014106	GGATTA	2	12	140016	140027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
507	NC_014106	TAA	2	6	140055	140060	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
508	NC_014106	ATT	2	6	140134	140139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
509	NC_014106	CTA	2	6	140145	140150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
510	NC_014106	TA	3	6	140162	140167	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
511	NC_014106	AT	3	6	140196	140201	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
512	NC_014106	AGG	2	6	140203	140208	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
513	NC_014106	GAAT	2	8	140914	140921	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
514	NC_014106	T	6	6	140953	140958	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
515	NC_014106	TAC	2	6	140981	140986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
516	NC_014106	GTA	2	6	141010	141015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
517	NC_014106	AGA	2	6	141072	141077	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
518	NC_014106	TAT	2	6	142498	142503	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
519	NC_014106	TGT	2	6	142511	142516	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
520	NC_014106	AGTA	2	8	142523	142530	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
521	NC_014106	AGAA	2	8	142706	142713	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
522	NC_014106	T	6	6	142749	142754	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
523	NC_014106	A	6	6	142774	142779	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
524	NC_014106	A	7	7	143384	143390	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
525	NC_014106	AGGA	2	8	143430	143437	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
526	NC_014106	CTT	2	6	143952	143957	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
527	NC_014106	CAA	2	6	144809	144814	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
528	NC_014106	ATT	2	6	144830	144835	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
529	NC_014106	A	6	6	144836	144841	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
530	NC_014106	AAT	2	6	145401	145406	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
531	NC_014106	ATT	2	6	145434	145439	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
532	NC_014106	T	7	7	145438	145444	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
533	NC_014106	ATT	2	6	146611	146616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
534	NC_014106	T	7	7	146615	146621	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
535	NC_014106	TAT	2	6	146667	146672	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
536	NC_014106	T	6	6	146774	146779	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
537	NC_014106	TTA	2	6	146792	146797	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
538	NC_014106	ATTA	2	8	146806	146813	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
539	NC_014106	T	7	7	146855	146861	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
540	NC_014106	AGT	2	6	146871	146876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
541	NC_014106	TTTATG	2	12	146895	146906	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
542	NC_014106	TTAA	2	8	147851	147858	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
543	NC_014106	AAAG	2	8	150272	150279	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
544	NC_014106	T	6	6	150300	150305	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
545	NC_014106	TC	3	6	150882	150887	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
546	NC_014106	GTAA	2	8	150895	150902	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
547	NC_014106	TAT	2	6	150916	150921	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
548	NC_014106	TTA	2	6	150922	150927	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
549	NC_014106	A	7	7	150931	150937	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
550	NC_014106	ATT	2	6	150942	150947	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
551	NC_014106	T	6	6	150946	150951	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
552	NC_014106	T	7	7	150994	151000	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
553	NC_014106	GAG	2	6	151023	151028	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
554	NC_014106	ATT	2	6	151521	151526	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
555	NC_014106	CGGC	2	8	151543	151550	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
556	NC_014106	T	7	7	151551	151557	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
557	NC_014106	T	6	6	151560	151565	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
558	NC_014106	AT	3	6	153049	153054	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
559	NC_014106	AG	3	6	153072	153077	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
560	NC_014106	T	6	6	155059	155064	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
561	NC_014106	A	6	6	156368	156373	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
562	NC_014106	CT	3	6	156377	156382	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
563	NC_014106	T	7	7	156382	156388	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
564	NC_014106	A	6	6	156391	156396	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
565	NC_014106	AT	3	6	156445	156450	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
566	NC_014106	ATA	2	6	156467	156472	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
567	NC_014106	TGT	2	6	156478	156483	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
568	NC_014106	T	6	6	159479	159484	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
569	NC_014106	TTG	2	6	161267	161272	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
570	NC_014106	A	6	6	161319	161324	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
571	NC_014106	CTAGA	2	10	161337	161346	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
572	NC_014106	GA	3	6	161349	161354	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
573	NC_014106	AAG	2	6	161364	161369	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
574	NC_014106	AG	3	6	161373	161378	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
575	NC_014106	ACA	2	6	162602	162607	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
576	NC_014106	T	7	7	162620	162626	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
577	NC_014106	T	6	6	162656	162661	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
578	NC_014106	TAA	2	6	164684	164689	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
579	NC_014106	TGC	2	6	164702	164707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
580	NC_014106	TAC	2	6	164708	164713	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
581	NC_014106	TTA	2	6	164732	164737	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
582	NC_014106	TAA	2	6	164743	164748	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
583	NC_014106	T	6	6	164750	164755	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
584	NC_014106	A	6	6	164761	164766	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
585	NC_014106	T	7	7	164784	164790	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
586	NC_014106	CAA	2	6	166835	166840	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
587	NC_014106	TAA	2	6	166852	166857	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
588	NC_014106	A	7	7	166856	166862	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
589	NC_014106	TTG	2	6	166888	166893	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
590	NC_014106	TGA	2	6	166962	166967	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
591	NC_014106	TAA	2	6	166984	166989	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
592	NC_014106	A	6	6	166988	166993	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
593	NC_014106	A	6	6	167002	167007	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
594	NC_014106	GTT	2	6	167475	167480	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
595	NC_014106	TTTA	2	8	167486	167493	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
596	NC_014106	TAAA	2	8	167494	167501	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
597	NC_014106	AAT	3	9	167515	167523	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
598	NC_014106	GA	3	6	167563	167568	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
599	NC_014106	A	6	6	167578	167583	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
600	NC_014106	TGAA	2	8	167644	167651	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
601	NC_014106	A	6	6	167650	167655	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
602	NC_014106	T	6	6	167687	167692	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
603	NC_014106	T	6	6	167725	167730	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
604	NC_014106	T	7	7	167754	167760	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
605	NC_014106	TAGT	2	8	167766	167773	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
606	NC_014106	AT	3	6	167793	167798	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
607	NC_014106	A	6	6	168379	168384	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
608	NC_014106	T	6	6	168684	168689	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
609	NC_014106	TCA	2	6	168698	168703	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
610	NC_014106	GAT	2	6	168725	168730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
611	NC_014106	CTG	2	6	168734	168739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
612	NC_014106	GATG	2	8	168766	168773	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
613	NC_014106	CCTT	2	8	169430	169437	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
614	NC_014106	TAT	2	6	169453	169458	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
615	NC_014106	TA	3	6	169464	169469	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
616	NC_014106	CAAA	2	8	169488	169495	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
617	NC_014106	A	6	6	169973	169978	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
618	NC_014106	GTTA	2	8	170015	170022	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
619	NC_014106	ATT	2	6	170076	170081	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
620	NC_014106	GAA	2	6	170091	170096	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
621	NC_014106	CTTG	2	8	170627	170634	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
622	NC_014106	TTG	2	6	170814	170819	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
623	NC_014106	TG	3	6	170854	170859	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
624	NC_014106	ATT	2	6	170887	170892	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
625	NC_014106	T	6	6	170927	170932	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
626	NC_014106	GTAA	2	8	170960	170967	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
627	NC_014106	ACT	2	6	171019	171024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
628	NC_014106	GAA	2	6	171061	171066	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
629	NC_014106	T	6	6	171115	171120	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
630	NC_014106	AGG	2	6	171129	171134	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
631	NC_014106	GTA	2	6	172556	172561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
632	NC_014106	GATAAA	2	12	172562	172573	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
633	NC_014106	ATT	2	6	172613	172618	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
634	NC_014106	CA	3	6	172638	172643	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
635	NC_014106	AGTA	2	8	172661	172668	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
636	NC_014106	TA	3	6	172707	172712	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
637	NC_014106	ACT	2	6	172794	172799	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
638	NC_014106	TGT	2	6	172823	172828	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
639	NC_014106	TGA	2	6	172874	172879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
640	NC_014106	CTT	2	6	172918	172923	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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642	NC_014106	ATT	2	6	173053	173058	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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926	NC_014106	GAA	2	6	244748	244753	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
927	NC_014106	GTC	2	6	244776	244781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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929	NC_014106	CTC	2	6	246710	246715	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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943	NC_014106	TAG	2	6	247490	247495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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948	NC_014106	TGT	2	6	249316	249321	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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953	NC_014106	ATTT	2	8	249541	249548	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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958	NC_014106	TTA	2	6	250755	250760	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
959	NC_014106	TAT	2	6	250862	250867	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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963	NC_014106	CAA	2	6	251056	251061	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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967	NC_014106	CTT	2	6	251288	251293	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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985	NC_014106	A	6	6	252211	252216	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
986	NC_014106	CAA	2	6	252217	252222	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
987	NC_014106	AG	3	6	252299	252304	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
988	NC_014106	ATT	2	6	252355	252360	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
989	NC_014106	TAA	2	6	252399	252404	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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