MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Listeria seeligeri serovar 1/2b str. SLCC3954 chromosome

Total Repeats: 121

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013891	CTATTA	2	12	1787	1798	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_013891	AGAAAA	2	12	30220	30231	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013891	ATATAA	2	12	44894	44905	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013891	TCGCTT	2	12	76561	76572	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_013891	TAATAT	2	12	82686	82697	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013891	TAAAAA	2	12	92055	92066	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_013891	AATATT	2	12	181985	181996	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_013891	TGAAAG	2	12	183994	184005	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_013891	ATTCAA	2	12	222506	222517	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_013891	AAGGAA	2	12	224077	224088	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_013891	TAGGCG	2	12	225731	225742	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_013891	ATTTTT	2	12	228169	228180	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013891	ATTCAA	2	12	228523	228534	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_013891	AAGGAA	2	12	230094	230105	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_013891	TAGGCG	2	12	231748	231759	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_013891	TTATAT	2	12	247907	247918	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_013891	TTAAAC	2	12	257485	257496	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_013891	AGATAT	2	12	298008	298019	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_013891	GGAAAT	2	12	315208	315219	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_013891	TGGTAT	2	12	315230	315241	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_013891	TTTTAG	2	12	372198	372209	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_013891	TTTTTA	2	12	381142	381153	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_013891	ATAAAA	2	12	387892	387903	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_013891	TCTCCC	2	12	388886	388897	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_013891	ACTATC	2	12	410210	410221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_013891	TTAATT	2	12	423170	423181	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_013891	AGCAAT	2	12	436075	436086	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_013891	AAATGT	2	12	437694	437705	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_013891	AAATGT	2	12	445361	445372	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_013891	ATCTGA	2	12	445444	445455	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_013891	AAATGT	2	12	445492	445503	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_013891	AAATGT	2	12	454847	454858	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_013891	AGGAAA	2	12	495092	495103	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_013891	GAATTT	2	12	499419	499430	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_013891	TTATTT	2	12	535632	535643	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_013891	AAATGA	2	12	545115	545126	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_013891	AGAAAA	2	12	713115	713126	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_013891	TAATGA	2	12	717151	717162	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_013891	ATAAAA	2	12	719808	719819	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_013891	AATGTA	2	12	731706	731717	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_013891	TATTTT	2	12	794770	794781	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_013891	GTAATC	2	12	817234	817245	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_013891	TTACAA	2	12	817252	817263	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_013891	ATGAAA	2	12	825861	825872	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_013891	TTTTAT	2	12	849681	849692	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_013891	TGTTTT	2	12	942234	942245	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_013891	TTGACT	2	12	945088	945099	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_013891	TGGCTT	2	12	986779	986790	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_013891	TACTAT	2	12	1002135	1002146	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_013891	ATATTA	2	12	1010848	1010859	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_013891	AGAAAA	2	12	1036631	1036642	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_013891	AATATG	2	12	1051199	1051210	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_013891	TATAAA	2	12	1053976	1053987	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_013891	CTTTTT	2	12	1085764	1085775	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_013891	TCTTTT	2	12	1121684	1121695	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_013891	GAAAAA	2	12	1151634	1151645	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_013891	AAGTAA	2	12	1158157	1158168	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_013891	TTTCAG	2	12	1166786	1166797	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_013891	TATAAT	2	12	1170946	1170957	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_013891	AGATGA	2	12	1177919	1177930	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_013891	GAAAAG	2	12	1180155	1180166	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_013891	TATGCT	2	12	1315637	1315648	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_013891	GTACAA	2	12	1318282	1318293	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_013891	AATTAA	2	12	1344714	1344725	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_013891	TACCAA	2	12	1376476	1376487	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_013891	AAAGCC	2	12	1419314	1419325	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_013891	AAAATC	2	12	1424190	1424201	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_013891	TTTCTC	2	12	1427891	1427902	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_013891	AACATA	2	12	1495622	1495633	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_013891	CTCTTC	2	12	1501644	1501655	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_013891	GATAAC	2	12	1522590	1522601	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_013891	AATTAG	2	12	1538006	1538017	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_013891	AGAAAT	2	12	1548966	1548977	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_013891	TTTTTA	2	12	1553683	1553694	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_013891	GTAAAC	2	12	1555048	1555059	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_013891	ACAAAA	2	12	1563687	1563698	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_013891	AAAATA	2	12	1574382	1574393	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_013891	AAATAA	2	12	1619353	1619364	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_013891	CGCCTA	2	12	1691063	1691074	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
80	NC_013891	TTTCCT	2	12	1692716	1692727	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_013891	TTGAAT	2	12	1694288	1694299	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_013891	TTTACC	2	12	1708613	1708624	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_013891	ATACTA	2	12	1722582	1722593	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_013891	CTTCTA	2	12	1722620	1722631	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_013891	CGCCTA	2	12	1799762	1799773	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
86	NC_013891	TTTCCT	2	12	1801415	1801426	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_013891	TTGAAT	2	12	1802987	1802998	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_013891	AAATGG	2	12	1803970	1803981	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_013891	CATGTA	2	12	1819611	1819622	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_013891	CTCTAT	2	12	1924529	1924540	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_013891	TCATTT	2	12	1925729	1925740	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_013891	ATTTCT	2	12	1936003	1936014	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_013891	GTTTTC	2	12	1954902	1954913	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_013891	CAAAAA	2	12	1972882	1972893	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_013891	AGAAAA	2	12	1983582	1983593	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_013891	CTTTTT	2	12	2032766	2032777	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_013891	TTAAAT	2	12	2041968	2041979	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_013891	ATTTTT	2	12	2177272	2177283	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_013891	TCATTT	2	12	2224402	2224413	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_013891	AAATTG	2	12	2233418	2233429	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_013891	CTCTGT	2	12	2240264	2240275	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_013891	TTTATG	2	12	2274460	2274471	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_013891	CGCCTA	2	12	2338142	2338153	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
104	NC_013891	TTTCCT	2	12	2340046	2340057	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_013891	TTGAAT	2	12	2341618	2341629	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_013891	TAAAAT	2	12	2412811	2412822	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_013891	TTTATT	2	12	2478207	2478218	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_013891	TTTAAA	2	12	2500217	2500228	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_013891	CTAATA	2	12	2507816	2507827	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_013891	TTTTTA	2	12	2519547	2519558	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_013891	AGCTAT	2	12	2531180	2531191	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_013891	CGCCTA	2	12	2569267	2569278	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
113	NC_013891	TTTCCT	2	12	2571171	2571182	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_013891	TTGAAT	2	12	2572743	2572754	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_013891	TAAAAA	2	12	2579341	2579352	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_013891	TTATTT	2	12	2601551	2601562	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_013891	CCTCTT	2	12	2615949	2615960	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
118	NC_013891	ATTAAA	2	12	2716282	2716293	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_013891	CCTCAC	2	12	2754843	2754854	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
120	NC_013891	TAAATT	2	12	2763744	2763755	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_013891	ATTTTC	2	12	2770020	2770031	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.