MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Listeria seeligeri serovar 1/2b str. SLCC3954 chromosome

Total Repeats: 1172

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013891	ATTA	3	12	1811	1822	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013891	AATA	2	8	4513	4520	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013891	AAAG	2	8	6006	6013	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013891	AGAA	2	8	15936	15943	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013891	AGGA	2	8	24642	24649	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013891	TAAG	2	8	29688	29695	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_013891	CAAT	2	8	29831	29838	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_013891	GAAA	2	8	29927	29934	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_013891	AGAT	2	8	29952	29959	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_013891	CTAA	2	8	30033	30040	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_013891	AGAA	2	8	30236	30243	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_013891	TATG	2	8	31804	31811	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013891	AGTG	2	8	31979	31986	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_013891	AATA	2	8	32687	32694	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_013891	GCTC	2	8	34133	34140	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
16	NC_013891	CATA	2	8	37241	37248	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_013891	TATG	2	8	45041	45048	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_013891	TTAT	2	8	45056	45063	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_013891	TATT	2	8	45078	45085	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_013891	CATA	2	8	45488	45495	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_013891	GAGT	2	8	58986	58993	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_013891	AAAG	2	8	69911	69918	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_013891	GGAA	2	8	71826	71833	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_013891	GAAA	2	8	71844	71851	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_013891	TACT	2	8	73472	73479	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_013891	TTTA	2	8	80499	80506	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_013891	AGCT	2	8	80884	80891	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
28	NC_013891	GCTA	2	8	82555	82562	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
29	NC_013891	ATAC	2	8	82783	82790	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_013891	TGGT	2	8	83156	83163	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_013891	TAAA	2	8	83778	83785	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_013891	GCTA	2	8	85324	85331	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
33	NC_013891	ACTA	2	8	85673	85680	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_013891	AAAT	2	8	85783	85790	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_013891	ATTG	2	8	89559	89566	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_013891	AACA	2	8	91901	91908	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_013891	CAAC	2	8	95031	95038	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_013891	CTTT	2	8	97881	97888	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_013891	GAAT	2	8	97923	97930	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_013891	CACT	2	8	100394	100401	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_013891	AATT	2	8	101672	101679	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_013891	GAAT	2	8	113501	113508	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013891	TAAT	2	8	114903	114910	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_013891	GTTT	2	8	115027	115034	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_013891	ATAA	2	8	118170	118177	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_013891	TCTA	2	8	121146	121153	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_013891	TAAA	2	8	121241	121248	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_013891	ATAA	2	8	122034	122041	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_013891	TAAT	2	8	130002	130009	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_013891	TTTA	2	8	135894	135901	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_013891	CTTT	2	8	136018	136025	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_013891	TTAA	2	8	141581	141588	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_013891	AAAC	2	8	141599	141606	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_013891	GGGT	2	8	141618	141625	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
55	NC_013891	AAAT	2	8	143406	143413	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_013891	TCAT	2	8	149011	149018	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_013891	TACT	2	8	153137	153144	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_013891	AAGT	2	8	153159	153166	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_013891	AGTA	2	8	157494	157501	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_013891	AAGG	2	8	157536	157543	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_013891	ATTT	2	8	170936	170943	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_013891	TCAC	2	8	171973	171980	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_013891	GAAT	2	8	171996	172003	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_013891	TTGC	2	8	175269	175276	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
65	NC_013891	TTTG	2	8	176163	176170	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_013891	TCAT	2	8	176466	176473	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_013891	CTTC	2	8	183882	183889	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_013891	GATA	2	8	184110	184117	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_013891	TAAA	2	8	188469	188476	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_013891	AAGC	2	8	188501	188508	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
71	NC_013891	AAAT	2	8	188732	188739	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_013891	TAAA	2	8	191209	191216	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_013891	TGTT	2	8	193422	193429	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_013891	AAAT	2	8	193517	193524	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_013891	GTAG	2	8	193544	193551	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_013891	ATTT	2	8	193862	193869	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_013891	TAAA	2	8	193913	193920	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_013891	GTTT	2	8	196800	196807	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_013891	TCTT	2	8	202973	202980	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
80	NC_013891	GAAT	2	8	203011	203018	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_013891	TCAG	2	8	206589	206596	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
82	NC_013891	GGGA	2	8	208720	208727	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
83	NC_013891	AATT	2	8	209708	209715	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_013891	GAAG	2	8	209792	209799	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_013891	ATTA	2	8	211758	211765	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_013891	AATA	2	8	211915	211922	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_013891	TTAA	2	8	216038	216045	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_013891	TTAT	2	8	217059	217066	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_013891	AAAT	2	8	217073	217080	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_013891	AAAC	2	8	222433	222440	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
91	NC_013891	CGAA	2	8	222587	222594	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
92	NC_013891	CCTG	2	8	222654	222661	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
93	NC_013891	ATGG	2	8	223770	223777	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_013891	AGCC	2	8	223988	223995	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
95	NC_013891	TGTT	2	8	224112	224119	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_013891	TGTT	2	8	224149	224156	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
97	NC_013891	AGAA	2	8	224542	224549	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
98	NC_013891	AAAG	2	8	224645	224652	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
99	NC_013891	TACT	2	8	225084	225091	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
100	NC_013891	CACG	2	8	225105	225112	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
101	NC_013891	AGTG	2	8	225844	225851	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
102	NC_013891	GGAA	2	8	225898	225905	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_013891	TAGG	2	8	226472	226479	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_013891	ATGG	2	8	226655	226662	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_013891	ATCG	2	8	227233	227240	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
106	NC_013891	AAAC	2	8	228450	228457	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
107	NC_013891	CGAA	2	8	228604	228611	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
108	NC_013891	CCTG	2	8	228671	228678	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
109	NC_013891	ATGG	2	8	229787	229794	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_013891	AGCC	2	8	230005	230012	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
111	NC_013891	TGTT	2	8	230129	230136	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
112	NC_013891	TGTT	2	8	230166	230173	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
113	NC_013891	AGAA	2	8	230559	230566	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
114	NC_013891	AAAG	2	8	230662	230669	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
115	NC_013891	TACT	2	8	231101	231108	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
116	NC_013891	CACG	2	8	231122	231129	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
117	NC_013891	AGTG	2	8	231861	231868	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_013891	GGAA	2	8	231915	231922	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_013891	TAGG	2	8	232489	232496	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_013891	ATGG	2	8	232672	232679	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_013891	ATCG	2	8	233250	233257	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
122	NC_013891	ATAA	2	8	233512	233519	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_013891	TATG	2	8	239706	239713	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
124	NC_013891	CAAA	2	8	248447	248454	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
125	NC_013891	TACT	2	8	248482	248489	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
126	NC_013891	ACAA	2	8	251568	251575	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
127	NC_013891	TTTG	2	8	252593	252600	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
128	NC_013891	AATC	2	8	255658	255665	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
129	NC_013891	TCTT	2	8	255758	255765	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
130	NC_013891	AGAA	2	8	255798	255805	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_013891	TAAA	2	8	257268	257275	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_013891	CTTT	2	8	257313	257320	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
133	NC_013891	AATT	2	8	257563	257570	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_013891	TAAA	2	8	268340	268347	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_013891	ACTA	2	8	268361	268368	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
136	NC_013891	CAAG	2	8	273807	273814	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
137	NC_013891	CTAT	2	8	276383	276390	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
138	NC_013891	AAAG	2	8	277102	277109	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
139	NC_013891	TAAA	2	8	277456	277463	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_013891	GGCT	2	8	280473	280480	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
141	NC_013891	TAAT	2	8	281774	281781	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_013891	TAAA	2	8	288909	288916	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_013891	GTTA	2	8	288988	288995	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
144	NC_013891	ATGA	2	8	290485	290492	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
145	NC_013891	CTTA	2	8	291289	291296	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
146	NC_013891	ATAA	2	8	291307	291314	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_013891	TAAA	2	8	299159	299166	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_013891	TAGA	2	8	300536	300543	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
149	NC_013891	AATT	2	8	301505	301512	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_013891	GATG	2	8	314793	314800	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
151	NC_013891	AGTC	2	8	315284	315291	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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