MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Listeria monocytogenes 08-5923

Total Repeats: 362

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013768	ATATG	2	10	690	699	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013768	GGTTC	2	10	3000	3009	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
3	NC_013768	AGAAC	2	10	30720	30729	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
4	NC_013768	GATTT	2	10	65264	65273	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013768	TAGAA	2	10	66279	66288	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013768	TAAAA	2	10	82411	82420	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_013768	AGTTA	2	10	83910	83919	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_013768	TATTT	2	10	84483	84492	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_013768	AATAT	2	10	122375	122384	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_013768	CTATT	2	10	139418	139427	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
11	NC_013768	CTATA	2	10	140459	140468	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
12	NC_013768	ATCCA	2	10	146647	146656	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
13	NC_013768	AGCCC	2	10	155545	155554	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
14	NC_013768	AAAAG	2	10	157153	157162	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
15	NC_013768	CTTAT	2	10	159220	159229	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
16	NC_013768	TTTTA	2	10	165398	165407	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_013768	TTTAA	2	10	173098	173107	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_013768	GAAAC	2	10	181185	181194	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
19	NC_013768	ATTTT	2	10	211455	211464	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_013768	AAAAT	2	10	231064	231073	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_013768	TCTAA	2	10	231159	231168	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
22	NC_013768	TTGTA	2	10	231380	231389	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_013768	ACCTG	2	10	247286	247295	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
24	NC_013768	CTATT	2	10	257743	257752	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
25	NC_013768	GTTTT	2	10	257825	257834	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_013768	AAATA	2	10	259174	259183	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_013768	CCTTG	2	10	259367	259376	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
28	NC_013768	AACGA	2	10	259413	259422	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
29	NC_013768	TAATT	2	10	263797	263806	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_013768	TCGTG	2	10	264956	264965	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
31	NC_013768	AAGGT	2	10	266675	266684	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
32	NC_013768	GGCAT	2	10	283966	283975	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
33	NC_013768	AGTGA	2	10	306389	306398	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
34	NC_013768	AAAGA	2	10	324236	324245	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
35	NC_013768	ATTCG	2	10	346653	346662	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
36	NC_013768	ATTTG	2	10	349281	349290	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_013768	TAGAT	2	10	349321	349330	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_013768	ATTGT	2	10	366738	366747	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_013768	TGAAA	2	10	367478	367487	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NC_013768	AGATT	2	10	376677	376686	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
41	NC_013768	ATAGA	2	10	377841	377850	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
42	NC_013768	AAATG	2	10	384664	384673	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013768	CACAC	2	10	385598	385607	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
44	NC_013768	AAATT	2	10	386232	386241	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_013768	GTGAT	2	10	399397	399406	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
46	NC_013768	AAATT	2	10	420812	420821	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_013768	GAAAG	2	10	443885	443894	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
48	NC_013768	AGGTG	2	10	451738	451747	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
49	NC_013768	CTTAT	2	10	473769	473778	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
50	NC_013768	TTTAT	2	10	492723	492732	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_013768	TTTCT	2	10	497097	497106	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
52	NC_013768	AATTT	2	10	504539	504548	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_013768	ATAGT	2	10	504574	504583	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
54	NC_013768	ATAGT	2	10	506792	506801	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
55	NC_013768	TTATT	2	10	508498	508507	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_013768	CTATG	2	10	508664	508673	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
57	NC_013768	CTAAT	2	10	510094	510103	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
58	NC_013768	ATACA	2	10	515229	515238	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
59	NC_013768	CAATC	2	10	515734	515743	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
60	NC_013768	ATAAA	2	10	527388	527397	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_013768	AAACA	2	10	542411	542420	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
62	NC_013768	TAATT	2	10	547677	547686	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_013768	TATAG	2	10	560616	560625	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
64	NC_013768	GAAAA	2	10	566219	566228	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
65	NC_013768	AATTA	2	10	581167	581176	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_013768	AAAAC	2	10	588356	588365	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
67	NC_013768	CTATG	2	10	595780	595789	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
68	NC_013768	AAAGA	2	10	601234	601243	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_013768	ATAAA	2	10	616204	616213	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_013768	TAGTA	2	10	617326	617335	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
71	NC_013768	AATCA	2	10	620185	620194	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
72	NC_013768	ATTGA	2	10	628177	628186	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
73	NC_013768	ATTAA	2	10	641488	641497	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_013768	TTATG	2	10	663084	663093	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
75	NC_013768	TAAAA	2	10	665007	665016	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_013768	GAAAT	2	10	672617	672626	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
77	NC_013768	ATCAA	2	10	681153	681162	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
78	NC_013768	ATTTT	2	10	681172	681181	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_013768	TAAAA	2	10	682171	682180	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_013768	ATGTT	2	10	683790	683799	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
81	NC_013768	TTACT	2	10	707282	707291	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
82	NC_013768	ATTTT	2	10	713241	713250	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_013768	GGGGA	2	10	722689	722698	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
84	NC_013768	TATTT	2	10	728926	728935	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_013768	AGAGA	2	10	729077	729086	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
86	NC_013768	CTTTT	2	10	730052	730061	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
87	NC_013768	TAAAA	2	10	781344	781353	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_013768	CTTTT	2	10	788067	788076	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
89	NC_013768	TAGTT	2	10	788080	788089	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
90	NC_013768	TGAAA	2	10	806969	806978	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
91	NC_013768	ATAGA	2	10	809026	809035	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
92	NC_013768	TTTCT	2	10	825811	825820	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
93	NC_013768	GTATA	2	10	842163	842172	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
94	NC_013768	AATTA	2	10	842784	842793	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_013768	TAATA	2	10	844826	844835	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_013768	AATAA	2	10	846578	846587	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_013768	ATTTT	2	10	850164	850173	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_013768	TTTTG	2	10	857441	857450	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
99	NC_013768	AGGAA	2	10	865988	865997	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
100	NC_013768	CAAAT	2	10	867645	867654	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
101	NC_013768	TTTAC	2	10	870943	870952	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
102	NC_013768	ATAGA	2	10	886821	886830	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
103	NC_013768	ATCTT	2	10	888001	888010	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
104	NC_013768	ATTTT	2	10	892480	892489	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_013768	AATGT	2	10	899883	899892	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
106	NC_013768	AACAA	2	10	913645	913654	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
107	NC_013768	TTATA	2	10	923630	923639	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_013768	GAAAG	2	10	939871	939880	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
109	NC_013768	TTTTA	2	10	940324	940333	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_013768	ATAGA	2	10	944236	944245	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
111	NC_013768	GAAAA	2	10	951342	951351	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
112	NC_013768	TATAA	2	10	958496	958505	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_013768	TTTAT	2	10	973685	973694	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_013768	ATGAG	2	10	994459	994468	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
115	NC_013768	TTTTA	2	10	1001586	1001595	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_013768	TAAAA	2	10	1001651	1001660	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_013768	TATAA	2	10	1016121	1016130	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_013768	TGACG	2	10	1017799	1017808	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
119	NC_013768	AGATA	2	10	1032587	1032596	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
120	NC_013768	GAGAG	2	10	1041533	1041542	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
121	NC_013768	TTCTA	2	10	1046204	1046213	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
122	NC_013768	TTTTC	2	10	1050088	1050097	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
123	NC_013768	GTTTT	2	10	1059984	1059993	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
124	NC_013768	TTTAG	2	10	1062389	1062398	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
125	NC_013768	ATAAA	2	10	1062408	1062417	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_013768	TAAAA	2	10	1062419	1062428	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_013768	ACTAA	2	10	1062530	1062539	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
128	NC_013768	TAGGA	2	10	1076987	1076996	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
129	NC_013768	GTTTT	2	10	1076997	1077006	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
130	NC_013768	TAAAC	2	10	1081010	1081019	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
131	NC_013768	CTTTT	2	10	1081495	1081504	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
132	NC_013768	AAAGC	2	10	1087426	1087435	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
133	NC_013768	TTATT	2	10	1087469	1087478	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_013768	AAGTT	2	10	1095593	1095602	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
135	NC_013768	ATAAA	2	10	1095647	1095656	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_013768	GCTAT	2	10	1096519	1096528	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
137	NC_013768	TATAT	2	10	1098623	1098632	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_013768	TTAAT	2	10	1129292	1129301	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_013768	TAATG	2	10	1142433	1142442	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
140	NC_013768	AAATA	2	10	1189510	1189519	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_013768	TAAAC	2	10	1204560	1204569	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
142	NC_013768	TAAAA	2	10	1224844	1224853	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_013768	ATTTA	2	10	1224872	1224881	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_013768	TAGTT	2	10	1235541	1235550	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
145	NC_013768	GTGAT	2	10	1262959	1262968	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
146	NC_013768	ACATC	2	10	1269375	1269384	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
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286	NC_013768	ATATA	2	10	2478705	2478714	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
287	NC_013768	CTTTT	2	10	2480902	2480911	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
288	NC_013768	TCACT	2	10	2484901	2484910	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
289	NC_013768	CTATA	2	10	2500335	2500344	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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295	NC_013768	AATTT	2	10	2553308	2553317	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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331	NC_013768	CTATT	2	10	2760646	2760655	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
332	NC_013768	TTTTC	2	10	2763735	2763744	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
333	NC_013768	TTTTC	2	10	2763938	2763947	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.