MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Listeria monocytogenes 08-5578 chromosome

Total Repeats: 366

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013766	ATATG	2	10	690	699	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013766	GGTTC	2	10	3000	3009	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
3	NC_013766	AGAAC	2	10	30720	30729	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
4	NC_013766	GATTT	2	10	65264	65273	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013766	TAGAA	2	10	66279	66288	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013766	TAAAA	2	10	82411	82420	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_013766	AGTTA	2	10	83910	83919	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_013766	TATTT	2	10	84483	84492	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_013766	AATAT	2	10	122375	122384	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_013766	AAGTC	2	10	139014	139023	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
11	NC_013766	CTATT	2	10	139418	139427	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
12	NC_013766	CTATA	2	10	140459	140468	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
13	NC_013766	ATCCA	2	10	146647	146656	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
14	NC_013766	AGCCC	2	10	155545	155554	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
15	NC_013766	AAAAG	2	10	157153	157162	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
16	NC_013766	CTTAT	2	10	159220	159229	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
17	NC_013766	TTTTA	2	10	165398	165407	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_013766	TTTAA	2	10	173098	173107	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_013766	GAAAC	2	10	181185	181194	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
20	NC_013766	ATTTT	2	10	211455	211464	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_013766	AAAAT	2	10	231064	231073	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_013766	TCTAA	2	10	231159	231168	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
23	NC_013766	TTGTA	2	10	231380	231389	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_013766	ACCTG	2	10	247286	247295	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
25	NC_013766	CTATT	2	10	257743	257752	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
26	NC_013766	GTTTT	2	10	257825	257834	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
27	NC_013766	AAATA	2	10	259174	259183	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_013766	CCTTG	2	10	259367	259376	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
29	NC_013766	AACGA	2	10	259413	259422	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
30	NC_013766	TAATT	2	10	263797	263806	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_013766	TCGTG	2	10	264956	264965	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
32	NC_013766	AAGGT	2	10	266675	266684	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
33	NC_013766	GGCAT	2	10	283945	283954	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
34	NC_013766	AGTGA	2	10	306368	306377	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
35	NC_013766	AAAGA	2	10	324215	324224	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
36	NC_013766	ATTCG	2	10	346632	346641	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
37	NC_013766	ATTTG	2	10	349260	349269	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_013766	TAGAT	2	10	349300	349309	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_013766	ATTGT	2	10	366717	366726	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NC_013766	TGAAA	2	10	367457	367466	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
41	NC_013766	AGATT	2	10	376656	376665	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
42	NC_013766	ATAGA	2	10	377820	377829	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013766	AAATG	2	10	384643	384652	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
44	NC_013766	CACAC	2	10	385577	385586	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
45	NC_013766	AAATT	2	10	386211	386220	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_013766	GTGAT	2	10	399376	399385	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
47	NC_013766	AAATT	2	10	420791	420800	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_013766	GAAAG	2	10	443864	443873	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
49	NC_013766	AGGTG	2	10	451717	451726	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
50	NC_013766	CTTAT	2	10	473748	473757	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
51	NC_013766	TTTAT	2	10	492702	492711	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_013766	TTTCT	2	10	497076	497085	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
53	NC_013766	AATTT	2	10	504518	504527	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_013766	ATAGT	2	10	504553	504562	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
55	NC_013766	ATAGT	2	10	506771	506780	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
56	NC_013766	TTATT	2	10	508477	508486	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_013766	CTATG	2	10	508643	508652	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
58	NC_013766	CTAAT	2	10	510073	510082	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
59	NC_013766	ATACA	2	10	515208	515217	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
60	NC_013766	CAATC	2	10	515713	515722	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
61	NC_013766	ATAAA	2	10	527367	527376	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_013766	AAACA	2	10	542390	542399	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
63	NC_013766	TAATT	2	10	547656	547665	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_013766	TATAG	2	10	560595	560604	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
65	NC_013766	GAAAA	2	10	566198	566207	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
66	NC_013766	AATTA	2	10	581146	581155	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_013766	AAAAC	2	10	588335	588344	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
68	NC_013766	CTATG	2	10	595759	595768	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
69	NC_013766	AAAGA	2	10	601213	601222	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
70	NC_013766	ATAAA	2	10	616183	616192	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_013766	TAGTA	2	10	617305	617314	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
72	NC_013766	AATCA	2	10	620164	620173	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
73	NC_013766	ATTGA	2	10	628156	628165	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
74	NC_013766	ATTAA	2	10	641467	641476	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_013766	TTATG	2	10	663063	663072	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
76	NC_013766	TAAAA	2	10	664986	664995	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_013766	GAAAT	2	10	672596	672605	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
78	NC_013766	AAATT	2	10	692007	692016	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_013766	TTTGA	2	10	693553	693562	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
80	NC_013766	AAGTA	2	10	693565	693574	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
81	NC_013766	ATCAA	2	10	714449	714458	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
82	NC_013766	ATTTT	2	10	714468	714477	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_013766	TAAAA	2	10	715467	715476	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_013766	ATGTT	2	10	717086	717095	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
85	NC_013766	TTACT	2	10	740578	740587	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
86	NC_013766	ATTTT	2	10	746537	746546	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_013766	GGGGA	2	10	755985	755994	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
88	NC_013766	TATTT	2	10	762222	762231	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_013766	AGAGA	2	10	762373	762382	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
90	NC_013766	CTTTT	2	10	763348	763357	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
91	NC_013766	TAAAA	2	10	814640	814649	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_013766	CTTTT	2	10	821363	821372	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
93	NC_013766	TAGTT	2	10	821376	821385	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
94	NC_013766	TGAAA	2	10	840265	840274	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
95	NC_013766	ATAGA	2	10	842322	842331	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
96	NC_013766	TTTCT	2	10	859107	859116	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
97	NC_013766	GTATA	2	10	875459	875468	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
98	NC_013766	AATTA	2	10	876080	876089	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_013766	TAATA	2	10	878122	878131	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_013766	AATAA	2	10	879874	879883	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_013766	ATTTT	2	10	883460	883469	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_013766	TTTTG	2	10	890737	890746	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
103	NC_013766	AGGAA	2	10	899284	899293	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
104	NC_013766	CAAAT	2	10	900941	900950	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
105	NC_013766	TTTAC	2	10	904239	904248	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
106	NC_013766	ATAGA	2	10	920117	920126	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
107	NC_013766	ATCTT	2	10	921297	921306	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
108	NC_013766	ATTTT	2	10	925776	925785	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_013766	AATGT	2	10	933179	933188	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
110	NC_013766	AACAA	2	10	946941	946950	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
111	NC_013766	TTATA	2	10	956926	956935	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_013766	GAAAG	2	10	973167	973176	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
113	NC_013766	TTTTA	2	10	973620	973629	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_013766	ATAGA	2	10	977532	977541	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
115	NC_013766	GAAAA	2	10	984638	984647	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
116	NC_013766	TATAA	2	10	991792	991801	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_013766	TTTAT	2	10	1006981	1006990	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_013766	ATGAG	2	10	1027755	1027764	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
119	NC_013766	TTTTA	2	10	1034882	1034891	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_013766	TAAAA	2	10	1034947	1034956	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_013766	TATAA	2	10	1049417	1049426	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_013766	TGACG	2	10	1051095	1051104	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
123	NC_013766	AGATA	2	10	1065883	1065892	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
124	NC_013766	GAGAG	2	10	1074829	1074838	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
125	NC_013766	TTCTA	2	10	1079500	1079509	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
126	NC_013766	TTTTC	2	10	1083384	1083393	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
127	NC_013766	GTTTT	2	10	1093280	1093289	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
128	NC_013766	TTTAG	2	10	1095685	1095694	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
129	NC_013766	ATAAA	2	10	1095704	1095713	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_013766	TAAAA	2	10	1095715	1095724	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_013766	ACTAA	2	10	1095826	1095835	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
132	NC_013766	TAGGA	2	10	1110283	1110292	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
133	NC_013766	GTTTT	2	10	1110293	1110302	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
134	NC_013766	TAAAC	2	10	1114306	1114315	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
135	NC_013766	CTTTT	2	10	1114791	1114800	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
136	NC_013766	AAAGC	2	10	1120722	1120731	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
137	NC_013766	TTATT	2	10	1120765	1120774	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_013766	AAGTT	2	10	1128889	1128898	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
139	NC_013766	ATAAA	2	10	1128943	1128952	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_013766	GCTAT	2	10	1129815	1129824	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
141	NC_013766	TATAT	2	10	1131919	1131928	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_013766	TTAAT	2	10	1162588	1162597	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_013766	TAATG	2	10	1175729	1175738	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
144	NC_013766	AAATA	2	10	1222806	1222815	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_013766	TAAAC	2	10	1237856	1237865	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
146	NC_013766	TAAAA	2	10	1258140	1258149	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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286	NC_013766	TAACA	2	10	2468476	2468485	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
287	NC_013766	TAAAA	2	10	2478357	2478366	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
288	NC_013766	ATTTT	2	10	2501308	2501317	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
289	NC_013766	AAATT	2	10	2510400	2510409	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
290	NC_013766	ATATA	2	10	2511974	2511983	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
291	NC_013766	CTTTT	2	10	2514171	2514180	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
292	NC_013766	TCACT	2	10	2518170	2518179	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
293	NC_013766	CTATA	2	10	2533604	2533613	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
294	NC_013766	TTACC	2	10	2555121	2555130	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
295	NC_013766	CACGA	2	10	2556842	2556851	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
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298	NC_013766	AACAC	2	10	2583967	2583976	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
299	NC_013766	AATTT	2	10	2586260	2586269	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
300	NC_013766	TTATT	2	10	2593983	2593992	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
301	NC_013766	TATTT	2	10	2599435	2599444	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
302	NC_013766	TCCTC	2	10	2603833	2603842	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
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314	NC_013766	TGCTG	2	10	2699522	2699531	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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320	NC_013766	CTTTT	2	10	2738726	2738735	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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322	NC_013766	AAGTC	2	10	2752171	2752180	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
323	NC_013766	TTTAT	2	10	2752181	2752190	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
324	NC_013766	AAAAG	2	10	2752973	2752982	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
325	NC_013766	ATTAT	2	10	2755342	2755351	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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327	NC_013766	TGGAA	2	10	2765546	2765555	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
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329	NC_013766	TTATA	2	10	2781051	2781060	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
330	NC_013766	TTTTA	2	10	2781467	2781476	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
331	NC_013766	CACCC	2	10	2784873	2784882	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
332	NC_013766	TTACC	2	10	2789083	2789092	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
333	NC_013766	CACGA	2	10	2790553	2790562	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
334	NC_013766	AATTA	2	10	2791712	2791721	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
335	NC_013766	CTATT	2	10	2793598	2793607	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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343	NC_013766	TTTTG	2	10	2829058	2829067	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
344	NC_013766	GACAA	2	10	2829424	2829433	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
345	NC_013766	TCTAT	2	10	2834949	2834958	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
346	NC_013766	TTTTG	2	10	2856014	2856023	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
347	NC_013766	TTTAG	2	10	2860913	2860922	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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349	NC_013766	TTCTA	2	10	2873193	2873202	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
350	NC_013766	CTTAT	2	10	2879090	2879099	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
351	NC_013766	CGTTA	2	10	2883896	2883905	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
352	NC_013766	ACTTT	2	10	2906415	2906424	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
353	NC_013766	CAGTA	2	10	2908654	2908663	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
354	NC_013766	TCTCT	2	10	2910094	2910103	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
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361	NC_013766	CATAA	2	10	2973399	2973408	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
362	NC_013766	ACCAT	2	10	2978645	2978654	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
363	NC_013766	CTTTT	2	10	2980861	2980870	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
364	NC_013766	CAAGT	2	10	2980898	2980907	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.