MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Lactococcus lactis subsp. lactis KF147 plasmid pKF147A

Total Repeats: 78

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013657	GTTA	2	8	85	92	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013657	TCTT	2	8	494	501	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_013657	GAAA	2	8	511	518	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013657	TAAG	2	8	2103	2110	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013657	AATT	2	8	2119	2126	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013657	TGGT	2	8	2516	2523	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_013657	ATAA	2	8	2667	2674	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_013657	TCCT	2	8	6145	6152	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_013657	GAAT	2	8	6243	6250	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_013657	AGTA	2	8	6396	6403	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_013657	AAAT	2	8	6920	6927	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_013657	TTAT	2	8	7091	7098	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013657	CAAA	2	8	9394	9401	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_013657	AATT	2	8	9571	9578	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_013657	GCTT	2	8	10466	10473	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_013657	AGGA	2	8	11381	11388	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_013657	AGTT	2	8	11389	11396	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_013657	TTTA	2	8	11934	11941	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_013657	TTCT	2	8	12857	12864	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_013657	AAAT	2	8	13998	14005	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_013657	TATT	2	8	14948	14955	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_013657	GAGT	2	8	15170	15177	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_013657	TTAT	2	8	15431	15438	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_013657	TTCT	2	8	15464	15471	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_013657	TTGA	2	8	15582	15589	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_013657	GATT	2	8	15701	15708	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_013657	AAAC	2	8	16128	16135	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_013657	TAAA	2	8	16226	16233	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_013657	TTTC	2	8	16318	16325	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_013657	AAAT	2	8	16372	16379	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_013657	TTAT	2	8	16423	16430	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_013657	ACGA	2	8	18671	18678	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
33	NC_013657	AGAA	2	8	19057	19064	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_013657	TAAT	2	8	19479	19486	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_013657	TATT	2	8	20372	20379	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_013657	TAAA	2	8	20672	20679	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_013657	TATT	2	8	20689	20696	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_013657	ACTT	2	8	20707	20714	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_013657	TCAT	2	8	20907	20914	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_013657	GAAA	2	8	21862	21869	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_013657	AAAT	2	8	22076	22083	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_013657	ATCT	2	8	22284	22291	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_013657	TAGA	2	8	23212	23219	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_013657	ATTG	2	8	23408	23415	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_013657	ATAA	2	8	23455	23462	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_013657	TAAA	2	8	23553	23560	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_013657	CTAT	2	8	23703	23710	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
48	NC_013657	TAAA	2	8	23714	23721	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_013657	TAAA	2	8	25710	25717	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_013657	AAAT	2	8	26356	26363	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_013657	TCTT	2	8	27088	27095	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_013657	TTAA	2	8	27201	27208	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_013657	CGCT	2	8	27470	27477	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
54	NC_013657	GTTT	2	8	27780	27787	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_013657	TTGT	2	8	28748	28755	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_013657	TTAC	2	8	28881	28888	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_013657	ATTT	2	8	28970	28977	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_013657	TAAC	2	8	29066	29073	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
59	NC_013657	TCAT	2	8	29112	29119	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_013657	GTTT	2	8	29125	29132	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_013657	CATT	2	8	29536	29543	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_013657	TAAA	2	8	30520	30527	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_013657	TTGC	2	8	30571	30578	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
64	NC_013657	ATTA	2	8	31638	31645	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_013657	GCGG	2	8	31765	31772	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
66	NC_013657	AAGA	2	8	31794	31801	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_013657	AATG	2	8	32169	32176	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_013657	ATTA	2	8	33846	33853	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_013657	AATC	2	8	34031	34038	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
70	NC_013657	CATC	2	8	34096	34103	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_013657	ATGT	2	8	34175	34182	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_013657	CTAT	2	8	34217	34224	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
73	NC_013657	AAAC	2	8	34486	34493	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
74	NC_013657	GTTT	2	8	34507	34514	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_013657	AAGC	2	8	36645	36652	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
76	NC_013657	ATTT	2	8	36811	36818	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_013657	TTTC	2	8	37025	37032	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
78	NC_013657	GAAA	2	8	37449	37456	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.