MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Lactobacillus johnsonii FI9785 plasmid p9785L

Total Repeats: 129

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013505	ACT	2	6	49	54	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_013505	AGA	2	6	95	100	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013505	CAT	2	6	141	146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_013505	ATC	2	6	273	278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_013505	ATT	2	6	394	399	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013505	GCT	2	6	433	438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_013505	ACA	3	9	477	485	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_013505	GCA	2	6	522	527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_013505	TAG	2	6	566	571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_013505	AGA	3	9	633	641	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_013505	ATA	2	6	653	658	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_013505	TCA	2	6	675	680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_013505	ATG	2	6	734	739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_013505	GTA	2	6	1120	1125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_013505	TAG	2	6	1277	1282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_013505	AAG	2	6	2012	2017	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_013505	CTT	2	6	2040	2045	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_013505	AAT	2	6	2086	2091	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_013505	TTA	2	6	2351	2356	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_013505	TAA	2	6	2455	2460	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_013505	TCT	2	6	2593	2598	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_013505	TTA	2	6	4021	4026	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_013505	AAT	2	6	4057	4062	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_013505	AGT	2	6	4077	4082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_013505	GTA	2	6	4088	4093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_013505	AGG	2	6	4185	4190	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_013505	ATT	2	6	4225	4230	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_013505	TAA	2	6	4250	4255	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_013505	ATT	2	6	4332	4337	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_013505	AGG	2	6	5268	5273	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_013505	TGG	2	6	5290	5295	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_013505	CTT	2	6	5311	5316	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_013505	ATA	2	6	5358	5363	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_013505	CTT	2	6	5414	5419	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_013505	GAA	4	12	5492	5503	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_013505	AAT	2	6	5510	5515	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_013505	GTA	2	6	5523	5528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_013505	TTA	2	6	5610	5615	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_013505	ATT	2	6	5621	5626	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_013505	ATA	2	6	5686	5691	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_013505	TTG	2	6	5746	5751	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_013505	TCT	2	6	5769	5774	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_013505	TAA	3	9	5783	5791	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_013505	TTA	2	6	5799	5804	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_013505	TAT	2	6	5809	5814	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_013505	TGT	2	6	5836	5841	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_013505	ATT	2	6	5881	5886	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_013505	TAC	2	6	6122	6127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_013505	GAG	2	6	6155	6160	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_013505	AAT	2	6	6192	6197	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_013505	CTA	2	6	6888	6893	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_013505	GTA	2	6	6945	6950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_013505	AAT	2	6	8555	8560	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_013505	GTA	2	6	8577	8582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_013505	TTC	2	6	9434	9439	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_013505	ACA	2	6	9452	9457	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_013505	TTA	2	6	9590	9595	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_013505	ATA	2	6	9605	9610	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_013505	AAT	2	6	9612	9617	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_013505	ATT	2	6	9637	9642	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_013505	TAC	2	6	9660	9665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_013505	ATA	2	6	9714	9719	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_013505	ATC	2	6	10334	10339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_013505	AGA	2	6	10340	10345	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_013505	TTG	2	6	10366	10371	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_013505	TAG	2	6	10375	10380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_013505	CAT	3	9	10395	10403	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_013505	TGA	2	6	10404	10409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_013505	AAT	2	6	10975	10980	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_013505	TCC	2	6	11065	11070	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_013505	TTA	2	6	11086	11091	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_013505	TAT	3	9	11181	11189	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_013505	ATT	2	6	12882	12887	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_013505	AAT	2	6	12909	12914	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_013505	CAG	2	6	12923	12928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_013505	TAC	2	6	12940	12945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_013505	ACA	2	6	12984	12989	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_013505	CGC	2	6	13107	13112	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
79	NC_013505	CGT	2	6	13126	13131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_013505	AGT	2	6	13258	13263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_013505	ACT	2	6	13272	13277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_013505	ATT	2	6	13304	13309	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_013505	CGC	2	6	13391	13396	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
84	NC_013505	TAC	2	6	13522	13527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_013505	CCA	2	6	13568	13573	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_013505	GTT	2	6	13591	13596	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_013505	GAT	2	6	13701	13706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_013505	AAT	2	6	14834	14839	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_013505	TTA	2	6	14857	14862	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_013505	TAT	2	6	14896	14901	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_013505	AAT	2	6	14915	14920	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_013505	AGT	2	6	15056	15061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_013505	AAC	2	6	15069	15074	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_013505	TAT	2	6	15111	15116	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_013505	ATT	2	6	15133	15138	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_013505	ATT	2	6	15174	15179	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_013505	GAA	2	6	15238	15243	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_013505	AGA	2	6	15337	15342	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_013505	AAC	2	6	15563	15568	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_013505	CAA	2	6	15660	15665	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_013505	ATT	2	6	15706	15711	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_013505	ATC	2	6	15834	15839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_013505	AGC	2	6	16056	16061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_013505	CCG	2	6	16127	16132	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
105	NC_013505	GCT	2	6	16189	16194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_013505	ATC	2	6	16204	16209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_013505	AGA	2	6	16253	16258	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_013505	GAG	2	6	16311	16316	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_013505	GAA	2	6	16362	16367	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_013505	TAA	2	6	16509	16514	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_013505	GGT	2	6	16686	16691	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_013505	TAA	2	6	16804	16809	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_013505	TTA	2	6	16846	16851	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_013505	TTG	2	6	16885	16890	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_013505	ACT	2	6	17028	17033	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_013505	TAC	2	6	17566	17571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_013505	TCC	2	6	17917	17922	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
118	NC_013505	ATG	2	6	18231	18236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_013505	CAT	2	6	18266	18271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_013505	ATT	2	6	18292	18297	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_013505	TAG	2	6	18378	18383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_013505	AGT	2	6	18395	18400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_013505	TAC	2	6	18422	18427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_013505	AAT	2	6	25461	25466	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_013505	TAA	2	6	25480	25485	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_013505	TAT	2	6	25512	25517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_013505	TTA	2	6	25538	25543	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_013505	ATA	2	6	25609	25614	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_013505	ATT	2	6	25634	25639	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.