MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Lactobacillus johnsonii FI9785 chromosome

Total Repeats: 786

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013504	TAAA	2	8	1505	1512	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013504	GAAA	2	8	3034	3041	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013504	ATTT	2	8	3086	3093	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013504	TGCT	2	8	11005	11012	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_013504	AAGC	2	8	11026	11033	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6	NC_013504	AGGA	2	8	11098	11105	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_013504	ATTA	2	8	14995	15002	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_013504	TAAA	2	8	19431	19438	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_013504	ATAA	2	8	19495	19502	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_013504	TAAT	2	8	21238	21245	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_013504	TTTC	2	8	22211	22218	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_013504	ATCA	2	8	22241	22248	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_013504	GGAA	2	8	22254	22261	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_013504	TCAT	2	8	22300	22307	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_013504	TAAT	2	8	22849	22856	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_013504	CTTT	2	8	27766	27773	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_013504	GATT	2	8	28235	28242	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_013504	CTTG	2	8	29298	29305	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
19	NC_013504	CATT	2	8	29346	29353	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_013504	TTTC	2	8	33209	33216	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_013504	AGAT	2	8	35285	35292	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_013504	TTTA	2	8	36145	36152	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_013504	GTAA	2	8	38424	38431	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_013504	AAGA	2	8	39976	39983	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_013504	AATC	2	8	41287	41294	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_013504	TAGC	2	8	41318	41325	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
27	NC_013504	AATC	2	8	41328	41335	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_013504	TTAA	2	8	47011	47018	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_013504	ATTA	2	8	48231	48238	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_013504	CTTT	2	8	50893	50900	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_013504	TAAG	2	8	52823	52830	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_013504	AGAT	2	8	52858	52865	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_013504	TAAA	2	8	57095	57102	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_013504	AAAC	2	8	57260	57267	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_013504	TAAA	2	8	58198	58205	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_013504	ATAA	2	8	63503	63510	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_013504	TTCT	2	8	65685	65692	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_013504	TAAT	2	8	65813	65820	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_013504	TAAA	2	8	74640	74647	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_013504	TTTA	2	8	76055	76062	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_013504	TAAA	2	8	77993	78000	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_013504	ATTT	2	8	81921	81928	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013504	TTGT	2	8	88189	88196	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_013504	CTTT	2	8	88281	88288	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_013504	AAAT	2	8	88405	88412	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_013504	TAAA	2	8	90934	90941	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_013504	GAAA	2	8	91074	91081	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_013504	ATTT	2	8	91174	91181	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_013504	TTTC	2	8	91852	91859	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_013504	CTTT	2	8	93589	93596	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_013504	TAAA	2	8	93664	93671	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_013504	GTTA	2	8	93674	93681	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_013504	AAAC	2	8	99267	99274	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_013504	TAAA	2	8	99298	99305	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_013504	ACGC	2	8	99381	99388	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
56	NC_013504	AAGG	2	8	102574	102581	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_013504	AAGT	2	8	103831	103838	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_013504	CTTA	2	8	104019	104026	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
59	NC_013504	ACAA	2	8	105263	105270	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_013504	AATT	2	8	105282	105289	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_013504	AAGG	2	8	107566	107573	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_013504	AAGT	2	8	108515	108522	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_013504	ATTA	2	8	108646	108653	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_013504	GTAA	2	8	108762	108769	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_013504	ATTT	2	8	111482	111489	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_013504	TAAG	2	8	111501	111508	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_013504	AATT	2	8	127428	127435	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_013504	TAAT	2	8	137107	137114	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_013504	GATC	2	8	137721	137728	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
70	NC_013504	GAAC	2	8	137810	137817	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
71	NC_013504	TAAA	2	8	138999	139006	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_013504	TTTG	2	8	165163	165170	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_013504	TTTA	2	8	165176	165183	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_013504	ATTT	2	8	165196	165203	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_013504	AATA	2	8	169117	169124	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_013504	ATTA	2	8	169236	169243	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_013504	ATAA	2	8	171290	171297	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_013504	CTTA	2	8	172989	172996	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
79	NC_013504	ATAA	2	8	173360	173367	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_013504	TGTT	2	8	173760	173767	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_013504	GGAG	2	8	173818	173825	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
82	NC_013504	TATC	2	8	183549	183556	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
83	NC_013504	TATC	2	8	184065	184072	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
84	NC_013504	TAGT	2	8	184155	184162	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_013504	AGCT	2	8	185246	185253	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
86	NC_013504	AATT	2	8	185274	185281	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_013504	GATA	2	8	187062	187069	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_013504	TAGA	2	8	188244	188251	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
89	NC_013504	CTAT	2	8	188523	188530	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
90	NC_013504	TTAA	2	8	188965	188972	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_013504	AGTA	2	8	189005	189012	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_013504	AAAG	2	8	189043	189050	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
93	NC_013504	TGAT	2	8	189083	189090	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
94	NC_013504	GTAA	2	8	192051	192058	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_013504	AATT	2	8	192866	192873	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_013504	GTGG	2	8	199896	199903	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
97	NC_013504	TGAA	2	8	204937	204944	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
98	NC_013504	CTTC	2	8	206590	206597	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_013504	TTTG	2	8	211482	211489	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
100	NC_013504	TCTA	2	8	211496	211503	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
101	NC_013504	AGCA	2	8	214235	214242	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
102	NC_013504	TAAA	2	8	214407	214414	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_013504	TTAA	2	8	214957	214964	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_013504	TACT	2	8	217884	217891	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
105	NC_013504	ATTT	2	8	217953	217960	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_013504	CTTT	2	8	220417	220424	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
107	NC_013504	CAGC	2	8	222815	222822	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
108	NC_013504	TGTT	2	8	222924	222931	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
109	NC_013504	GATA	2	8	229534	229541	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
110	NC_013504	TTAG	2	8	233144	233151	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
111	NC_013504	AAAC	2	8	236711	236718	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
112	NC_013504	TAAA	2	8	236756	236763	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_013504	ATTA	2	8	240864	240871	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_013504	TTTG	2	8	244469	244476	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
115	NC_013504	AAAT	2	8	247536	247543	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_013504	TGAA	2	8	247603	247610	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
117	NC_013504	AATT	2	8	253859	253866	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_013504	AAGA	2	8	256588	256595	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
119	NC_013504	AATG	2	8	264173	264180	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
120	NC_013504	AAAG	2	8	264215	264222	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
121	NC_013504	TGAA	2	8	264967	264974	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
122	NC_013504	TTCT	2	8	266806	266813	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
123	NC_013504	TAAT	2	8	267215	267222	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_013504	TTAT	2	8	268009	268016	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_013504	ATTA	2	8	268020	268027	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_013504	AGTA	2	8	268135	268142	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
127	NC_013504	TAAA	2	8	268161	268168	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_013504	TATT	2	8	269296	269303	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_013504	AAAT	2	8	270158	270165	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_013504	AAGT	2	8	270187	270194	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_013504	TAAG	2	8	270200	270207	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
132	NC_013504	AACA	2	8	270921	270928	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
133	NC_013504	GAAA	2	8	270973	270980	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
134	NC_013504	AGTA	2	8	271797	271804	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
135	NC_013504	TGTA	2	8	273386	273393	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
136	NC_013504	TATT	2	8	274845	274852	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_013504	GCTG	2	8	276368	276375	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
138	NC_013504	TATT	2	8	276378	276385	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_013504	TAGG	2	8	281342	281349	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
140	NC_013504	ATTT	2	8	281354	281361	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_013504	ATTT	2	8	287656	287663	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_013504	TAAT	2	8	287722	287729	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_013504	GTAA	2	8	287735	287742	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
144	NC_013504	GAAA	2	8	291876	291883	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
145	NC_013504	TTGT	2	8	334593	334600	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
146	NC_013504	AACT	2	8	340084	340091	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
147	NC_013504	AGAA	2	8	345476	345483	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
148	NC_013504	TCCA	2	8	345528	345535	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
149	NC_013504	TAAG	2	8	345550	345557	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
150	NC_013504	AATT	2	8	345641	345648	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_013504	ATTA	2	8	345675	345682	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_013504	GCTA	2	8	345710	345717	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
153	NC_013504	TTAT	2	8	345925	345932	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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