MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus johnsonii FI9785 chromosome

Total Repeats: 5379

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_013504	TAG	2	6	482454	482459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1502	NC_013504	AGT	2	6	482980	482985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1503	NC_013504	GAAA	2	8	483012	483019	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1504	NC_013504	T	6	6	483052	483057	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1505	NC_013504	GAAT	2	8	483083	483090	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_013504	TGG	2	6	483100	483105	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1507	NC_013504	C	7	7	484588	484594	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1508	NC_013504	TTG	2	6	484596	484601	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1509	NC_013504	TGATT	2	10	484605	484614	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_013504	A	6	6	485175	485180	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_013504	CTT	2	6	485657	485662	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1512	NC_013504	GTT	2	6	485671	485676	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1513	NC_013504	TGT	2	6	486961	486966	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1514	NC_013504	ATA	2	6	486984	486989	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_013504	ATAA	2	8	487004	487011	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1516	NC_013504	GTCT	2	8	488051	488058	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1517	NC_013504	T	6	6	490420	490425	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1518	NC_013504	A	6	6	491210	491215	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1519	NC_013504	A	7	7	491259	491265	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1520	NC_013504	T	6	6	491275	491280	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1521	NC_013504	ATA	2	6	491314	491319	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1522	NC_013504	AGA	2	6	491320	491325	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1523	NC_013504	TAA	2	6	491354	491359	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1524	NC_013504	ATT	2	6	492912	492917	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1525	NC_013504	ATT	2	6	492925	492930	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1526	NC_013504	AAT	2	6	492935	492940	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1527	NC_013504	TGATT	2	10	494479	494488	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
1528	NC_013504	T	6	6	494487	494492	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1529	NC_013504	AAC	2	6	494562	494567	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1530	NC_013504	ATT	2	6	494589	494594	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1531	NC_013504	TAT	2	6	494612	494617	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1532	NC_013504	T	6	6	495117	495122	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1533	NC_013504	ATA	2	6	495142	495147	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1534	NC_013504	TAG	2	6	496060	496065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1535	NC_013504	TAAT	2	8	496113	496120	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1536	NC_013504	T	6	6	496723	496728	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1538	NC_013504	TA	3	6	497557	497562	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1539	NC_013504	AT	3	6	497569	497574	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1540	NC_013504	AAG	2	6	497612	497617	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1541	NC_013504	ATT	2	6	497620	497625	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1542	NC_013504	A	8	8	499378	499385	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1543	NC_013504	A	6	6	499405	499410	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1544	NC_013504	T	7	7	499416	499422	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1545	NC_013504	A	6	6	499439	499444	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1546	NC_013504	T	6	6	499472	499477	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1547	NC_013504	TCC	2	6	500828	500833	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1548	NC_013504	TGAAA	2	10	500835	500844	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1549	NC_013504	TGA	2	6	500849	500854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1550	NC_013504	A	6	6	500862	500867	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1551	NC_013504	AGA	2	6	500879	500884	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1552	NC_013504	A	6	6	500922	500927	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1553	NC_013504	TCA	2	6	500977	500982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1554	NC_013504	TCTT	2	8	500990	500997	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1555	NC_013504	A	6	6	501017	501022	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1556	NC_013504	GTT	2	6	501051	501056	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1557	NC_013504	A	7	7	501078	501084	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1559	NC_013504	AAT	2	6	501150	501155	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1561	NC_013504	TAA	2	6	501206	501211	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1562	NC_013504	GTTA	2	8	501212	501219	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1563	NC_013504	AAC	2	6	502017	502022	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1564	NC_013504	AGG	2	6	502452	502457	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1565	NC_013504	TAA	2	6	503791	503796	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1566	NC_013504	TAT	2	6	503814	503819	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1567	NC_013504	A	7	7	503836	503842	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1568	NC_013504	ATTA	2	8	503852	503859	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1569	NC_013504	TATT	2	8	504492	504499	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1570	NC_013504	TAT	2	6	504821	504826	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1571	NC_013504	A	6	6	506264	506269	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1572	NC_013504	TTAG	2	8	506272	506279	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1573	NC_013504	GAT	2	6	506290	506295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1574	NC_013504	TAT	2	6	506553	506558	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1575	NC_013504	ATTA	2	8	506562	506569	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1576	NC_013504	ATATTT	2	12	506579	506590	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1578	NC_013504	CGCA	2	8	506602	506609	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1579	NC_013504	GATT	2	8	506617	506624	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1580	NC_013504	TTTA	2	8	506639	506646	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1581	NC_013504	ATG	2	6	506652	506657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1582	NC_013504	AATA	2	8	506661	506668	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1583	NC_013504	TAA	2	6	506678	506683	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1584	NC_013504	TAT	2	6	506712	506717	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1585	NC_013504	AAAT	2	8	506732	506739	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1586	NC_013504	T	6	6	506824	506829	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1590	NC_013504	AGG	2	6	508099	508104	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1592	NC_013504	T	7	7	511316	511322	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1593	NC_013504	A	6	6	511481	511486	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1594	NC_013504	TTA	2	6	511522	511527	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1595	NC_013504	GAA	2	6	511604	511609	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1596	NC_013504	AGTG	2	8	511615	511622	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1597	NC_013504	TGA	2	6	511677	511682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1601	NC_013504	T	6	6	512695	512700	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1602	NC_013504	TAAC	2	8	512763	512770	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1603	NC_013504	ATA	2	6	512857	512862	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1604	NC_013504	GA	3	6	514671	514676	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1605	NC_013504	T	7	7	516138	516144	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1606	NC_013504	TTTTA	2	10	516146	516155	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1607	NC_013504	ATC	2	6	516186	516191	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1608	NC_013504	AAGCT	2	10	517179	517188	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
1609	NC_013504	T	6	6	517198	517203	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1610	NC_013504	T	6	6	517218	517223	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1611	NC_013504	CTT	2	6	518218	518223	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1612	NC_013504	AAGC	2	8	518253	518260	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1613	NC_013504	TAC	2	6	518317	518322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1614	NC_013504	TAA	2	6	518342	518347	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1615	NC_013504	AGG	2	6	518432	518437	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1616	NC_013504	T	7	7	522114	522120	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1617	NC_013504	A	6	6	524508	524513	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1618	NC_013504	CTTAA	2	10	524540	524549	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1619	NC_013504	TGA	2	6	524563	524568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1620	NC_013504	A	6	6	524587	524592	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1621	NC_013504	AG	3	6	524755	524760	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1622	NC_013504	TAT	2	6	524799	524804	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1623	NC_013504	AAT	2	6	524853	524858	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1624	NC_013504	A	7	7	524859	524865	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1625	NC_013504	CTTTT	2	10	524943	524952	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
1626	NC_013504	ATA	2	6	525031	525036	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1627	NC_013504	A	6	6	525036	525041	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1628	NC_013504	TG	3	6	525724	525729	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1629	NC_013504	AGT	2	6	525730	525735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1630	NC_013504	ACC	2	6	525958	525963	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1631	NC_013504	GAA	2	6	525967	525972	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1632	NC_013504	CAT	2	6	526023	526028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1633	NC_013504	GAA	2	6	526049	526054	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1634	NC_013504	AAAG	2	8	527494	527501	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1635	NC_013504	CAG	2	6	527507	527512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1636	NC_013504	ATT	2	6	527514	527519	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1637	NC_013504	TCTTT	2	10	528500	528509	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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2000	NC_013504	TTTTA	2	10	627714	627723	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding

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