MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus johnsonii FI9785 chromosome

Total Repeats: 5379

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_013504	AGA	2	6	151924	151929	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
502	NC_013504	AGA	2	6	152004	152009	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
503	NC_013504	TTA	2	6	153260	153265	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
504	NC_013504	TCT	2	6	153296	153301	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
505	NC_013504	TATAA	2	10	153321	153330	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
506	NC_013504	T	7	7	154399	154405	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
507	NC_013504	A	6	6	154434	154439	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
508	NC_013504	AATAA	2	10	154452	154461	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
509	NC_013504	A	6	6	154460	154465	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
510	NC_013504	GTT	2	6	154469	154474	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
511	NC_013504	GGA	2	6	154480	154485	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
512	NC_013504	TA	3	6	157362	157367	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
513	NC_013504	CT	3	6	158193	158198	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
514	NC_013504	TAA	2	6	158219	158224	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
515	NC_013504	ACCTT	2	10	158245	158254	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
516	NC_013504	TAA	2	6	158270	158275	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
517	NC_013504	TTTTA	2	10	161212	161221	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
518	NC_013504	TAA	2	6	161237	161242	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
519	NC_013504	TAA	2	6	161246	161251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
520	NC_013504	TA	3	6	161262	161267	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
521	NC_013504	ACT	2	6	161268	161273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
522	NC_013504	AGG	2	6	161285	161290	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
523	NC_013504	TTA	2	6	161295	161300	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
524	NC_013504	T	6	6	163299	163304	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
525	NC_013504	ATT	2	6	163323	163328	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
526	NC_013504	AAT	2	6	163329	163334	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
527	NC_013504	TAA	2	6	165133	165138	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
528	NC_013504	TTA	2	6	165146	165151	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
529	NC_013504	TTTG	2	8	165163	165170	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
530	NC_013504	TTTA	2	8	165176	165183	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
531	NC_013504	ATTT	2	8	165196	165203	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
532	NC_013504	ATT	2	6	165208	165213	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
533	NC_013504	ATAGCT	2	12	165216	165227	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
534	NC_013504	TGTTA	2	10	165232	165241	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
535	NC_013504	AGG	2	6	165284	165289	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
536	NC_013504	A	6	6	165290	165295	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
537	NC_013504	AATA	2	8	169117	169124	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
538	NC_013504	A	6	6	169152	169157	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
539	NC_013504	T	7	7	169177	169183	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
540	NC_013504	ATTA	2	8	169236	169243	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
541	NC_013504	TAA	2	6	171261	171266	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
542	NC_013504	ATAA	2	8	171290	171297	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
543	NC_013504	A	6	6	171296	171301	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
544	NC_013504	T	6	6	171325	171330	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
545	NC_013504	TAA	2	6	171370	171375	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
546	NC_013504	CCT	2	6	172967	172972	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
547	NC_013504	CTTA	2	8	172989	172996	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
548	NC_013504	TTG	2	6	173025	173030	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
549	NC_013504	T	6	6	173045	173050	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
550	NC_013504	A	7	7	173101	173107	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
551	NC_013504	ATT	2	6	173123	173128	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
552	NC_013504	AAG	2	6	173234	173239	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
553	NC_013504	GAA	2	6	173252	173257	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
554	NC_013504	ATAA	2	8	173360	173367	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
555	NC_013504	T	6	6	173638	173643	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
556	NC_013504	TTA	2	6	173665	173670	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
557	NC_013504	T	6	6	173745	173750	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
558	NC_013504	TGTT	2	8	173760	173767	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
559	NC_013504	GGAG	2	8	173818	173825	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
560	NC_013504	GGA	3	9	175910	175918	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
561	NC_013504	T	6	6	175921	175926	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
562	NC_013504	AAG	2	6	177724	177729	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
563	NC_013504	CTA	2	6	177742	177747	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
564	NC_013504	TAA	2	6	177758	177763	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
565	NC_013504	CAA	2	6	177771	177776	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
566	NC_013504	ACT	2	6	177777	177782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
567	NC_013504	TAA	2	6	177800	177805	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
568	NC_013504	TGG	2	6	177845	177850	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
569	NC_013504	CAT	2	6	178097	178102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
570	NC_013504	T	6	6	178106	178111	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
571	NC_013504	TAA	2	6	178118	178123	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
572	NC_013504	A	6	6	178130	178135	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
573	NC_013504	T	6	6	178998	179003	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
574	NC_013504	GTT	2	6	179004	179009	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
575	NC_013504	T	6	6	179008	179013	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
576	NC_013504	GAA	2	6	179044	179049	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
577	NC_013504	A	7	7	180883	180889	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
578	NC_013504	AT	3	6	183529	183534	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
579	NC_013504	TATC	2	8	183549	183556	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
580	NC_013504	TTATT	2	10	183557	183566	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
581	NC_013504	A	6	6	183585	183590	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
582	NC_013504	TCA	2	6	184050	184055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
583	NC_013504	TATC	2	8	184065	184072	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
584	NC_013504	T	7	7	184111	184117	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
585	NC_013504	TAGT	2	8	184155	184162	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
586	NC_013504	AAG	2	6	184905	184910	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
587	NC_013504	T	6	6	184930	184935	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
588	NC_013504	A	6	6	184959	184964	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
589	NC_013504	TTA	2	6	185013	185018	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
590	NC_013504	AG	3	6	185034	185039	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
591	NC_013504	CTA	2	6	185240	185245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
592	NC_013504	AGCT	2	8	185246	185253	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
593	NC_013504	AATT	2	8	185274	185281	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
594	NC_013504	AAT	2	6	185327	185332	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
595	NC_013504	A	6	6	185333	185338	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
596	NC_013504	TGA	3	9	185357	185365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
597	NC_013504	T	7	7	185375	185381	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
598	NC_013504	TTA	2	6	185413	185418	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
599	NC_013504	A	6	6	185428	185433	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
600	NC_013504	ACA	2	6	185436	185441	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
601	NC_013504	TG	3	6	185445	185450	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
602	NC_013504	G	8	8	185475	185482	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
603	NC_013504	T	6	6	185517	185522	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
604	NC_013504	GGA	2	6	185523	185528	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
605	NC_013504	T	6	6	187029	187034	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
606	NC_013504	GAA	2	6	187046	187051	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
607	NC_013504	GATA	2	8	187062	187069	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
608	NC_013504	AT	3	6	188191	188196	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
609	NC_013504	ATG	2	6	188199	188204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
610	NC_013504	TA	3	6	188223	188228	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
611	NC_013504	AAAAG	2	10	188234	188243	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
612	NC_013504	TAGA	2	8	188244	188251	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
613	NC_013504	CT	3	6	188260	188265	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
614	NC_013504	TG	3	6	188295	188300	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
615	NC_013504	T	6	6	188322	188327	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
616	NC_013504	TGC	2	6	188345	188350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
617	NC_013504	ATAGCA	2	12	188391	188402	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
618	NC_013504	TAT	2	6	188405	188410	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
619	NC_013504	AT	3	6	188472	188477	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
620	NC_013504	CTAT	2	8	188523	188530	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
621	NC_013504	TAA	2	6	188538	188543	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
622	NC_013504	GTA	2	6	188574	188579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
623	NC_013504	A	7	7	188588	188594	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
624	NC_013504	CTTTC	2	10	188932	188941	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
625	NC_013504	A	6	6	188955	188960	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
626	NC_013504	TTAA	2	8	188965	188972	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
627	NC_013504	A	6	6	188977	188982	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
628	NC_013504	AGTA	2	8	189005	189012	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
629	NC_013504	ATT	2	6	189024	189029	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
630	NC_013504	AAT	2	6	189030	189035	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
631	NC_013504	AAAG	2	8	189043	189050	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
632	NC_013504	TGAT	2	8	189083	189090	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
633	NC_013504	AAG	2	6	189093	189098	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
634	NC_013504	T	8	8	190536	190543	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
635	NC_013504	TGC	2	6	191539	191544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
636	NC_013504	A	6	6	192036	192041	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
637	NC_013504	TCT	2	6	192044	192049	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
638	NC_013504	GTAA	2	8	192051	192058	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
639	NC_013504	T	6	6	192059	192064	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
640	NC_013504	AATT	2	8	192866	192873	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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642	NC_013504	AAG	2	6	193774	193779	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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