MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Lactobacillus rhamnosus Lc 705 chromosome

Total Repeats: 4844

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013199	ACG	2	6	1504	1509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_013199	AGG	2	6	1513	1518	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013199	TCC	2	6	2959	2964	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_013199	ATT	2	6	3024	3029	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013199	TAA	2	6	3035	3040	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013199	GAT	2	6	3127	3132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_013199	TGG	2	6	3488	3493	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_013199	GAG	2	6	4874	4879	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_013199	GAG	2	6	6894	6899	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_013199	CAT	2	6	9670	9675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_013199	AAC	2	6	9950	9955	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_013199	GTT	2	6	9977	9982	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013199	TTA	2	6	10091	10096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_013199	TAT	2	6	10109	10114	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_013199	TTA	2	6	10151	10156	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_013199	GTA	2	6	10449	10454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_013199	AGA	2	6	10503	10508	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_013199	GGT	2	6	11063	11068	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_013199	ATT	2	6	11120	11125	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_013199	AGT	2	6	11811	11816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_013199	TTA	2	6	11876	11881	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_013199	AGG	2	6	11921	11926	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_013199	AGG	2	6	12931	12936	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_013199	AGG	2	6	14238	14243	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_013199	ATA	2	6	16786	16791	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_013199	AGG	2	6	16806	16811	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_013199	GTA	2	6	17534	17539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_013199	TGA	2	6	17552	17557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_013199	ATT	2	6	17567	17572	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_013199	ACG	2	6	17735	17740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_013199	GTT	2	6	17834	17839	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_013199	ATT	2	6	18071	18076	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_013199	ATA	2	6	18077	18082	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_013199	AAG	2	6	18136	18141	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_013199	CAG	2	6	19266	19271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_013199	TCT	2	6	21195	21200	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_013199	AAT	2	6	21202	21207	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_013199	TCA	2	6	21215	21220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_013199	GGC	2	6	21265	21270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_013199	AAT	3	9	21295	21303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_013199	AAC	2	6	21322	21327	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_013199	CTG	2	6	21370	21375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_013199	CAA	2	6	21405	21410	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_013199	TCC	2	6	21452	21457	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_013199	ATG	2	6	21475	21480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_013199	CAA	2	6	21483	21488	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_013199	TTG	2	6	21608	21613	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_013199	GGC	2	6	21696	21701	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_013199	AGG	2	6	23968	23973	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_013199	GTT	2	6	24079	24084	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_013199	GTT	2	6	25500	25505	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_013199	CCT	2	6	28912	28917	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
53	NC_013199	GTT	2	6	28966	28971	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_013199	TAA	2	6	28976	28981	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_013199	TGT	2	6	29030	29035	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_013199	GCC	2	6	29637	29642	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_013199	ATG	2	6	30867	30872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_013199	CGC	2	6	30917	30922	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_013199	GCG	2	6	30943	30948	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_013199	TGC	2	6	31764	31769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_013199	TCA	2	6	31866	31871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_013199	AAG	2	6	31912	31917	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_013199	ACG	2	6	32531	32536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_013199	TGA	2	6	32586	32591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_013199	ATC	2	6	32605	32610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_013199	CAA	2	6	33791	33796	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_013199	GAT	2	6	33799	33804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_013199	TCA	2	6	35503	35508	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_013199	TCT	2	6	35564	35569	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_013199	TTG	2	6	36396	36401	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_013199	CAG	2	6	36434	36439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_013199	AAG	2	6	36492	36497	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_013199	AAT	2	6	36646	36651	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_013199	TGT	2	6	37251	37256	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_013199	GTT	2	6	37356	37361	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_013199	TCG	2	6	37362	37367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_013199	TGA	2	6	37497	37502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_013199	AAC	2	6	37551	37556	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_013199	ATT	2	6	37739	37744	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_013199	AAG	2	6	37782	37787	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_013199	GTT	2	6	38276	38281	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_013199	AAT	2	6	38443	38448	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_013199	TCG	2	6	38520	38525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_013199	GAA	2	6	38763	38768	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_013199	CCT	2	6	41565	41570	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_013199	CAA	2	6	41606	41611	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_013199	TAT	2	6	41646	41651	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_013199	AAT	2	6	41797	41802	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_013199	AGC	2	6	42974	42979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_013199	CAG	2	6	45005	45010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_013199	TAA	2	6	45022	45027	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_013199	GTT	2	6	45032	45037	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_013199	ATT	2	6	45256	45261	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_013199	GTT	2	6	45262	45267	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_013199	AAC	2	6	50098	50103	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_013199	GTT	2	6	50882	50887	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_013199	GAA	2	6	50915	50920	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_013199	ATG	2	6	56108	56113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_013199	CCT	2	6	56116	56121	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
100	NC_013199	CAA	2	6	56264	56269	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_013199	GTT	2	6	56281	56286	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_013199	CAA	2	6	57925	57930	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_013199	CCT	2	6	59321	59326	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
104	NC_013199	AGC	2	6	59564	59569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_013199	TGT	2	6	60341	60346	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_013199	GAA	2	6	63983	63988	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_013199	TGG	2	6	64075	64080	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_013199	TAT	2	6	64172	64177	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_013199	TTG	2	6	64195	64200	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_013199	ATG	2	6	64643	64648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_013199	AGC	2	6	64754	64759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_013199	CAA	2	6	65225	65230	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_013199	TGA	2	6	66805	66810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_013199	GAG	2	6	66866	66871	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_013199	TAA	2	6	68262	68267	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_013199	TTA	2	6	68274	68279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_013199	AAG	2	6	68327	68332	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_013199	GGT	2	6	68975	68980	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_013199	TGA	2	6	69674	69679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_013199	TGC	2	6	69698	69703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_013199	AAT	2	6	74401	74406	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_013199	CGA	2	6	74505	74510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_013199	GCC	2	6	74512	74517	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
124	NC_013199	CCT	2	6	77147	77152	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
125	NC_013199	GTT	2	6	77438	77443	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_013199	TAA	2	6	77740	77745	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_013199	GAA	2	6	77884	77889	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_013199	GAC	2	6	77940	77945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_013199	TCC	2	6	81475	81480	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
130	NC_013199	TAA	2	6	81499	81504	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_013199	AAT	2	6	81646	81651	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_013199	TGC	2	6	83893	83898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_013199	TGA	2	6	83971	83976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_013199	TGC	2	6	84018	84023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_013199	AGG	2	6	84115	84120	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
136	NC_013199	AAT	2	6	85441	85446	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_013199	TTG	2	6	85492	85497	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_013199	AGA	2	6	86746	86751	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_013199	AAC	2	6	86758	86763	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_013199	TTA	2	6	86926	86931	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_013199	GGA	2	6	92417	92422	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
142	NC_013199	CAT	2	6	94728	94733	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_013199	TCC	2	6	94819	94824	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
144	NC_013199	TAT	2	6	94861	94866	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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146	NC_013199	TTG	2	6	95178	95183	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
147	NC_013199	AAG	2	6	95200	95205	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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149	NC_013199	CCT	2	6	99845	99850	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
150	NC_013199	TTG	2	6	99855	99860	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
151	NC_013199	GTT	2	6	99870	99875	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
152	NC_013199	CTT	2	6	99893	99898	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
153	NC_013199	ATC	2	6	100143	100148	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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157	NC_013199	AAC	2	6	107016	107021	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
158	NC_013199	AGG	2	6	107034	107039	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
159	NC_013199	TGA	2	6	107045	107050	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
160	NC_013199	TGA	2	6	107950	107955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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172	NC_013199	TGG	2	6	115274	115279	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
173	NC_013199	GTT	2	6	115407	115412	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
174	NC_013199	TAA	2	6	118925	118930	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
175	NC_013199	ACA	2	6	118993	118998	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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182	NC_013199	GAA	2	6	121168	121173	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
183	NC_013199	ACA	2	6	121187	121192	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
184	NC_013199	TAT	3	9	121205	121213	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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