MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus rhamnosus Lc 705 chromosome

Total Repeats: 8551

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_013199	TGT	2	6	1370179	1370184	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4002	NC_013199	AATT	2	8	1370189	1370196	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4003	NC_013199	TGG	2	6	1370207	1370212	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4004	NC_013199	T	6	6	1372281	1372286	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4005	NC_013199	ATA	2	6	1372287	1372292	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4006	NC_013199	A	6	6	1372310	1372315	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4007	NC_013199	TGA	2	6	1373386	1373391	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4008	NC_013199	GTT	2	6	1373406	1373411	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4009	NC_013199	TCACAC	2	12	1373521	1373532	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
4010	NC_013199	AGG	2	6	1373539	1373544	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4011	NC_013199	T	6	6	1374706	1374711	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4012	NC_013199	ATG	2	6	1374784	1374789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4013	NC_013199	ATT	2	6	1377413	1377418	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4014	NC_013199	CGC	2	6	1377440	1377445	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4015	NC_013199	GAT	2	6	1377501	1377506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4016	NC_013199	ATC	2	6	1377522	1377527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4017	NC_013199	AGT	2	6	1377538	1377543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4018	NC_013199	A	6	6	1377558	1377563	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4019	NC_013199	T	6	6	1377797	1377802	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4020	NC_013199	ATG	2	6	1377814	1377819	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4021	NC_013199	CAG	2	6	1377834	1377839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4022	NC_013199	TTTC	2	8	1377856	1377863	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4023	NC_013199	ATA	2	6	1377911	1377916	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4024	NC_013199	TGA	2	6	1380087	1380092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4025	NC_013199	TCA	2	6	1380096	1380101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4026	NC_013199	A	6	6	1381018	1381023	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4027	NC_013199	T	6	6	1381057	1381062	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4028	NC_013199	CGCTT	2	10	1381068	1381077	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
4029	NC_013199	GTC	2	6	1381314	1381319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4030	NC_013199	AAATT	2	10	1381351	1381360	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4031	NC_013199	TGT	2	6	1384657	1384662	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4032	NC_013199	AAAC	2	8	1385766	1385773	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4033	NC_013199	AAT	2	6	1385792	1385797	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4034	NC_013199	AAC	2	6	1387598	1387603	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4035	NC_013199	T	6	6	1387637	1387642	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4036	NC_013199	ATA	2	6	1387727	1387732	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4037	NC_013199	GAAG	2	8	1387777	1387784	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4038	NC_013199	GGA	2	6	1387798	1387803	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4039	NC_013199	GTT	2	6	1388280	1388285	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4040	NC_013199	TTG	2	6	1390115	1390120	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4041	NC_013199	GTT	2	6	1392739	1392744	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4042	NC_013199	AAT	2	6	1392767	1392772	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4043	NC_013199	CAGGG	2	10	1392785	1392794	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
4044	NC_013199	CGG	2	6	1392808	1392813	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4045	NC_013199	GATAGT	2	12	1392866	1392877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4046	NC_013199	GAA	2	6	1392885	1392890	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4047	NC_013199	T	6	6	1392899	1392904	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4048	NC_013199	TCAA	2	8	1392915	1392922	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4049	NC_013199	AGG	2	6	1392940	1392945	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4050	NC_013199	TTTG	2	8	1393648	1393655	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4051	NC_013199	AAT	2	6	1394053	1394058	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4052	NC_013199	GCG	2	6	1396467	1396472	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4053	NC_013199	GAG	2	6	1396513	1396518	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4054	NC_013199	TG	3	6	1397212	1397217	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4055	NC_013199	GGA	2	6	1397222	1397227	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4056	NC_013199	AGG	2	6	1397970	1397975	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4057	NC_013199	T	6	6	1397977	1397982	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4058	NC_013199	T	7	7	1399334	1399340	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4059	NC_013199	GCT	2	6	1399349	1399354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4060	NC_013199	TA	3	6	1399365	1399370	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4061	NC_013199	AGTG	2	8	1399376	1399383	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4062	NC_013199	CTA	2	6	1399401	1399406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4063	NC_013199	AAAC	2	8	1399408	1399415	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4064	NC_013199	AAAG	2	8	1399422	1399429	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4065	NC_013199	TAA	2	6	1400782	1400787	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4066	NC_013199	TGCTA	2	10	1400859	1400868	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
4067	NC_013199	ATG	2	6	1400883	1400888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4068	NC_013199	TTC	2	6	1400907	1400912	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4069	NC_013199	CAA	2	6	1401274	1401279	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4070	NC_013199	TCA	2	6	1401355	1401360	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4071	NC_013199	ATT	2	6	1401419	1401424	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4072	NC_013199	CGGTCT	2	12	1402710	1402721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4073	NC_013199	ATTTT	2	10	1403647	1403656	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4074	NC_013199	GT	3	6	1404902	1404907	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4075	NC_013199	CAA	2	6	1404931	1404936	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4076	NC_013199	CAT	2	6	1404937	1404942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4077	NC_013199	GC	3	6	1404969	1404974	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4078	NC_013199	TTG	2	6	1404991	1404996	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4079	NC_013199	ATT	2	6	1405502	1405507	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4080	NC_013199	TCA	2	6	1405508	1405513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4081	NC_013199	CTT	2	6	1405590	1405595	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4082	NC_013199	GAC	2	6	1405625	1405630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4083	NC_013199	GAGCA	2	10	1407547	1407556	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
4084	NC_013199	AGA	2	6	1408518	1408523	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4085	NC_013199	AGG	2	6	1408615	1408620	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4086	NC_013199	TGG	2	6	1409142	1409147	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4087	NC_013199	A	6	6	1409196	1409201	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4088	NC_013199	TC	3	6	1409205	1409210	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4089	NC_013199	AGA	2	6	1409215	1409220	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4090	NC_013199	T	6	6	1409226	1409231	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4091	NC_013199	CCT	2	6	1409904	1409909	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4092	NC_013199	TGGG	2	8	1409925	1409932	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
4093	NC_013199	GCT	2	6	1409988	1409993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4094	NC_013199	TTA	2	6	1410000	1410005	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4095	NC_013199	TACAA	2	10	1410027	1410036	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
4096	NC_013199	AGT	2	6	1410083	1410088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4097	NC_013199	TAA	2	6	1410095	1410100	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4098	NC_013199	AAAT	2	8	1410987	1410994	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4099	NC_013199	CCGG	2	8	1410999	1411006	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4100	NC_013199	T	7	7	1411020	1411026	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4101	NC_013199	GCT	2	6	1411125	1411130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4102	NC_013199	AGC	2	6	1411162	1411167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4103	NC_013199	ATA	2	6	1411200	1411205	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4104	NC_013199	TAT	2	6	1411206	1411211	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4105	NC_013199	AGAA	2	8	1412741	1412748	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4106	NC_013199	ACA	2	6	1412755	1412760	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4107	NC_013199	ATCAAT	2	12	1414945	1414956	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4108	NC_013199	GC	4	8	1414957	1414964	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4109	NC_013199	T	6	6	1414988	1414993	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4110	NC_013199	CAT	2	6	1415054	1415059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4111	NC_013199	TGT	2	6	1415261	1415266	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4112	NC_013199	ACCA	2	8	1420918	1420925	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4113	NC_013199	T	6	6	1420930	1420935	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4114	NC_013199	GGT	2	6	1420965	1420970	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4115	NC_013199	GTT	2	6	1420996	1421001	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4116	NC_013199	GAG	2	6	1421075	1421080	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4117	NC_013199	AGG	2	6	1423447	1423452	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4118	NC_013199	TAG	2	6	1424300	1424305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4119	NC_013199	TTTGA	2	10	1424317	1424326	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
4120	NC_013199	CAG	2	6	1424369	1424374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4121	NC_013199	T	6	6	1424415	1424420	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4122	NC_013199	GCTT	2	8	1424481	1424488	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4123	NC_013199	CTG	2	6	1426638	1426643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4124	NC_013199	T	7	7	1426644	1426650	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4125	NC_013199	TCAA	2	8	1426737	1426744	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4126	NC_013199	TAA	2	6	1426747	1426752	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4127	NC_013199	AGG	2	6	1426761	1426766	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4128	NC_013199	T	6	6	1428124	1428129	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4129	NC_013199	GTC	2	6	1428141	1428146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4130	NC_013199	AAT	2	6	1428172	1428177	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4131	NC_013199	T	7	7	1428193	1428199	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4132	NC_013199	CAA	2	6	1428246	1428251	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4260	NC_013199	ACCC	2	8	1486229	1486236	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
4261	NC_013199	AGTA	2	8	1486314	1486321	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4262	NC_013199	CTATA	2	10	1486397	1486406	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
4263	NC_013199	ATT	2	6	1486441	1486446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4265	NC_013199	GATGT	2	10	1488117	1488126	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
4266	NC_013199	TGA	2	6	1488161	1488166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4268	NC_013199	GTC	2	6	1488209	1488214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4383	NC_013199	CAAT	2	8	1551942	1551949	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4384	NC_013199	CTGTGA	2	12	1553023	1553034	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
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4389	NC_013199	ATT	2	6	1553237	1553242	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4390	NC_013199	A	7	7	1553695	1553701	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4391	NC_013199	CCT	2	6	1556877	1556882	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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4393	NC_013199	TGG	2	6	1556934	1556939	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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