MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus rhamnosus Lc 705 chromosome

Total Repeats: 8551

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_013199	ATA	2	6	1168136	1168141	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3502	NC_013199	AGA	2	6	1168262	1168267	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3503	NC_013199	CCG	2	6	1168402	1168407	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3504	NC_013199	CCA	2	6	1168470	1168475	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3505	NC_013199	AT	3	6	1168482	1168487	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3506	NC_013199	AACC	2	8	1169278	1169285	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3507	NC_013199	ATA	2	6	1169381	1169386	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3508	NC_013199	AGG	2	6	1169395	1169400	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3509	NC_013199	CAA	2	6	1169437	1169442	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3510	NC_013199	AGGA	2	8	1169652	1169659	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3511	NC_013199	AGG	2	6	1170368	1170373	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3512	NC_013199	ATG	2	6	1174004	1174009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3513	NC_013199	CAAAA	2	10	1174887	1174896	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
3514	NC_013199	AAC	2	6	1174911	1174916	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3515	NC_013199	A	6	6	1174963	1174968	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3516	NC_013199	A	6	6	1175027	1175032	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3517	NC_013199	TGT	2	6	1175048	1175053	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3518	NC_013199	GCA	2	6	1175056	1175061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3519	NC_013199	ATGA	2	8	1175093	1175100	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3520	NC_013199	AAG	2	6	1176005	1176010	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3521	NC_013199	TG	3	6	1177063	1177068	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3522	NC_013199	TTC	2	6	1178444	1178449	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3523	NC_013199	A	7	7	1178517	1178523	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3524	NC_013199	GGC	2	6	1178559	1178564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3525	NC_013199	TGGC	2	8	1179180	1179187	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3526	NC_013199	AGG	2	6	1179319	1179324	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3527	NC_013199	AGA	3	9	1181245	1181253	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3529	NC_013199	CAT	2	6	1181325	1181330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3530	NC_013199	AGC	3	9	1181367	1181375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3531	NC_013199	CAA	2	6	1182382	1182387	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3532	NC_013199	AGCC	2	8	1182414	1182421	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3533	NC_013199	CTGGG	2	10	1182503	1182512	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
3534	NC_013199	CAAA	2	8	1184014	1184021	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3535	NC_013199	AGG	2	6	1184032	1184037	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3536	NC_013199	AAT	2	6	1184722	1184727	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3537	NC_013199	TGT	2	6	1184757	1184762	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3538	NC_013199	AGG	2	6	1185690	1185695	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3539	NC_013199	TCA	2	6	1185925	1185930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3540	NC_013199	AAG	2	6	1185934	1185939	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3541	NC_013199	TTG	2	6	1189471	1189476	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3542	NC_013199	GCG	2	6	1191662	1191667	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3543	NC_013199	AAG	2	6	1191727	1191732	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3544	NC_013199	T	6	6	1191772	1191777	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3545	NC_013199	GTT	2	6	1191784	1191789	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3546	NC_013199	T	7	7	1191788	1191794	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3547	NC_013199	TA	3	6	1191817	1191822	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3548	NC_013199	GTC	2	6	1191889	1191894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3549	NC_013199	GCTCAC	2	12	1192288	1192299	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
3550	NC_013199	TTG	2	6	1192314	1192319	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3551	NC_013199	TAGT	2	8	1192620	1192627	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3552	NC_013199	GAG	2	6	1192636	1192641	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3553	NC_013199	AT	3	6	1192644	1192649	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3554	NC_013199	AGG	2	6	1194464	1194469	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3555	NC_013199	CAAT	2	8	1196000	1196007	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3556	NC_013199	A	7	7	1196031	1196037	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3557	NC_013199	GCT	2	6	1196064	1196069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3558	NC_013199	TTA	2	6	1196088	1196093	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3559	NC_013199	ATC	2	6	1197252	1197257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3560	NC_013199	TG	3	6	1197274	1197279	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3561	NC_013199	ATGTC	2	10	1197295	1197304	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
3562	NC_013199	TGA	2	6	1197398	1197403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3563	NC_013199	TGAG	2	8	1197413	1197420	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3564	NC_013199	TGA	2	6	1197454	1197459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3565	NC_013199	T	7	7	1197657	1197663	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3566	NC_013199	ATTG	2	8	1197673	1197680	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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3569	NC_013199	GAG	2	6	1197734	1197739	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3572	NC_013199	TTACT	2	10	1199049	1199058	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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3575	NC_013199	TGA	2	6	1199140	1199145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3579	NC_013199	CA	3	6	1199263	1199268	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3580	NC_013199	T	7	7	1199359	1199365	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3588	NC_013199	T	8	8	1207197	1207204	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3589	NC_013199	T	6	6	1207229	1207234	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3597	NC_013199	ATTT	2	8	1209239	1209246	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3600	NC_013199	ATT	2	6	1209434	1209439	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3601	NC_013199	A	6	6	1209449	1209454	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3602	NC_013199	TGA	2	6	1209586	1209591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3603	NC_013199	A	6	6	1209726	1209731	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3604	NC_013199	T	7	7	1209732	1209738	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3605	NC_013199	AATA	2	8	1209749	1209756	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3606	NC_013199	GTT	2	6	1209760	1209765	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3613	NC_013199	GAC	2	6	1210828	1210833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3614	NC_013199	T	6	6	1210845	1210850	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3615	NC_013199	AGT	2	6	1210904	1210909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3620	NC_013199	TAT	2	6	1211823	1211828	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3621	NC_013199	AGTG	2	8	1211834	1211841	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3622	NC_013199	TGG	2	6	1211849	1211854	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3623	NC_013199	TGGGTG	2	12	1211876	1211887	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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