MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus rhamnosus Lc 705 chromosome

Total Repeats: 8551

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_013199	ATTTTA	2	12	1007755	1007766	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3002	NC_013199	AGC	2	6	1008607	1008612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3003	NC_013199	CTG	2	6	1008632	1008637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3004	NC_013199	ATG	2	6	1008660	1008665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3005	NC_013199	ATG	2	6	1010147	1010152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3006	NC_013199	T	7	7	1010224	1010230	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3007	NC_013199	ATG	2	6	1011495	1011500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3008	NC_013199	AGA	2	6	1011501	1011506	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3009	NC_013199	CTGA	2	8	1012518	1012525	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3010	NC_013199	TAAA	2	8	1012531	1012538	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3011	NC_013199	TGGC	2	8	1012541	1012548	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3012	NC_013199	T	6	6	1012650	1012655	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3013	NC_013199	TCT	2	6	1013229	1013234	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3014	NC_013199	GCT	2	6	1014012	1014017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3015	NC_013199	TC	3	6	1014082	1014087	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3016	NC_013199	AGA	2	6	1014125	1014130	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3017	NC_013199	TGA	2	6	1014211	1014216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3018	NC_013199	CAC	2	6	1014303	1014308	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3019	NC_013199	CCA	2	6	1014332	1014337	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3020	NC_013199	AGTA	2	8	1014452	1014459	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3021	NC_013199	A	6	6	1017546	1017551	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3022	NC_013199	ACAA	2	8	1017559	1017566	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3023	NC_013199	TGT	2	6	1017611	1017616	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3024	NC_013199	T	8	8	1017645	1017652	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3025	NC_013199	AGTTT	2	10	1017721	1017730	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
3026	NC_013199	GAG	2	6	1019479	1019484	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3027	NC_013199	TGG	2	6	1022347	1022352	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3028	NC_013199	ATT	2	6	1022389	1022394	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3029	NC_013199	TCC	2	6	1022983	1022988	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3030	NC_013199	TG	3	6	1023442	1023447	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3031	NC_013199	ATA	2	6	1023448	1023453	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3032	NC_013199	ACA	2	6	1023461	1023466	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3033	NC_013199	CTT	2	6	1023495	1023500	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3034	NC_013199	TTA	2	6	1023543	1023548	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3035	NC_013199	T	7	7	1023632	1023638	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3036	NC_013199	AGT	2	6	1023644	1023649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3037	NC_013199	AGC	2	6	1023653	1023658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3038	NC_013199	TCAG	2	8	1023904	1023911	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3039	NC_013199	CGA	2	6	1023947	1023952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3040	NC_013199	A	6	6	1024026	1024031	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3041	NC_013199	A	6	6	1026891	1026896	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3042	NC_013199	CTT	2	6	1027635	1027640	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3043	NC_013199	AATT	2	8	1027651	1027658	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3044	NC_013199	CTT	2	6	1029535	1029540	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3045	NC_013199	ACTC	2	8	1029554	1029561	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3046	NC_013199	A	6	6	1029585	1029590	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3047	NC_013199	GCG	2	6	1029630	1029635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3048	NC_013199	TGC	2	6	1029652	1029657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3049	NC_013199	ATT	2	6	1029739	1029744	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3050	NC_013199	AAT	2	6	1029764	1029769	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3051	NC_013199	GAA	2	6	1031740	1031745	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3052	NC_013199	GAA	2	6	1031751	1031756	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3053	NC_013199	TGAAT	2	10	1033135	1033144	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
3054	NC_013199	GAT	2	6	1033169	1033174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3055	NC_013199	T	7	7	1033268	1033274	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3056	NC_013199	T	6	6	1033282	1033287	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3057	NC_013199	T	7	7	1033318	1033324	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3058	NC_013199	TACT	2	8	1033417	1033424	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3059	NC_013199	AATA	2	8	1033501	1033508	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3060	NC_013199	ATTTAA	2	12	1035414	1035425	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3061	NC_013199	A	7	7	1035444	1035450	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3062	NC_013199	T	7	7	1035475	1035481	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3063	NC_013199	AAG	2	6	1035509	1035514	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3064	NC_013199	CG	3	6	1037892	1037897	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3065	NC_013199	GATG	2	8	1038854	1038861	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3066	NC_013199	T	6	6	1039002	1039007	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3067	NC_013199	AGC	2	6	1041965	1041970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3068	NC_013199	ATG	3	9	1042008	1042016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3069	NC_013199	GC	3	6	1042130	1042135	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3070	NC_013199	GCT	2	6	1042230	1042235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3071	NC_013199	GC	3	6	1042253	1042258	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3072	NC_013199	TTTA	2	8	1042273	1042280	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3073	NC_013199	GCG	2	6	1043311	1043316	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3074	NC_013199	ATC	2	6	1043379	1043384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3075	NC_013199	AATC	2	8	1043409	1043416	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3076	NC_013199	TTC	2	6	1043503	1043508	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3077	NC_013199	ATAG	2	8	1043548	1043555	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3078	NC_013199	AGG	2	6	1043564	1043569	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3079	NC_013199	TAT	2	6	1044089	1044094	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3080	NC_013199	CAA	2	6	1044103	1044108	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3081	NC_013199	TAA	2	6	1044128	1044133	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3082	NC_013199	AGG	2	6	1044234	1044239	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3083	NC_013199	TTTC	2	8	1049099	1049106	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3084	NC_013199	TAC	2	6	1051592	1051597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3085	NC_013199	A	8	8	1051645	1051652	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3086	NC_013199	T	6	6	1051669	1051674	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3087	NC_013199	CAA	2	6	1051703	1051708	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3088	NC_013199	ATG	2	6	1051712	1051717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3089	NC_013199	GGC	2	6	1051724	1051729	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3090	NC_013199	AGT	2	6	1051738	1051743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3091	NC_013199	ATG	2	6	1051777	1051782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3092	NC_013199	CAA	2	6	1051796	1051801	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3093	NC_013199	T	6	6	1051833	1051838	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3094	NC_013199	TGA	2	6	1051904	1051909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3095	NC_013199	TTTC	3	12	1051910	1051921	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3096	NC_013199	CACTT	2	10	1052066	1052075	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
3097	NC_013199	GAG	2	6	1052177	1052182	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3098	NC_013199	TTC	2	6	1053402	1053407	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3099	NC_013199	CCT	2	6	1054156	1054161	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3100	NC_013199	A	6	6	1054184	1054189	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3101	NC_013199	GAA	2	6	1054255	1054260	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3102	NC_013199	AG	3	6	1054608	1054613	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3103	NC_013199	CAAG	2	8	1058102	1058109	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3104	NC_013199	CTTTT	2	10	1058958	1058967	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
3105	NC_013199	TTATAA	2	12	1059011	1059022	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3106	NC_013199	TA	3	6	1064117	1064122	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3107	NC_013199	TGAA	2	8	1064437	1064444	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3108	NC_013199	GATT	2	8	1064854	1064861	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3109	NC_013199	ATAGTC	2	12	1064905	1064916	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3110	NC_013199	T	7	7	1064988	1064994	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3111	NC_013199	TTG	2	6	1065042	1065047	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3112	NC_013199	TAT	2	6	1065102	1065107	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3113	NC_013199	GT	3	6	1065168	1065173	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3114	NC_013199	GTT	2	6	1065193	1065198	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3115	NC_013199	ATA	2	6	1065316	1065321	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3116	NC_013199	TCC	2	6	1065622	1065627	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3117	NC_013199	TCC	2	6	1065885	1065890	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3118	NC_013199	AC	3	6	1065931	1065936	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3119	NC_013199	AAT	2	6	1065953	1065958	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3120	NC_013199	AGC	2	6	1065966	1065971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3121	NC_013199	A	6	6	1066425	1066430	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3122	NC_013199	GAC	2	6	1066446	1066451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3123	NC_013199	GCCT	2	8	1066456	1066463	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3124	NC_013199	TAATGA	2	12	1066578	1066589	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3125	NC_013199	GAG	2	6	1066601	1066606	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3126	NC_013199	ATTT	2	8	1066660	1066667	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3127	NC_013199	CTA	2	6	1066721	1066726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3128	NC_013199	TTG	2	6	1066732	1066737	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3129	NC_013199	GACCC	2	10	1066785	1066794	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
3130	NC_013199	TTA	2	6	1066827	1066832	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3131	NC_013199	AGC	2	6	1066833	1066838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3132	NC_013199	TGA	2	6	1066886	1066891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3133	NC_013199	GAGCC	2	10	1066894	1066903	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
3134	NC_013199	AAG	2	6	1066955	1066960	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3145	NC_013199	TGA	2	6	1070944	1070949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3146	NC_013199	TTA	2	6	1070985	1070990	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3244	NC_013199	GAT	2	6	1111514	1111519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3251	NC_013199	CGC	2	6	1112388	1112393	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3252	NC_013199	TCG	2	6	1112414	1112419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3254	NC_013199	A	6	6	1112623	1112628	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3255	NC_013199	GTT	2	6	1112804	1112809	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3256	NC_013199	CT	3	6	1112831	1112836	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3257	NC_013199	TAAT	2	8	1112839	1112846	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3258	NC_013199	ACC	2	6	1113720	1113725	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3259	NC_013199	AAGC	2	8	1113779	1113786	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3260	NC_013199	TTTTA	2	10	1113803	1113812	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3261	NC_013199	T	7	7	1113816	1113822	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3262	NC_013199	AGGG	2	8	1114948	1114955	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
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