MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus rhamnosus Lc 705 chromosome

Total Repeats: 8551

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_013199	TC	3	6	168429	168434	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
502	NC_013199	GTT	2	6	168482	168487	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
503	NC_013199	ATA	2	6	168578	168583	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
504	NC_013199	T	6	6	168584	168589	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
505	NC_013199	T	6	6	168602	168607	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
506	NC_013199	CAG	2	6	169119	169124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
507	NC_013199	TGA	2	6	169183	169188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
508	NC_013199	T	7	7	170271	170277	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
509	NC_013199	ATTC	2	8	170288	170295	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
510	NC_013199	ACA	2	6	170376	170381	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
511	NC_013199	GAAT	2	8	170412	170419	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
512	NC_013199	GAAT	2	8	170428	170435	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
513	NC_013199	CG	3	6	170447	170452	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
514	NC_013199	T	6	6	170500	170505	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
515	NC_013199	GAG	2	6	171676	171681	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
516	NC_013199	GAT	2	6	173076	173081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
517	NC_013199	AGG	2	6	173087	173092	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
518	NC_013199	A	6	6	173093	173098	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
519	NC_013199	AAG	2	6	174581	174586	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
520	NC_013199	T	6	6	174597	174602	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
521	NC_013199	T	6	6	174614	174619	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
522	NC_013199	CTA	2	6	174658	174663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
523	NC_013199	ACGA	2	8	174719	174726	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
524	NC_013199	GTGA	2	8	174729	174736	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
525	NC_013199	T	6	6	175497	175502	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
526	NC_013199	TTC	2	6	176824	176829	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
527	NC_013199	TAGA	2	8	178333	178340	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
528	NC_013199	AAG	2	6	178348	178353	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
529	NC_013199	TTAC	2	8	178369	178376	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
530	NC_013199	GGGC	2	8	178391	178398	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
531	NC_013199	CTT	2	6	178407	178412	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
532	NC_013199	T	6	6	178411	178416	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
533	NC_013199	GTA	2	6	178430	178435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
534	NC_013199	GCA	4	12	178826	178837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
535	NC_013199	CAA	2	6	178839	178844	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
536	NC_013199	CAG	2	6	178845	178850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
537	NC_013199	AGTA	2	8	179862	179869	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
538	NC_013199	TTTG	2	8	180452	180459	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
539	NC_013199	ATG	2	6	181089	181094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
540	NC_013199	AAGTC	2	10	181293	181302	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
541	NC_013199	TTAA	2	8	181309	181316	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
542	NC_013199	A	6	6	181315	181320	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
543	NC_013199	ATA	2	6	181377	181382	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
544	NC_013199	GTTT	2	8	181411	181418	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
545	NC_013199	T	7	7	181435	181441	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
546	NC_013199	T	7	7	181443	181449	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
547	NC_013199	ACA	2	6	181475	181480	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
548	NC_013199	TA	3	6	181494	181499	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
549	NC_013199	T	8	8	181540	181547	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
550	NC_013199	GGT	2	6	183518	183523	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
551	NC_013199	TGA	2	6	184675	184680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
552	NC_013199	GGC	2	6	185921	185926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
553	NC_013199	GTT	2	6	187665	187670	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
554	NC_013199	T	7	7	187669	187675	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
555	NC_013199	GAA	2	6	187681	187686	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
556	NC_013199	AAC	2	6	187743	187748	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
557	NC_013199	CTT	2	6	187764	187769	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
558	NC_013199	TTTA	2	8	187770	187777	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
559	NC_013199	TAA	2	6	187797	187802	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
560	NC_013199	GGA	2	6	188874	188879	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
561	NC_013199	TCC	2	6	189252	189257	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
562	NC_013199	TAAGC	2	10	189258	189267	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
563	NC_013199	TG	3	6	189289	189294	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
564	NC_013199	CA	3	6	189344	189349	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
565	NC_013199	GTT	2	6	189404	189409	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
566	NC_013199	ACA	2	6	189413	189418	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
567	NC_013199	AAT	2	6	189457	189462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
568	NC_013199	GCT	2	6	190891	190896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
569	NC_013199	ATC	2	6	190955	190960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
570	NC_013199	CGG	2	6	190971	190976	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
571	NC_013199	GC	3	6	190990	190995	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
572	NC_013199	TCA	2	6	191006	191011	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
573	NC_013199	GC	3	6	191112	191117	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
574	NC_013199	GCTCAC	2	12	191120	191131	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
575	NC_013199	AGG	2	6	191144	191149	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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578	NC_013199	T	6	6	192449	192454	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
579	NC_013199	TTG	2	6	192461	192466	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
580	NC_013199	TAAT	2	8	192484	192491	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
581	NC_013199	CTT	2	6	193258	193263	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
582	NC_013199	CAT	2	6	193274	193279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
583	NC_013199	A	7	7	193307	193313	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
584	NC_013199	GTC	2	6	193333	193338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
585	NC_013199	TAC	2	6	193368	193373	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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587	NC_013199	GAA	2	6	195840	195845	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
588	NC_013199	AGG	2	6	195890	195895	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
589	NC_013199	T	7	7	195897	195903	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
590	NC_013199	AT	3	6	197268	197273	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
591	NC_013199	CCT	2	6	198220	198225	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
592	NC_013199	GTC	2	6	198235	198240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
593	NC_013199	T	6	6	198244	198249	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
594	NC_013199	TTTA	2	8	198265	198272	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
595	NC_013199	TAA	2	6	198345	198350	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
596	NC_013199	GCC	2	6	199093	199098	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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598	NC_013199	CGT	2	6	201776	201781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
599	NC_013199	GAC	2	6	201813	201818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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601	NC_013199	AAGC	2	8	201923	201930	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
602	NC_013199	ATC	2	6	202764	202769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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604	NC_013199	AGT	2	6	203959	203964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
605	NC_013199	GAT	2	6	203982	203987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
606	NC_013199	TC	3	6	204031	204036	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
607	NC_013199	T	6	6	204048	204053	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
608	NC_013199	ATT	2	6	204100	204105	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
609	NC_013199	TTAT	2	8	204117	204124	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
610	NC_013199	AAT	3	9	204177	204185	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
611	NC_013199	ATA	2	6	204186	204191	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
612	NC_013199	AAAG	2	8	204212	204219	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
613	NC_013199	TCA	2	6	204227	204232	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
614	NC_013199	ATAA	2	8	204248	204255	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
615	NC_013199	ATC	2	6	204500	204505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
616	NC_013199	TA	3	6	204692	204697	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
617	NC_013199	AC	3	6	204709	204714	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
618	NC_013199	AAC	2	6	204815	204820	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
619	NC_013199	AAATT	2	10	207383	207392	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
620	NC_013199	GAT	2	6	207395	207400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
621	NC_013199	A	6	6	207472	207477	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
622	NC_013199	A	6	6	207537	207542	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
623	NC_013199	TAT	2	6	207581	207586	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
624	NC_013199	TG	3	6	209300	209305	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
625	NC_013199	TA	3	6	209344	209349	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
626	NC_013199	TAA	2	6	209355	209360	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
627	NC_013199	ATTA	2	8	209392	209399	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
628	NC_013199	ACA	2	6	209415	209420	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
629	NC_013199	CA	3	6	209419	209424	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
630	NC_013199	AAT	2	6	209435	209440	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
631	NC_013199	AAT	2	6	209452	209457	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
632	NC_013199	TAAA	2	8	209461	209468	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
633	NC_013199	TAA	2	6	209500	209505	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
634	NC_013199	AAAT	2	8	209516	209523	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
635	NC_013199	ATTT	2	8	209524	209531	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
636	NC_013199	ACA	2	6	209594	209599	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
637	NC_013199	TG	3	6	209670	209675	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
638	NC_013199	TGT	2	6	209685	209690	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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640	NC_013199	ATG	2	6	209784	209789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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642	NC_013199	TGA	2	6	210694	210699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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644	NC_013199	TGA	2	6	213219	213224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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