MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus rhamnosus GG chromosome

Total Repeats: 8762

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_013198	GTCT	2	8	1291779	1291786	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4002	NC_013198	GAC	2	6	1291855	1291860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4003	NC_013198	TGC	2	6	1291922	1291927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4004	NC_013198	TG	3	6	1292900	1292905	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4005	NC_013198	AAT	2	6	1292930	1292935	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4006	NC_013198	TTA	2	6	1293014	1293019	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4007	NC_013198	TGA	2	6	1294477	1294482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4008	NC_013198	ATC	2	6	1294529	1294534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4009	NC_013198	T	6	6	1294549	1294554	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4010	NC_013198	AGTTT	2	10	1296478	1296487	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
4011	NC_013198	T	6	6	1296537	1296542	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4012	NC_013198	CTG	2	6	1296566	1296571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4013	NC_013198	TGA	2	6	1296580	1296585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4014	NC_013198	A	7	7	1296593	1296599	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4015	NC_013198	AGG	2	6	1296652	1296657	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4016	NC_013198	AAAG	2	8	1297513	1297520	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4017	NC_013198	ATC	2	6	1299441	1299446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4018	NC_013198	AGG	2	6	1299820	1299825	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4019	NC_013198	T	7	7	1300231	1300237	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4020	NC_013198	AGG	2	6	1300382	1300387	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4021	NC_013198	GCA	2	6	1302670	1302675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4022	NC_013198	TGA	2	6	1302776	1302781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4023	NC_013198	ATG	2	6	1302783	1302788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4024	NC_013198	ATG	2	6	1303934	1303939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4025	NC_013198	GGGGT	2	10	1304010	1304019	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
4026	NC_013198	TGAA	2	8	1305066	1305073	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4027	NC_013198	TGT	2	6	1309454	1309459	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4028	NC_013198	T	6	6	1309530	1309535	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4029	NC_013198	TCC	2	6	1310515	1310520	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4030	NC_013198	CAAT	2	8	1310533	1310540	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4031	NC_013198	AACTT	2	10	1310609	1310618	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
4032	NC_013198	A	7	7	1310692	1310698	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4033	NC_013198	AAAG	2	8	1312684	1312691	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4034	NC_013198	CAA	2	6	1312698	1312703	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4035	NC_013198	A	7	7	1312715	1312721	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4036	NC_013198	TCG	2	6	1312786	1312791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4037	NC_013198	CGAT	2	8	1312867	1312874	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4038	NC_013198	TTG	2	6	1312875	1312880	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4039	NC_013198	ACA	2	6	1312886	1312891	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4040	NC_013198	GAG	2	6	1313053	1313058	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4041	NC_013198	CG	3	6	1313621	1313626	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4042	NC_013198	ATGA	2	8	1313629	1313636	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4043	NC_013198	GCT	2	6	1313689	1313694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4044	NC_013198	AACC	2	8	1313719	1313726	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4045	NC_013198	GCT	2	6	1313960	1313965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4046	NC_013198	TCT	2	6	1314548	1314553	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4047	NC_013198	TTA	2	6	1314591	1314596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4048	NC_013198	AGC	2	6	1314624	1314629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4049	NC_013198	CTT	2	6	1314641	1314646	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4050	NC_013198	A	6	6	1314667	1314672	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4051	NC_013198	TA	3	6	1314697	1314702	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4052	NC_013198	TGC	3	9	1315327	1315335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4053	NC_013198	GA	3	6	1315347	1315352	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4054	NC_013198	T	7	7	1315482	1315488	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4055	NC_013198	GAAA	2	8	1315497	1315504	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4056	NC_013198	A	6	6	1315502	1315507	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4057	NC_013198	GGT	2	6	1315508	1315513	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4058	NC_013198	AGT	2	6	1315539	1315544	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4059	NC_013198	GTA	3	9	1315546	1315554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4060	NC_013198	TGC	2	6	1315585	1315590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4061	NC_013198	GCA	2	6	1315625	1315630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4062	NC_013198	CTTT	2	8	1316535	1316542	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4063	NC_013198	CTTT	2	8	1316670	1316677	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4064	NC_013198	ATG	2	6	1321608	1321613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4065	NC_013198	T	6	6	1321656	1321661	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4066	NC_013198	AGTT	2	8	1321731	1321738	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4067	NC_013198	CGC	2	6	1323787	1323792	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4068	NC_013198	T	6	6	1323839	1323844	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4069	NC_013198	TCACT	2	10	1323904	1323913	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
4070	NC_013198	CA	3	6	1323926	1323931	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4071	NC_013198	T	6	6	1323988	1323993	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4072	NC_013198	AGT	2	6	1324010	1324015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4073	NC_013198	CAG	2	6	1324018	1324023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4074	NC_013198	A	6	6	1325889	1325894	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4075	NC_013198	GTC	2	6	1325895	1325900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4076	NC_013198	GGC	2	6	1325909	1325914	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4077	NC_013198	T	6	6	1325915	1325920	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4078	NC_013198	A	6	6	1325945	1325950	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4079	NC_013198	ACC	2	6	1325958	1325963	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4080	NC_013198	T	6	6	1326006	1326011	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4081	NC_013198	AAACT	2	10	1326034	1326043	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
4082	NC_013198	CAG	3	9	1326057	1326065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4083	NC_013198	GTG	2	6	1326133	1326138	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4084	NC_013198	CAC	2	6	1326226	1326231	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4085	NC_013198	GCC	2	6	1326251	1326256	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4086	NC_013198	ACC	2	6	1326257	1326262	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4087	NC_013198	TAA	2	6	1333504	1333509	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4088	NC_013198	A	6	6	1333534	1333539	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4089	NC_013198	TTTG	2	8	1333548	1333555	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4090	NC_013198	TGT	2	6	1333568	1333573	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4091	NC_013198	ATG	2	6	1337516	1337521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4092	NC_013198	ACA	2	6	1337543	1337548	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4093	NC_013198	A	6	6	1337548	1337553	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4094	NC_013198	CA	3	6	1337578	1337583	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4095	NC_013198	TTA	2	6	1337588	1337593	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4096	NC_013198	CAA	2	6	1337916	1337921	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4097	NC_013198	TAT	2	6	1337926	1337931	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4098	NC_013198	GCAAT	2	10	1337947	1337956	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
4099	NC_013198	ACC	2	6	1338063	1338068	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4100	NC_013198	GGT	2	6	1338103	1338108	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4101	NC_013198	ACA	2	6	1338109	1338114	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4102	NC_013198	CGC	2	6	1338404	1338409	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4103	NC_013198	GGC	2	6	1338410	1338415	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4104	NC_013198	AGG	2	6	1338489	1338494	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4105	NC_013198	TCCA	2	8	1339294	1339301	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4106	NC_013198	TGGA	2	8	1339322	1339329	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4107	NC_013198	T	7	7	1339330	1339336	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4108	NC_013198	GCC	2	6	1339360	1339365	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4109	NC_013198	CGG	2	6	1339426	1339431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4110	NC_013198	ACA	2	6	1341176	1341181	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4111	NC_013198	A	6	6	1341181	1341186	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4112	NC_013198	T	7	7	1341205	1341211	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4113	NC_013198	AAC	2	6	1341236	1341241	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4114	NC_013198	AGG	2	6	1341245	1341250	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4115	NC_013198	TGA	2	6	1342165	1342170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4116	NC_013198	GAAA	2	8	1342189	1342196	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4117	NC_013198	GTA	2	6	1342295	1342300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4118	NC_013198	ACAA	2	8	1342330	1342337	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4119	NC_013198	AGG	2	6	1342365	1342370	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4120	NC_013198	T	6	6	1342375	1342380	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4121	NC_013198	ATT	2	6	1343972	1343977	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4122	NC_013198	A	6	6	1343996	1344001	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4123	NC_013198	T	6	6	1344026	1344031	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4124	NC_013198	CAG	2	6	1344042	1344047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4125	NC_013198	AAGG	2	8	1344097	1344104	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4126	NC_013198	TTGC	2	8	1344599	1344606	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4127	NC_013198	CTT	2	6	1344992	1344997	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4128	NC_013198	CTT	2	6	1346611	1346616	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4129	NC_013198	ATG	2	6	1346638	1346643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4130	NC_013198	CTAAA	2	10	1346698	1346707	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
4131	NC_013198	TGT	2	6	1348492	1348497	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4132	NC_013198	A	6	6	1348542	1348547	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4133	NC_013198	T	7	7	1348565	1348571	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4134	NC_013198	GTC	2	6	1350044	1350049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4135	NC_013198	AGCA	2	8	1351413	1351420	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4136	NC_013198	TTTG	2	8	1351459	1351466	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4137	NC_013198	GTG	2	6	1351547	1351552	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4138	NC_013198	A	6	6	1351579	1351584	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4139	NC_013198	A	6	6	1352539	1352544	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4148	NC_013198	T	6	6	1357318	1357323	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4252	NC_013198	AAAT	2	8	1403468	1403475	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4253	NC_013198	CCGG	2	8	1403480	1403487	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4254	NC_013198	T	7	7	1403501	1403507	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4258	NC_013198	TAT	2	6	1403687	1403692	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4259	NC_013198	AGAA	2	8	1405222	1405229	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4260	NC_013198	ATCAAT	2	12	1407426	1407437	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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4262	NC_013198	TAAAA	2	10	1407481	1407490	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
4263	NC_013198	A	6	6	1407487	1407492	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4265	NC_013198	GAC	2	6	1407932	1407937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4266	NC_013198	GTG	2	6	1407963	1407968	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4267	NC_013198	T	6	6	1407978	1407983	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4269	NC_013198	CTT	2	6	1408026	1408031	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4279	NC_013198	CA	3	6	1408465	1408470	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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4394	NC_013198	TGT	2	6	1453840	1453845	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4399	NC_013198	T	6	6	1456150	1456155	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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