MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus rhamnosus GG chromosome

Total Repeats: 8762

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_013198	CAT	2	6	941733	941738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3002	NC_013198	AGG	2	6	941753	941758	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3003	NC_013198	GAA	2	6	943830	943835	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3004	NC_013198	TGG	2	6	945184	945189	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3005	NC_013198	T	6	6	945194	945199	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3006	NC_013198	TG	3	6	945253	945258	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3007	NC_013198	AGT	2	6	945730	945735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3008	NC_013198	GC	3	6	945814	945819	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3009	NC_013198	TCGCAG	2	12	945844	945855	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3010	NC_013198	ATG	2	6	945961	945966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3011	NC_013198	TAAA	2	8	945996	946003	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3012	NC_013198	ACT	2	6	948198	948203	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3013	NC_013198	GCA	2	6	948228	948233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3014	NC_013198	T	7	7	948502	948508	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3015	NC_013198	ATTTA	2	10	948546	948555	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3016	NC_013198	GGGCA	2	10	948569	948578	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
3017	NC_013198	GAT	2	6	948637	948642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3018	NC_013198	TATT	2	8	952353	952360	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3019	NC_013198	ATG	2	6	952420	952425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3020	NC_013198	ATG	2	6	952430	952435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3021	NC_013198	GAT	2	6	952481	952486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3022	NC_013198	T	6	6	952569	952574	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3023	NC_013198	GAA	2	6	952595	952600	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3024	NC_013198	ACCT	2	8	954395	954402	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3025	NC_013198	G	6	6	954482	954487	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3026	NC_013198	TTTC	2	8	957498	957505	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3027	NC_013198	CAA	2	6	958058	958063	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3028	NC_013198	TAGA	2	8	958082	958089	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3029	NC_013198	AAT	2	6	959335	959340	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3030	NC_013198	TCC	2	6	959342	959347	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3031	NC_013198	TC	3	6	959352	959357	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3032	NC_013198	TCC	2	6	960898	960903	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3033	NC_013198	TTTG	2	8	960962	960969	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3034	NC_013198	TAG	2	6	961102	961107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3035	NC_013198	CTC	2	6	965250	965255	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3036	NC_013198	TCG	2	6	965264	965269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3037	NC_013198	GCC	2	6	965333	965338	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3038	NC_013198	ACA	2	6	965371	965376	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3039	NC_013198	ACA	2	6	965449	965454	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3040	NC_013198	TAA	2	6	965489	965494	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3041	NC_013198	CAAA	2	8	966126	966133	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3042	NC_013198	GTTTT	2	10	966169	966178	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
3043	NC_013198	T	6	6	966205	966210	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3044	NC_013198	CAG	2	6	966220	966225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3045	NC_013198	ATTTTA	2	12	967720	967731	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3046	NC_013198	GTG	2	6	968513	968518	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3047	NC_013198	AGC	2	6	968572	968577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3048	NC_013198	CTG	2	6	968597	968602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3049	NC_013198	ATG	2	6	968625	968630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3050	NC_013198	ATG	2	6	970112	970117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3051	NC_013198	T	7	7	970189	970195	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3052	NC_013198	AGGT	2	8	970297	970304	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3053	NC_013198	TAAA	2	8	972495	972502	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3054	NC_013198	TGGC	2	8	972505	972512	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3055	NC_013198	AGC	2	6	972537	972542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3056	NC_013198	T	6	6	972614	972619	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3057	NC_013198	TCT	2	6	973193	973198	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3058	NC_013198	GCT	2	6	973976	973981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3059	NC_013198	CAAA	2	8	974069	974076	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3060	NC_013198	AGG	2	6	974134	974139	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3061	NC_013198	AGTA	2	8	975658	975665	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3062	NC_013198	A	6	6	978752	978757	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3063	NC_013198	ACAA	2	8	978765	978772	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3064	NC_013198	TGT	2	6	978817	978822	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3065	NC_013198	T	9	9	978851	978859	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3066	NC_013198	AGTTT	2	10	978928	978937	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
3067	NC_013198	GAG	2	6	980686	980691	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3068	NC_013198	T	6	6	983460	983465	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3069	NC_013198	GCT	2	6	983480	983485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3070	NC_013198	ACA	2	6	983521	983526	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3071	NC_013198	TGG	2	6	983555	983560	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3072	NC_013198	ATT	2	6	983597	983602	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3073	NC_013198	TCC	2	6	984191	984196	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3074	NC_013198	TG	3	6	984650	984655	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3075	NC_013198	ATA	2	6	984656	984661	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3076	NC_013198	ACA	2	6	984669	984674	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3077	NC_013198	CTT	2	6	984703	984708	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3078	NC_013198	TTA	2	6	984751	984756	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3079	NC_013198	T	7	7	984840	984846	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3080	NC_013198	AGT	2	6	984852	984857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3081	NC_013198	AGC	2	6	984861	984866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3082	NC_013198	TGA	2	6	984885	984890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3083	NC_013198	CGA	2	6	985154	985159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3084	NC_013198	A	6	6	985233	985238	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3085	NC_013198	A	6	6	988098	988103	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3087	NC_013198	AATT	2	8	988858	988865	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3088	NC_013198	CTT	2	6	990741	990746	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3089	NC_013198	T	7	7	990745	990751	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3090	NC_013198	ACTC	2	8	990762	990769	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3091	NC_013198	A	6	6	990793	990798	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3092	NC_013198	GCG	2	6	990838	990843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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3095	NC_013198	AAT	2	6	990972	990977	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3096	NC_013198	GAA	2	6	992985	992990	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3097	NC_013198	AAAAT	2	10	994496	994505	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
3098	NC_013198	T	6	6	994542	994547	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3099	NC_013198	GCATAA	2	12	994557	994568	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3100	NC_013198	AAC	2	6	994633	994638	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3101	NC_013198	TGT	2	6	994663	994668	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3102	NC_013198	TCTT	2	8	994771	994778	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3103	NC_013198	TCC	2	6	994784	994789	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3104	NC_013198	T	7	7	994853	994859	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3105	NC_013198	T	7	7	994890	994896	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3106	NC_013198	TTAC	2	8	994988	994995	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3107	NC_013198	A	6	6	995010	995015	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3108	NC_013198	AATA	2	8	995073	995080	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3109	NC_013198	ATTTAA	2	12	996986	996997	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3110	NC_013198	A	7	7	997016	997022	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3111	NC_013198	T	7	7	997047	997053	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3112	NC_013198	AAG	2	6	997081	997086	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3113	NC_013198	CG	3	6	999464	999469	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3114	NC_013198	GATG	2	8	1000426	1000433	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3115	NC_013198	T	6	6	1000573	1000578	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3116	NC_013198	AGG	2	6	1000623	1000628	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3117	NC_013198	A	6	6	1000629	1000634	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3118	NC_013198	AGC	2	6	1004301	1004306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3119	NC_013198	ATG	3	9	1004344	1004352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3120	NC_013198	GCT	2	6	1004463	1004468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3121	NC_013198	GC	3	6	1004486	1004491	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3122	NC_013198	TTTA	2	8	1004629	1004636	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3123	NC_013198	GCG	2	6	1005667	1005672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3124	NC_013198	ATC	2	6	1005735	1005740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3125	NC_013198	AATC	2	8	1005765	1005772	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3126	NC_013198	GAT	2	6	1005854	1005859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3127	NC_013198	ATAG	2	8	1005904	1005911	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3128	NC_013198	AGG	2	6	1005920	1005925	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3129	NC_013198	GTTTG	2	10	1006528	1006537	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
3130	NC_013198	AGG	2	6	1006590	1006595	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3131	NC_013198	TTG	2	6	1007973	1007978	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3132	NC_013198	TTTC	2	8	1011455	1011462	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3133	NC_013198	TAC	2	6	1013949	1013954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3134	NC_013198	A	7	7	1014003	1014009	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3135	NC_013198	CTT	2	6	1014025	1014030	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3136	NC_013198	ATG	2	6	1014069	1014074	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3138	NC_013198	ATG	2	6	1014134	1014139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3143	NC_013198	CACTT	2	10	1014424	1014433	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
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3167	NC_013198	TGA	2	6	1018887	1018892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3251	NC_013198	GTT	2	6	1052271	1052276	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3252	NC_013198	TGATG	2	10	1052334	1052343	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
3253	NC_013198	C	6	6	1053339	1053344	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3254	NC_013198	ATTG	2	8	1053595	1053602	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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3256	NC_013198	AGAA	2	8	1053682	1053689	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3257	NC_013198	A	6	6	1053688	1053693	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3258	NC_013198	GT	4	8	1053830	1053837	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3259	NC_013198	GCTCAC	2	12	1053972	1053983	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
3260	NC_013198	TGT	2	6	1054000	1054005	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3261	NC_013198	ACC	2	6	1054738	1054743	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3262	NC_013198	GCTCAC	2	12	1055476	1055487	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
3263	NC_013198	A	7	7	1055491	1055497	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3264	NC_013198	TTTAG	2	10	1055938	1055947	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
3265	NC_013198	GTG	2	6	1055956	1055961	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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