MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus rhamnosus GG chromosome

Total Repeats: 8762

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_013198	GC	3	6	807585	807590	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2502	NC_013198	ATGA	2	8	807645	807652	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2503	NC_013198	GA	3	6	807651	807656	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2504	NC_013198	GAAT	2	8	810726	810733	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2505	NC_013198	AGAC	2	8	810761	810768	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2506	NC_013198	GCT	2	6	812145	812150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2507	NC_013198	A	7	7	812160	812166	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2508	NC_013198	CAT	2	6	812167	812172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2509	NC_013198	GCT	2	6	812569	812574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2510	NC_013198	TAA	2	6	812618	812623	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2511	NC_013198	CAT	2	6	812650	812655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2512	NC_013198	GC	3	6	812667	812672	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2513	NC_013198	TA	3	6	812730	812735	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2514	NC_013198	CAG	2	6	815176	815181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2515	NC_013198	AGG	2	6	815272	815277	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2516	NC_013198	GCG	2	6	816710	816715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2517	NC_013198	AGG	2	6	816751	816756	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2518	NC_013198	TGT	2	6	818806	818811	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2519	NC_013198	TGA	2	6	818843	818848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2520	NC_013198	ATA	2	6	821195	821200	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2521	NC_013198	AGT	2	6	821247	821252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2522	NC_013198	GCAAA	2	10	821311	821320	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
2523	NC_013198	TGA	2	6	821342	821347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2524	NC_013198	TAC	2	6	821356	821361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2525	NC_013198	AATGA	2	10	822036	822045	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
2526	NC_013198	T	6	6	822443	822448	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2527	NC_013198	TCA	2	6	822458	822463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2528	NC_013198	TTAA	2	8	822503	822510	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2529	NC_013198	ACGAT	2	10	822630	822639	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
2530	NC_013198	GAG	2	6	822652	822657	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2531	NC_013198	TCA	2	6	822766	822771	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2532	NC_013198	CCA	2	6	822802	822807	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2533	NC_013198	CGTT	2	8	822852	822859	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2534	NC_013198	GGAATT	2	12	822867	822878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2535	NC_013198	T	6	6	822897	822902	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2536	NC_013198	TTG	3	9	822936	822944	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2537	NC_013198	CGT	2	6	822957	822962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2538	NC_013198	TGA	2	6	822979	822984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2539	NC_013198	TGA	2	6	822993	822998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2540	NC_013198	CAT	2	6	823013	823018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2541	NC_013198	AATA	2	8	823032	823039	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2542	NC_013198	GTT	2	6	823053	823058	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2543	NC_013198	AGT	2	6	823107	823112	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2544	NC_013198	AAC	2	6	823209	823214	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2545	NC_013198	GGC	2	6	823279	823284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2546	NC_013198	ATT	2	6	823317	823322	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2547	NC_013198	TGGA	2	8	823491	823498	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
2548	NC_013198	GCA	2	6	823617	823622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2549	NC_013198	CGC	2	6	823664	823669	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2550	NC_013198	GTGA	2	8	823670	823677	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
2551	NC_013198	TGT	2	6	823703	823708	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2552	NC_013198	GAA	2	6	823713	823718	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2553	NC_013198	TGT	2	6	823735	823740	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2554	NC_013198	CAG	2	6	823785	823790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2556	NC_013198	T	6	6	823855	823860	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2557	NC_013198	AGA	2	6	823926	823931	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2558	NC_013198	AT	3	6	823970	823975	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2559	NC_013198	GAA	2	6	823977	823982	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2560	NC_013198	GGC	2	6	823996	824001	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2561	NC_013198	GTCTG	2	10	824003	824012	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
2562	NC_013198	GAA	2	6	824240	824245	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2563	NC_013198	GA	3	6	824278	824283	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2564	NC_013198	GGT	2	6	824314	824319	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2565	NC_013198	GTC	2	6	824328	824333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2566	NC_013198	TCGTG	2	10	824337	824346	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
2567	NC_013198	GGA	2	6	824440	824445	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2568	NC_013198	ATC	2	6	824464	824469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2570	NC_013198	ATGG	2	8	824505	824512	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
2571	NC_013198	TTG	2	6	825200	825205	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2572	NC_013198	AGAA	2	8	825250	825257	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
2573	NC_013198	TAG	2	6	825271	825276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2574	NC_013198	GCGA	2	8	825279	825286	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2575	NC_013198	GCTT	2	8	825311	825318	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2576	NC_013198	AAACG	2	10	825411	825420	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
2577	NC_013198	CGG	2	6	825449	825454	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2578	NC_013198	GGA	2	6	825481	825486	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2579	NC_013198	CGGAGC	2	12	825691	825702	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
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2581	NC_013198	GTG	2	6	825784	825789	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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2583	NC_013198	GGA	2	6	825799	825804	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2584	NC_013198	ATGT	2	8	825813	825820	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2585	NC_013198	TC	3	6	825885	825890	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2586	NC_013198	GGA	2	6	825915	825920	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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2588	NC_013198	ATA	2	6	826219	826224	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2589	NC_013198	TCC	2	6	826398	826403	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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2592	NC_013198	GAG	2	6	826702	826707	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2593	NC_013198	GAGC	2	8	826721	826728	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2594	NC_013198	GAA	2	6	826772	826777	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2598	NC_013198	GA	3	6	827049	827054	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2599	NC_013198	TAGG	2	8	827167	827174	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
2600	NC_013198	TGG	2	6	827213	827218	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2601	NC_013198	TAC	2	6	827221	827226	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2603	NC_013198	GGT	2	6	827445	827450	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2604	NC_013198	CGT	2	6	827640	827645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2605	NC_013198	GAG	2	6	827689	827694	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2606	NC_013198	GCC	2	6	827748	827753	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2607	NC_013198	C	6	6	827816	827821	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2608	NC_013198	GAGAT	2	10	827824	827833	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
2609	NC_013198	GAT	2	6	827868	827873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2610	NC_013198	TGGAAG	2	12	827887	827898	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
2611	NC_013198	GC	4	8	827976	827983	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2612	NC_013198	CAA	3	9	828021	828029	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2613	NC_013198	GTG	2	6	828067	828072	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2614	NC_013198	AAG	2	6	828081	828086	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2617	NC_013198	TGG	2	6	828144	828149	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2618	NC_013198	CTGC	2	8	828154	828161	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2619	NC_013198	GGA	2	6	828191	828196	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2620	NC_013198	TCC	2	6	828257	828262	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2621	NC_013198	ATT	2	6	828343	828348	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2623	NC_013198	AAT	2	6	828461	828466	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2624	NC_013198	AGT	2	6	828493	828498	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2625	NC_013198	TGG	2	6	828524	828529	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2626	NC_013198	C	7	7	828860	828866	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2627	NC_013198	GGC	2	6	828909	828914	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2628	NC_013198	TCG	2	6	829028	829033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2629	NC_013198	GCCT	2	8	829111	829118	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2630	NC_013198	ATC	2	6	829245	829250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2632	NC_013198	GGT	2	6	829390	829395	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2633	NC_013198	CAC	2	6	829418	829423	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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2635	NC_013198	CCT	2	6	829518	829523	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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