MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus rhamnosus GG chromosome

Total Repeats: 8762

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_013198	TCC	2	6	463724	463729	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1502	NC_013198	T	6	6	463764	463769	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1503	NC_013198	TTA	2	6	463784	463789	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1504	NC_013198	GCC	2	6	463836	463841	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1505	NC_013198	GC	3	6	463871	463876	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1506	NC_013198	CTG	2	6	463880	463885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1507	NC_013198	CTG	2	6	463944	463949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1508	NC_013198	GAG	2	6	463978	463983	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1509	NC_013198	CCT	2	6	465948	465953	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1510	NC_013198	A	6	6	465959	465964	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_013198	AC	3	6	465985	465990	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1512	NC_013198	ATTT	2	8	466026	466033	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1513	NC_013198	TAA	2	6	466044	466049	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1514	NC_013198	CTT	2	6	466052	466057	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1515	NC_013198	TAT	2	6	466252	466257	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1516	NC_013198	AGC	2	6	466279	466284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1517	NC_013198	CAT	2	6	466293	466298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1518	NC_013198	TTC	2	6	466325	466330	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1519	NC_013198	ATG	2	6	466337	466342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1520	NC_013198	GA	3	6	466373	466378	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1521	NC_013198	CTC	2	6	467241	467246	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1522	NC_013198	CAG	2	6	467275	467280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1523	NC_013198	GC	3	6	467959	467964	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1524	NC_013198	AATT	2	8	468203	468210	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1525	NC_013198	GAT	2	6	468224	468229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1526	NC_013198	TCAT	2	8	468240	468247	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1527	NC_013198	T	6	6	468247	468252	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1528	NC_013198	CTT	2	6	468300	468305	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1529	NC_013198	CA	3	6	468321	468326	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1530	NC_013198	AAT	2	6	468333	468338	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1531	NC_013198	ATC	2	6	468433	468438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1532	NC_013198	TAC	2	6	468472	468477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1533	NC_013198	AC	3	6	468489	468494	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1534	NC_013198	TGT	2	6	468498	468503	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1535	NC_013198	CTC	2	6	468535	468540	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1536	NC_013198	AAG	2	6	468556	468561	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1537	NC_013198	AT	3	6	468576	468581	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1538	NC_013198	AT	3	6	468709	468714	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1539	NC_013198	AT	4	8	468734	468741	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1540	NC_013198	TAA	2	6	468768	468773	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1541	NC_013198	T	6	6	470449	470454	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1542	NC_013198	ATT	2	6	470511	470516	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1543	NC_013198	AGT	2	6	470584	470589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1544	NC_013198	CCTA	2	8	470594	470601	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1545	NC_013198	ACC	2	6	470620	470625	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1546	NC_013198	A	6	6	470637	470642	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1547	NC_013198	AG	3	6	470689	470694	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1548	NC_013198	TAT	2	6	471632	471637	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1549	NC_013198	ATG	2	6	471657	471662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1550	NC_013198	ATA	2	6	472980	472985	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1551	NC_013198	TAA	2	6	473009	473014	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1552	NC_013198	GGA	2	6	473083	473088	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1553	NC_013198	GTCG	2	8	475836	475843	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1554	NC_013198	CCT	2	6	475844	475849	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1555	NC_013198	AGG	2	6	475937	475942	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1556	NC_013198	AGA	2	6	476419	476424	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1557	NC_013198	A	6	6	476903	476908	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1558	NC_013198	T	7	7	476932	476938	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1559	NC_013198	TGT	2	6	476948	476953	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1560	NC_013198	GAA	2	6	476966	476971	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1561	NC_013198	T	6	6	477033	477038	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1562	NC_013198	TGAA	2	8	477042	477049	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1563	NC_013198	A	7	7	477057	477063	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1564	NC_013198	T	6	6	477077	477082	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1565	NC_013198	CAA	2	6	477085	477090	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1566	NC_013198	TAT	2	6	477120	477125	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1567	NC_013198	TGCA	2	8	477162	477169	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1568	NC_013198	TATT	2	8	477175	477182	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1569	NC_013198	AGG	2	6	477183	477188	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1570	NC_013198	GGA	2	6	480175	480180	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1571	NC_013198	AAGG	2	8	480186	480193	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1572	NC_013198	ACC	2	6	481788	481793	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1573	NC_013198	AGG	2	6	481801	481806	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1574	NC_013198	TTG	2	6	483316	483321	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1575	NC_013198	TGA	2	6	483387	483392	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1576	NC_013198	AGC	2	6	483393	483398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1577	NC_013198	GCT	2	6	483429	483434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1578	NC_013198	T	6	6	483434	483439	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1579	NC_013198	GAAG	2	8	483446	483453	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1580	NC_013198	AGAA	2	8	483539	483546	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1581	NC_013198	TTA	2	6	484452	484457	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1582	NC_013198	GGCGG	2	10	484537	484546	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
1583	NC_013198	ATA	2	6	486916	486921	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1584	NC_013198	GGTG	2	8	487012	487019	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
1585	NC_013198	AGG	2	6	488233	488238	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1586	NC_013198	T	6	6	489751	489756	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1587	NC_013198	CAT	2	6	491572	491577	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1588	NC_013198	CAC	2	6	491578	491583	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1589	NC_013198	CTC	2	6	493837	493842	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1590	NC_013198	TAAAAA	2	12	493843	493854	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1591	NC_013198	ACC	2	6	493905	493910	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1592	NC_013198	TCAAC	2	10	493936	493945	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
1593	NC_013198	CTCTT	2	10	494093	494102	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
1594	NC_013198	TA	3	6	494116	494121	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1595	NC_013198	TGATT	2	10	494123	494132	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
1596	NC_013198	T	6	6	494177	494182	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1597	NC_013198	ATT	2	6	494254	494259	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1598	NC_013198	TATG	2	8	495042	495049	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1599	NC_013198	CAA	2	6	495146	495151	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1600	NC_013198	AGG	2	6	495184	495189	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1601	NC_013198	GAG	2	6	495199	495204	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1602	NC_013198	GGTG	2	8	495208	495215	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
1603	NC_013198	TATG	2	8	495219	495226	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1604	NC_013198	TATCGA	2	12	495718	495729	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
1605	NC_013198	AACA	2	8	495730	495737	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1606	NC_013198	CGGAT	2	10	495744	495753	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1607	NC_013198	T	7	7	495786	495792	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1608	NC_013198	CAAT	2	8	496390	496397	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1609	NC_013198	GGA	2	6	496408	496413	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1610	NC_013198	AT	3	6	497462	497467	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1611	NC_013198	T	6	6	497514	497519	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1612	NC_013198	ATT	2	6	497529	497534	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1613	NC_013198	GTTT	2	8	498425	498432	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1614	NC_013198	AAT	2	6	498436	498441	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1615	NC_013198	TTG	2	6	498534	498539	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1616	NC_013198	CAC	2	6	498572	498577	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1617	NC_013198	GGC	2	6	498592	498597	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1618	NC_013198	AGG	2	6	498607	498612	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1619	NC_013198	CAT	2	6	500912	500917	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1620	NC_013198	GC	3	6	500933	500938	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1621	NC_013198	GCTCAC	2	12	501063	501074	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
1622	NC_013198	A	6	6	501077	501082	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1623	NC_013198	TGA	2	6	501128	501133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1624	NC_013198	CCT	2	6	502552	502557	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1625	NC_013198	GTA	2	6	502565	502570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1626	NC_013198	AAC	2	6	502584	502589	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1627	NC_013198	CTCTAT	2	12	502592	502603	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1628	NC_013198	AAT	2	6	502609	502614	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1629	NC_013198	AATT	2	8	502642	502649	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1630	NC_013198	ATTTT	2	10	502658	502667	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1631	NC_013198	A	8	8	502734	502741	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1632	NC_013198	TGG	2	6	503653	503658	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1633	NC_013198	CAA	2	6	503659	503664	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1634	NC_013198	GAA	2	6	504059	504064	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1635	NC_013198	AG	3	6	504095	504100	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1637	NC_013198	T	6	6	505142	505147	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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