MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus rhamnosus GG chromosome

Total Repeats: 8762

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_013198	ATG	2	6	155238	155243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
502	NC_013198	CAT	2	6	155266	155271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
503	NC_013198	A	6	6	155308	155313	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
504	NC_013198	CTAA	2	8	155372	155379	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
505	NC_013198	TAC	2	6	155382	155387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
506	NC_013198	TGGATA	2	12	155412	155423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
507	NC_013198	TACT	2	8	155440	155447	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
508	NC_013198	TTA	2	6	155577	155582	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
509	NC_013198	GCA	2	6	155583	155588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
510	NC_013198	T	7	7	156770	156776	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
511	NC_013198	ATA	2	6	156900	156905	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
512	NC_013198	GTGTT	2	10	156953	156962	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
513	NC_013198	AGG	2	6	156997	157002	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
514	NC_013198	TCAC	2	8	157003	157010	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
515	NC_013198	GATG	2	8	157034	157041	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
516	NC_013198	TCC	2	6	158535	158540	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
517	NC_013198	TTTG	2	8	158599	158606	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
518	NC_013198	TTA	2	6	158727	158732	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
519	NC_013198	GAA	2	6	158744	158749	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
520	NC_013198	ACA	2	6	159742	159747	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
521	NC_013198	AAG	2	6	159759	159764	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
522	NC_013198	CAA	2	6	159803	159808	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
523	NC_013198	TAGAT	2	10	159914	159923	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
524	NC_013198	GA	3	6	159992	159997	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
525	NC_013198	AAAC	2	8	160094	160101	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
526	NC_013198	CCAC	2	8	160133	160140	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
527	NC_013198	A	6	6	160155	160160	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
528	NC_013198	CACC	2	8	160208	160215	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
529	NC_013198	TCCC	2	8	161222	161229	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
530	NC_013198	AATT	2	8	162419	162426	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
531	NC_013198	CTTT	2	8	162438	162445	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
532	NC_013198	T	6	6	162483	162488	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
533	NC_013198	TGAT	2	8	162507	162514	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
534	NC_013198	TCT	2	6	162546	162551	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
535	NC_013198	TGAA	2	8	162585	162592	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
536	NC_013198	GGA	2	6	162636	162641	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
537	NC_013198	CAT	2	6	162902	162907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
538	NC_013198	CA	3	6	162955	162960	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
539	NC_013198	TAT	2	6	164130	164135	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
540	NC_013198	CAT	2	6	164299	164304	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
541	NC_013198	TAA	2	6	164352	164357	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
542	NC_013198	AGA	2	6	164692	164697	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
543	NC_013198	ATA	2	6	164734	164739	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
544	NC_013198	GCC	2	6	164740	164745	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
545	NC_013198	GTT	2	6	164793	164798	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
546	NC_013198	TAA	2	6	164808	164813	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
547	NC_013198	TGT	2	6	164865	164870	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
548	NC_013198	A	7	7	164872	164878	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
549	NC_013198	TTG	2	6	164906	164911	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
550	NC_013198	CAAA	2	8	164989	164996	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
551	NC_013198	CTG	2	6	167180	167185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
552	NC_013198	GAG	2	6	167214	167219	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
553	NC_013198	ATT	2	6	168712	168717	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
554	NC_013198	TC	3	6	170483	170488	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
555	NC_013198	GTT	2	6	170536	170541	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
556	NC_013198	ATA	2	6	170632	170637	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
557	NC_013198	T	6	6	170638	170643	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
558	NC_013198	T	6	6	170656	170661	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
559	NC_013198	AGT	2	6	171174	171179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
560	NC_013198	TGA	2	6	171237	171242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
561	NC_013198	AGC	2	6	172296	172301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
562	NC_013198	T	6	6	172325	172330	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
563	NC_013198	ATTC	2	8	172341	172348	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
564	NC_013198	ACA	2	6	172429	172434	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
565	NC_013198	GAAT	2	8	172465	172472	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
566	NC_013198	GAAT	2	8	172481	172488	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
567	NC_013198	CG	3	6	172500	172505	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
568	NC_013198	T	6	6	172553	172558	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
569	NC_013198	GAG	2	6	173729	173734	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
570	NC_013198	GAT	2	6	175129	175134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
571	NC_013198	AGG	2	6	175140	175145	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
572	NC_013198	A	6	6	175146	175151	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
573	NC_013198	A	6	6	176631	176636	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
574	NC_013198	T	7	7	176651	176657	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
575	NC_013198	T	6	6	176669	176674	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
576	NC_013198	ACGA	2	8	176774	176781	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
577	NC_013198	TA	3	6	177556	177561	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
578	NC_013198	TTC	2	6	178878	178883	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
579	NC_013198	AAG	2	6	180402	180407	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
580	NC_013198	TTAC	2	8	180423	180430	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
581	NC_013198	TAAG	2	8	180439	180446	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
582	NC_013198	GCT	2	6	180451	180456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
583	NC_013198	CTT	2	6	180461	180466	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
584	NC_013198	T	6	6	180465	180470	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
585	NC_013198	GTA	2	6	180484	180489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
586	NC_013198	GGA	2	6	180899	180904	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
587	NC_013198	TAAA	2	8	180967	180974	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
588	NC_013198	CTA	2	6	180983	180988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
589	NC_013198	AC	3	6	181006	181011	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
590	NC_013198	GGT	2	6	181089	181094	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
591	NC_013198	TAA	2	6	181644	181649	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
592	NC_013198	GATAG	2	10	181688	181697	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
593	NC_013198	G	6	6	181772	181777	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
594	NC_013198	AGA	2	6	181819	181824	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
595	NC_013198	TGA	2	6	181832	181837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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597	NC_013198	AGT	2	6	181899	181904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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599	NC_013198	TAA	2	6	181970	181975	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
600	NC_013198	A	6	6	181974	181979	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
601	NC_013198	T	6	6	182073	182078	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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603	NC_013198	ACC	2	6	184712	184717	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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605	NC_013198	TAT	2	6	187824	187829	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
606	NC_013198	GAT	2	6	187900	187905	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
607	NC_013198	TGA	2	6	188786	188791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
608	NC_013198	GCT	2	6	188883	188888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
609	NC_013198	CTT	2	6	188949	188954	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
610	NC_013198	GGA	2	6	188973	188978	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
611	NC_013198	GTG	2	6	188991	188996	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
612	NC_013198	CT	3	6	189986	189991	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
613	NC_013198	AGTA	2	8	190003	190010	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
614	NC_013198	TTTG	2	8	190594	190601	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
615	NC_013198	ATG	2	6	191231	191236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
616	NC_013198	AAGTC	2	10	191435	191444	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
617	NC_013198	TTAA	2	8	191451	191458	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
618	NC_013198	A	6	6	191457	191462	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
619	NC_013198	GTTT	2	8	191553	191560	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
620	NC_013198	T	7	7	191577	191583	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
621	NC_013198	T	7	7	191585	191591	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
622	NC_013198	ACA	2	6	191617	191622	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
623	NC_013198	TA	3	6	191636	191641	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
624	NC_013198	T	8	8	191682	191689	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
625	NC_013198	GGT	2	6	193660	193665	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
626	NC_013198	TGA	2	6	194817	194822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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628	NC_013198	T	6	6	197812	197817	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
629	NC_013198	GAA	2	6	197823	197828	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
630	NC_013198	AAC	2	6	197885	197890	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
631	NC_013198	CTT	2	6	197906	197911	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
632	NC_013198	TTTA	2	8	197912	197919	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
633	NC_013198	TAA	2	6	197939	197944	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
634	NC_013198	GGA	2	6	199016	199021	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
635	NC_013198	TCC	2	6	199394	199399	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
636	NC_013198	TAAGC	2	10	199400	199409	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
637	NC_013198	TG	3	6	199431	199436	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
638	NC_013198	CA	3	6	199486	199491	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
639	NC_013198	GTT	2	6	199546	199551	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
640	NC_013198	ACA	2	6	199555	199560	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
641	NC_013198	AAT	2	6	199599	199604	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
642	NC_013198	GCT	2	6	201033	201038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
643	NC_013198	ATC	2	6	201097	201102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
644	NC_013198	CGG	2	6	201113	201118	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
645	NC_013198	GC	3	6	201132	201137	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
646	NC_013198	GC	3	6	201254	201259	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
647	NC_013198	TCA	2	6	201270	201275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
648	NC_013198	GCTCAC	2	12	201384	201395	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
649	NC_013198	GCTCAC	2	12	201506	201517	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
650	NC_013198	AGG	2	6	201530	201535	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
651	NC_013198	CTC	2	6	202786	202791	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
652	NC_013198	A	6	6	202793	202798	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
653	NC_013198	T	6	6	202835	202840	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
654	NC_013198	TTG	2	6	202847	202852	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
655	NC_013198	TAAT	2	8	202870	202877	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
656	NC_013198	CTT	2	6	203644	203649	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
657	NC_013198	CAT	2	6	203660	203665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
658	NC_013198	A	7	7	203693	203699	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
659	NC_013198	GTC	2	6	203719	203724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
660	NC_013198	TAC	2	6	203754	203759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
661	NC_013198	AGG	2	6	203786	203791	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
662	NC_013198	GAA	2	6	206226	206231	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
663	NC_013198	AGG	2	6	206276	206281	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
664	NC_013198	T	6	6	206283	206288	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
665	NC_013198	AT	3	6	207653	207658	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
666	NC_013198	CCT	2	6	208605	208610	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
667	NC_013198	GTC	2	6	208620	208625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
668	NC_013198	T	6	6	208628	208633	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
669	NC_013198	GGT	2	6	208640	208645	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
670	NC_013198	TAA	2	6	208725	208730	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
671	NC_013198	GCC	2	6	209473	209478	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
672	NC_013198	ATC	2	6	211272	211277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
673	NC_013198	TTGC	2	8	211440	211447	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
674	NC_013198	TA	3	6	211452	211457	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
675	NC_013198	AAC	2	6	211576	211581	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
676	NC_013198	GAT	2	6	214156	214161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
677	NC_013198	A	6	6	214233	214238	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
678	NC_013198	A	6	6	214298	214303	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
679	NC_013198	TAT	2	6	214342	214347	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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681	NC_013198	TA	3	6	216105	216110	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
682	NC_013198	TA	3	6	216112	216117	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
683	NC_013198	TAA	2	6	216155	216160	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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685	NC_013198	AAT	2	6	216196	216201	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
686	NC_013198	AAT	2	6	216213	216218	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
687	NC_013198	TAAA	2	8	216222	216229	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
688	NC_013198	AT	3	6	216248	216253	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
689	NC_013198	TAA	2	6	216261	216266	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
690	NC_013198	AAAT	2	8	216277	216284	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
691	NC_013198	ATTT	2	8	216285	216292	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
692	NC_013198	TG	3	6	216431	216436	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
693	NC_013198	TGT	2	6	216446	216451	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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697	NC_013198	AT	3	6	220536	220541	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
698	NC_013198	CTTT	2	8	220563	220570	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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702	NC_013198	AT	3	6	223535	223540	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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725	NC_013198	GC	3	6	232754	232759	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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728	NC_013198	AAGGT	2	10	232968	232977	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
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731	NC_013198	A	7	7	235491	235497	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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744	NC_013198	AT	4	8	238341	238348	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
745	NC_013198	CAT	2	6	238371	238376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
746	NC_013198	AT	3	6	239129	239134	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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752	NC_013198	A	6	6	243218	243223	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
753	NC_013198	TGA	2	6	243225	243230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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756	NC_013198	GTTT	2	8	243336	243343	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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772	NC_013198	TGTT	2	8	245336	245343	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
773	NC_013198	A	7	7	245360	245366	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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776	NC_013198	AAC	2	6	250802	250807	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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778	NC_013198	TCT	2	6	250853	250858	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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