MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus rhamnosus GG chromosome

Total Repeats: 8762

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8001	NC_013198	C	6	6	2742733	2742738	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
8002	NC_013198	CAA	2	6	2742749	2742754	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8003	NC_013198	GAA	2	6	2742799	2742804	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8004	NC_013198	AT	3	6	2742863	2742868	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8005	NC_013198	GGAA	2	8	2742904	2742911	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8006	NC_013198	TCT	2	6	2743715	2743720	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8007	NC_013198	A	7	7	2743748	2743754	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8008	NC_013198	GCA	2	6	2743755	2743760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8009	NC_013198	GCT	2	6	2743766	2743771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8010	NC_013198	T	7	7	2743771	2743777	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8011	NC_013198	GAA	2	6	2743807	2743812	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8012	NC_013198	T	6	6	2743850	2743855	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8013	NC_013198	CTT	2	6	2743915	2743920	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8014	NC_013198	CATA	2	8	2743927	2743934	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8015	NC_013198	GTTT	2	8	2743976	2743983	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
8016	NC_013198	GCTT	2	8	2743987	2743994	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
8017	NC_013198	TCA	2	6	2747333	2747338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8018	NC_013198	TTC	2	6	2749284	2749289	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8019	NC_013198	TCA	2	6	2749295	2749300	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8020	NC_013198	TTA	2	6	2749304	2749309	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8021	NC_013198	ACC	2	6	2749334	2749339	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8022	NC_013198	CCA	2	6	2749383	2749388	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8023	NC_013198	CAA	2	6	2749397	2749402	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8024	NC_013198	GT	3	6	2749420	2749425	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8025	NC_013198	AGG	2	6	2749428	2749433	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8026	NC_013198	TTTA	2	8	2751671	2751678	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8027	NC_013198	ATC	2	6	2751681	2751686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8028	NC_013198	TGC	2	6	2753517	2753522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8029	NC_013198	CT	3	6	2753525	2753530	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8030	NC_013198	TTTG	2	8	2753540	2753547	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
8031	NC_013198	CCT	2	6	2754909	2754914	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8032	NC_013198	CATTT	2	10	2754918	2754927	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
8033	NC_013198	T	6	6	2754925	2754930	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8034	NC_013198	AGG	2	6	2755013	2755018	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8035	NC_013198	ATG	2	6	2756211	2756216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8036	NC_013198	GA	3	6	2756228	2756233	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8037	NC_013198	ATA	2	6	2757408	2757413	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8038	NC_013198	CTT	2	6	2757465	2757470	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8039	NC_013198	GAAA	2	8	2757904	2757911	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
8040	NC_013198	ATT	2	6	2758025	2758030	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8041	NC_013198	GTT	2	6	2758033	2758038	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8042	NC_013198	T	7	7	2758037	2758043	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8043	NC_013198	AT	3	6	2758068	2758073	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8044	NC_013198	TTA	2	6	2758075	2758080	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8045	NC_013198	T	6	6	2758126	2758131	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8046	NC_013198	AAC	2	6	2759030	2759035	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8047	NC_013198	ATC	2	6	2759095	2759100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8048	NC_013198	GT	3	6	2759125	2759130	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8049	NC_013198	GAG	2	6	2759131	2759136	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8050	NC_013198	CTCA	2	8	2759176	2759183	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
8051	NC_013198	AGG	2	6	2759186	2759191	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8052	NC_013198	A	6	6	2760905	2760910	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8053	NC_013198	TTC	2	6	2760960	2760965	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8054	NC_013198	ATC	2	6	2761018	2761023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8055	NC_013198	GATTC	2	10	2761039	2761048	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
8056	NC_013198	TCT	2	6	2761158	2761163	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8057	NC_013198	ACATA	2	10	2761201	2761210	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
8058	NC_013198	ATC	2	6	2761289	2761294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8059	NC_013198	CAA	2	6	2761323	2761328	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8060	NC_013198	CAT	2	6	2761349	2761354	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8061	NC_013198	AAT	2	6	2761371	2761376	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8062	NC_013198	GTA	2	6	2761419	2761424	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8063	NC_013198	CCAC	2	8	2761444	2761451	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
8064	NC_013198	CCCAA	2	10	2761468	2761477	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
8065	NC_013198	CTC	2	6	2761492	2761497	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8066	NC_013198	ATAA	2	8	2761542	2761549	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8067	NC_013198	CAA	2	6	2761574	2761579	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8068	NC_013198	A	6	6	2761578	2761583	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8069	NC_013198	GTAC	2	8	2763161	2763168	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8070	NC_013198	TGT	2	6	2763897	2763902	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8071	NC_013198	AACG	2	8	2763919	2763926	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
8072	NC_013198	TGG	2	6	2763932	2763937	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8073	NC_013198	GAA	2	6	2763943	2763948	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8074	NC_013198	ACT	2	6	2764013	2764018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8075	NC_013198	AAT	2	6	2764065	2764070	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8076	NC_013198	A	6	6	2764106	2764111	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8077	NC_013198	ATT	2	6	2764615	2764620	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8078	NC_013198	A	6	6	2764664	2764669	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8079	NC_013198	ACT	2	6	2764723	2764728	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8080	NC_013198	GGT	2	6	2767815	2767820	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8081	NC_013198	CGCT	2	8	2767856	2767863	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
8082	NC_013198	TTG	2	6	2768215	2768220	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8083	NC_013198	ATG	2	6	2768223	2768228	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8084	NC_013198	AAC	2	6	2769018	2769023	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8085	NC_013198	T	6	6	2769587	2769592	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8086	NC_013198	ATT	2	6	2769687	2769692	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8087	NC_013198	CTA	2	6	2769728	2769733	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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8089	NC_013198	TCG	2	6	2769841	2769846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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8091	NC_013198	TCT	2	6	2769977	2769982	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8092	NC_013198	TAA	2	6	2770046	2770051	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8093	NC_013198	CAGCAT	2	12	2770245	2770256	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
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8096	NC_013198	ACC	2	6	2770323	2770328	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8097	NC_013198	TCTTG	2	10	2770365	2770374	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
8098	NC_013198	T	6	6	2770429	2770434	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8099	NC_013198	AT	3	6	2770457	2770462	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8100	NC_013198	CAA	2	6	2773583	2773588	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8101	NC_013198	GC	3	6	2773769	2773774	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8102	NC_013198	TCC	2	6	2776029	2776034	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8103	NC_013198	ATT	2	6	2778646	2778651	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8104	NC_013198	ATA	2	6	2778756	2778761	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8105	NC_013198	TCA	2	6	2778831	2778836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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8107	NC_013198	CCT	2	6	2778843	2778848	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8108	NC_013198	CAA	2	6	2778865	2778870	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8109	NC_013198	CT	3	6	2779968	2779973	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8110	NC_013198	ACTTCA	2	12	2781128	2781139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8111	NC_013198	CCT	2	6	2784123	2784128	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8112	NC_013198	A	6	6	2785063	2785068	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8113	NC_013198	TGT	2	6	2785121	2785126	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8114	NC_013198	AAT	2	6	2785157	2785162	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8115	NC_013198	TCA	2	6	2785940	2785945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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8117	NC_013198	GCAA	2	8	2786958	2786965	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
8118	NC_013198	GGC	2	6	2786968	2786973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8119	NC_013198	T	6	6	2786974	2786979	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8120	NC_013198	CAG	2	6	2786991	2786996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8121	NC_013198	CAA	2	6	2788097	2788102	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8122	NC_013198	GGCG	2	8	2788109	2788116	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
8123	NC_013198	GCTAA	2	10	2788160	2788169	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
8124	NC_013198	CAT	2	6	2788975	2788980	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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8126	NC_013198	AACG	2	8	2789016	2789023	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
8127	NC_013198	TCA	2	6	2789026	2789031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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8129	NC_013198	CTGTT	2	10	2789723	2789732	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
8130	NC_013198	TCC	2	6	2790330	2790335	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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