MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus rhamnosus GG chromosome

Total Repeats: 8762

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_013198	TGC	2	6	1741477	1741482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5002	NC_013198	GTT	2	6	1741499	1741504	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5003	NC_013198	GATTG	2	10	1741505	1741514	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
5004	NC_013198	GAC	2	6	1741518	1741523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5005	NC_013198	TCA	2	6	1741534	1741539	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5006	NC_013198	ACC	2	6	1742899	1742904	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5007	NC_013198	TTC	2	6	1746386	1746391	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5008	NC_013198	CCG	2	6	1746417	1746422	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5009	NC_013198	A	7	7	1746442	1746448	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5010	NC_013198	A	6	6	1746459	1746464	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5011	NC_013198	ACC	2	6	1746483	1746488	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5012	NC_013198	A	6	6	1746502	1746507	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5013	NC_013198	CAA	2	6	1746519	1746524	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5014	NC_013198	T	7	7	1746678	1746684	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5015	NC_013198	TC	3	6	1746768	1746773	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5016	NC_013198	CAA	2	6	1746795	1746800	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5017	NC_013198	A	7	7	1746810	1746816	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5018	NC_013198	TCA	2	6	1747222	1747227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5019	NC_013198	CTTA	2	8	1747234	1747241	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5020	NC_013198	AC	3	6	1747263	1747268	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5021	NC_013198	ATC	2	6	1747294	1747299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5022	NC_013198	AAC	2	6	1747300	1747305	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5023	NC_013198	A	7	7	1747338	1747344	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5024	NC_013198	A	6	6	1747437	1747442	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5025	NC_013198	GAC	2	6	1747475	1747480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5026	NC_013198	TGA	2	6	1748037	1748042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5027	NC_013198	AC	3	6	1748043	1748048	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5028	NC_013198	TA	3	6	1749208	1749213	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5029	NC_013198	TCA	2	6	1749265	1749270	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5030	NC_013198	TCT	2	6	1749285	1749290	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5031	NC_013198	ATT	2	6	1749644	1749649	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5032	NC_013198	GTC	2	6	1750661	1750666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5033	NC_013198	GGC	2	6	1750674	1750679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5034	NC_013198	T	6	6	1750680	1750685	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5035	NC_013198	ATTG	2	8	1750845	1750852	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5036	NC_013198	AC	3	6	1753160	1753165	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5037	NC_013198	TAA	2	6	1753281	1753286	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5038	NC_013198	ATA	2	6	1753321	1753326	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5039	NC_013198	T	6	6	1753369	1753374	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5040	NC_013198	A	7	7	1753413	1753419	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5041	NC_013198	CCT	2	6	1754907	1754912	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5042	NC_013198	CATT	2	8	1754913	1754920	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5043	NC_013198	CAT	2	6	1754921	1754926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5044	NC_013198	ATT	2	6	1755004	1755009	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5045	NC_013198	T	6	6	1755008	1755013	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5046	NC_013198	CGC	2	6	1755042	1755047	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5047	NC_013198	TCAG	2	8	1755069	1755076	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5048	NC_013198	CTT	2	6	1755855	1755860	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5049	NC_013198	TGA	2	6	1755870	1755875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5050	NC_013198	GCT	2	6	1755932	1755937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5051	NC_013198	GCA	2	6	1755944	1755949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5052	NC_013198	TGTT	2	8	1757283	1757290	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5053	NC_013198	TCC	2	6	1757338	1757343	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5054	NC_013198	GT	3	6	1757541	1757546	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5055	NC_013198	TGA	2	6	1757571	1757576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5056	NC_013198	CAC	2	6	1757597	1757602	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5057	NC_013198	CTTC	2	8	1757626	1757633	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5058	NC_013198	GC	3	6	1757655	1757660	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5059	NC_013198	A	6	6	1757675	1757680	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5060	NC_013198	GCT	2	6	1757695	1757700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5061	NC_013198	TTC	2	6	1757718	1757723	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5062	NC_013198	CCT	2	6	1758326	1758331	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5063	NC_013198	GC	3	6	1758368	1758373	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5064	NC_013198	CCT	2	6	1759517	1759522	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5065	NC_013198	TCA	2	6	1759547	1759552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5066	NC_013198	CGA	2	6	1761813	1761818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5067	NC_013198	TCA	2	6	1761892	1761897	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5068	NC_013198	CTC	2	6	1762226	1762231	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5069	NC_013198	GCC	2	6	1762244	1762249	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5070	NC_013198	CCA	2	6	1762253	1762258	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5071	NC_013198	T	7	7	1762268	1762274	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5072	NC_013198	GTT	2	6	1763963	1763968	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5073	NC_013198	TAT	2	6	1763979	1763984	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5074	NC_013198	GTG	2	6	1764122	1764127	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5075	NC_013198	CAC	2	6	1764215	1764220	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5076	NC_013198	CAT	2	6	1764280	1764285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5078	NC_013198	ACTA	2	8	1764352	1764359	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5079	NC_013198	AAC	2	6	1764363	1764368	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5080	NC_013198	AAT	2	6	1764417	1764422	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5081	NC_013198	AGG	2	6	1764522	1764527	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5082	NC_013198	ACG	2	6	1768732	1768737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5083	NC_013198	TCC	2	6	1769115	1769120	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5084	NC_013198	TCAAA	2	10	1769121	1769130	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
5085	NC_013198	TCC	2	6	1769351	1769356	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5086	NC_013198	CG	3	6	1769369	1769374	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5087	NC_013198	GTT	2	6	1769942	1769947	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5089	NC_013198	AG	3	6	1770138	1770143	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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5092	NC_013198	AAAAC	2	10	1770752	1770761	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
5093	NC_013198	ATA	2	6	1770800	1770805	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5094	NC_013198	TAA	2	6	1770829	1770834	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5095	NC_013198	GGA	2	6	1770903	1770908	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5096	NC_013198	TAC	2	6	1772363	1772368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5097	NC_013198	TTGT	2	8	1772376	1772383	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5098	NC_013198	CTT	2	6	1773762	1773767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5099	NC_013198	ATT	2	6	1773798	1773803	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5100	NC_013198	CAA	2	6	1773906	1773911	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5101	NC_013198	CCT	2	6	1774667	1774672	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5102	NC_013198	AAC	2	6	1774712	1774717	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5103	NC_013198	TAC	2	6	1774756	1774761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5104	NC_013198	A	7	7	1774841	1774847	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5105	NC_013198	AAAT	2	8	1774876	1774883	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5106	NC_013198	CTTT	2	8	1776033	1776040	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5107	NC_013198	T	6	6	1778184	1778189	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5109	NC_013198	GGA	2	6	1778228	1778233	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5110	NC_013198	A	7	7	1778257	1778263	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5111	NC_013198	TGC	2	6	1778334	1778339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5112	NC_013198	CT	3	6	1778440	1778445	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5113	NC_013198	GAT	2	6	1778450	1778455	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5115	NC_013198	ATT	2	6	1778580	1778585	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5116	NC_013198	TAC	2	6	1779900	1779905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5117	NC_013198	ATA	2	6	1779950	1779955	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5118	NC_013198	CAAT	2	8	1779964	1779971	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5119	NC_013198	TAC	2	6	1779998	1780003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5120	NC_013198	AATTCG	2	12	1780092	1780103	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
5121	NC_013198	ATT	2	6	1780175	1780180	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5122	NC_013198	TGAA	2	8	1780228	1780235	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5123	NC_013198	TAG	2	6	1780236	1780241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5124	NC_013198	A	6	6	1780251	1780256	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5125	NC_013198	TTG	2	6	1782595	1782600	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5126	NC_013198	CTT	2	6	1783093	1783098	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5127	NC_013198	TTA	2	6	1783116	1783121	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5128	NC_013198	TCT	2	6	1787257	1787262	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5129	NC_013198	ACC	2	6	1787266	1787271	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5130	NC_013198	TCA	2	6	1787296	1787301	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5132	NC_013198	GTGG	2	8	1787389	1787396	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
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5163	NC_013198	A	7	7	1795084	1795090	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5164	NC_013198	ATTG	2	8	1795092	1795099	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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5392	NC_013198	ATC	2	6	1911719	1911724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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