MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus rhamnosus GG chromosome

Total Repeats: 8762

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_013198	TCC	2	6	1523292	1523297	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4502	NC_013198	CCA	2	6	1525124	1525129	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4503	NC_013198	TA	3	6	1525190	1525195	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4504	NC_013198	ATA	2	6	1525206	1525211	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4505	NC_013198	TGA	2	6	1525232	1525237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4506	NC_013198	CAC	2	6	1528399	1528404	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4507	NC_013198	TCA	2	6	1528463	1528468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4508	NC_013198	TC	3	6	1528573	1528578	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4509	NC_013198	GTC	2	6	1528590	1528595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4510	NC_013198	CAG	2	6	1528621	1528626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4511	NC_013198	CAG	2	6	1529816	1529821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4512	NC_013198	ATA	2	6	1530257	1530262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4513	NC_013198	GGT	2	6	1530595	1530600	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4514	NC_013198	TAAA	2	8	1530805	1530812	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4515	NC_013198	TTA	2	6	1530870	1530875	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4516	NC_013198	TAA	2	6	1530896	1530901	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4517	NC_013198	TGG	2	6	1530920	1530925	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4518	NC_013198	A	6	6	1531388	1531393	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4519	NC_013198	CCT	2	6	1531394	1531399	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4520	NC_013198	ATT	2	6	1531401	1531406	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4521	NC_013198	TC	3	6	1531423	1531428	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4522	NC_013198	GAT	2	6	1531431	1531436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4523	NC_013198	A	6	6	1531458	1531463	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4524	NC_013198	TTG	2	6	1531470	1531475	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4525	NC_013198	CAA	2	6	1531478	1531483	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4526	NC_013198	A	7	7	1531482	1531488	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4527	NC_013198	AGT	2	6	1533441	1533446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4528	NC_013198	CTGC	2	8	1543104	1543111	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4529	NC_013198	CATC	2	8	1543117	1543124	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4530	NC_013198	ACC	2	6	1543572	1543577	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4531	NC_013198	A	6	6	1543607	1543612	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4532	NC_013198	TCA	2	6	1543634	1543639	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4533	NC_013198	GTT	2	6	1543640	1543645	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4534	NC_013198	CTG	2	6	1545304	1545309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4535	NC_013198	GT	3	6	1545389	1545394	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4536	NC_013198	GCC	2	6	1545754	1545759	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4537	NC_013198	CTA	2	6	1545773	1545778	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4538	NC_013198	T	6	6	1545783	1545788	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4539	NC_013198	CTA	2	6	1548837	1548842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4540	NC_013198	CCTC	2	8	1549023	1549030	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
4541	NC_013198	T	7	7	1549053	1549059	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4542	NC_013198	TA	4	8	1549069	1549076	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4543	NC_013198	A	7	7	1549121	1549127	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4544	NC_013198	CTG	2	6	1551492	1551497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4545	NC_013198	CCT	2	6	1551500	1551505	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4546	NC_013198	TTTCT	2	10	1551510	1551519	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
4547	NC_013198	AT	3	6	1551542	1551547	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4548	NC_013198	CTT	2	6	1551552	1551557	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4549	NC_013198	ATG	2	6	1551631	1551636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4550	NC_013198	T	6	6	1551669	1551674	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4551	NC_013198	GA	3	6	1551675	1551680	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4552	NC_013198	CT	3	6	1551705	1551710	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4553	NC_013198	G	6	6	1551719	1551724	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4554	NC_013198	T	6	6	1551738	1551743	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4555	NC_013198	ATT	2	6	1551777	1551782	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4556	NC_013198	AAT	2	6	1551822	1551827	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4557	NC_013198	CCT	2	6	1551850	1551855	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4558	NC_013198	TA	4	8	1551871	1551878	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4559	NC_013198	CCAA	2	8	1551921	1551928	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4560	NC_013198	ACA	2	6	1551960	1551965	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4561	NC_013198	A	7	7	1552550	1552556	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4562	NC_013198	AAG	2	6	1552627	1552632	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4563	NC_013198	AGG	2	6	1552751	1552756	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4564	NC_013198	T	6	6	1552907	1552912	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4565	NC_013198	ATA	2	6	1553717	1553722	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4566	NC_013198	TAA	2	6	1553746	1553751	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4567	NC_013198	GGA	2	6	1553820	1553825	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4568	NC_013198	TAA	2	6	1555270	1555275	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4569	NC_013198	ATG	2	6	1555299	1555304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4570	NC_013198	ATTT	2	8	1555404	1555411	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4571	NC_013198	T	6	6	1555447	1555452	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4572	NC_013198	TGTATT	2	12	1555506	1555517	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4573	NC_013198	TAT	2	6	1555518	1555523	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4574	NC_013198	ATTT	2	8	1555532	1555539	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4575	NC_013198	GTT	2	6	1555633	1555638	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4576	NC_013198	T	7	7	1555663	1555669	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4577	NC_013198	TTG	2	6	1555689	1555694	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4578	NC_013198	TAA	2	6	1555747	1555752	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4579	NC_013198	T	6	6	1555866	1555871	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4580	NC_013198	ATT	2	6	1556059	1556064	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4581	NC_013198	TTGG	2	8	1556129	1556136	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4582	NC_013198	GTC	2	6	1556706	1556711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4583	NC_013198	ATGT	2	8	1558081	1558088	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4584	NC_013198	CTTT	2	8	1558090	1558097	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4585	NC_013198	TATGG	2	10	1558104	1558113	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
4586	NC_013198	CCT	2	6	1558239	1558244	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4587	NC_013198	TA	3	6	1558254	1558259	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4588	NC_013198	GCC	2	6	1558323	1558328	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4589	NC_013198	TGT	2	6	1558395	1558400	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4590	NC_013198	AG	3	6	1558420	1558425	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4591	NC_013198	AGA	2	6	1558457	1558462	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4592	NC_013198	GTG	2	6	1558478	1558483	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4593	NC_013198	TGTT	2	8	1558484	1558491	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4594	NC_013198	AAC	2	6	1558576	1558581	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4595	NC_013198	GGT	2	6	1558613	1558618	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4596	NC_013198	TCC	2	6	1558634	1558639	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4597	NC_013198	TCA	2	6	1558640	1558645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4598	NC_013198	A	6	6	1558681	1558686	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4599	NC_013198	TTA	2	6	1558725	1558730	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4600	NC_013198	TATT	2	8	1558831	1558838	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4601	NC_013198	TG	3	6	1558950	1558955	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4602	NC_013198	ATG	2	6	1558978	1558983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4603	NC_013198	GCT	2	6	1559012	1559017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4604	NC_013198	A	8	8	1559069	1559076	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4605	NC_013198	GAC	2	6	1559077	1559082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4606	NC_013198	TCC	2	6	1559117	1559122	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4607	NC_013198	TCAT	2	8	1560378	1560385	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4608	NC_013198	T	7	7	1560412	1560418	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4609	NC_013198	TCA	2	6	1560431	1560436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4610	NC_013198	AAG	2	6	1560584	1560589	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4611	NC_013198	T	7	7	1560633	1560639	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4612	NC_013198	TTC	2	6	1560645	1560650	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4613	NC_013198	GAG	2	6	1560745	1560750	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4614	NC_013198	AGG	2	6	1560752	1560757	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4615	NC_013198	TTC	2	6	1560761	1560766	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4616	NC_013198	AT	7	14	1560771	1560784	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4617	NC_013198	GTAAG	2	10	1560787	1560796	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
4618	NC_013198	TTA	2	6	1560972	1560977	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4619	NC_013198	A	6	6	1560977	1560982	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4620	NC_013198	TG	3	6	1561128	1561133	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4621	NC_013198	A	6	6	1561173	1561178	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4622	NC_013198	AGT	2	6	1561229	1561234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4623	NC_013198	GAC	2	6	1561443	1561448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4624	NC_013198	GTA	2	6	1561672	1561677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4625	NC_013198	TCA	2	6	1561975	1561980	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4626	NC_013198	A	6	6	1561986	1561991	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4627	NC_013198	AG	3	6	1562212	1562217	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4628	NC_013198	CTT	2	6	1562342	1562347	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4629	NC_013198	AG	3	6	1562404	1562409	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4630	NC_013198	GAA	2	6	1562537	1562542	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4631	NC_013198	AG	3	6	1562580	1562585	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4632	NC_013198	GAAT	2	8	1562638	1562645	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4633	NC_013198	CAGC	2	8	1562648	1562655	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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