MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Leptotrichia buccalis C-1013-b chromosome

Total Repeats: 293

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013192	ATATAA	2	12	7892	7903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013192	AGATTT	2	12	20309	20320	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013192	AAACTT	2	12	25682	25693	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_013192	TAAAAA	2	12	28741	28752	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013192	CTTTCA	2	12	38081	38092	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_013192	TTTTAT	2	12	39614	39625	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_013192	TCTTTT	2	12	50874	50885	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_013192	TCAAAA	2	12	58137	58148	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_013192	GTTTGT	2	12	67333	67344	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_013192	TTTTAA	2	12	105685	105696	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_013192	AAATTA	2	12	107189	107200	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_013192	ATCTGA	2	12	111522	111533	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_013192	GTGTCA	2	12	117907	117918	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_013192	TAAGCA	2	12	119047	119058	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_013192	TTTTAA	2	12	120899	120910	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_013192	ATATTT	2	12	125126	125137	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_013192	ATTTTA	2	12	131080	131091	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_013192	TTTTCT	2	12	138542	138553	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_013192	TTTCAA	2	12	143361	143372	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_013192	TCAAAA	2	12	145442	145453	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_013192	AATAAA	2	12	147609	147620	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_013192	AAAATA	2	12	155909	155920	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_013192	ATACAA	2	12	165635	165646	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_013192	ATTTAT	2	12	169685	169696	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_013192	GTAAAA	2	12	169839	169850	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_013192	GTGTCA	2	12	180046	180057	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_013192	TAAGCA	2	12	181186	181197	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_013192	TCATTA	2	12	202601	202612	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_013192	TGTTCC	2	12	204345	204356	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_013192	ATTTAA	2	12	205405	205416	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_013192	GAAAGA	2	12	205659	205670	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_013192	AAAATG	2	12	212062	212073	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_013192	TAAAAT	2	12	217488	217499	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_013192	AGTTTT	2	12	238447	238458	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_013192	ATATTT	2	12	256438	256449	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_013192	GTGTCA	2	12	264777	264788	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_013192	TAAGCA	2	12	265917	265928	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_013192	ATAATT	2	12	268786	268797	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_013192	TAAGAA	2	12	269918	269929	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_013192	AAAATA	2	12	278155	278166	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_013192	TTTTTG	2	12	279562	279573	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_013192	TATAAA	2	12	288735	288746	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013192	ATAAAA	2	12	297206	297217	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_013192	TTTCAA	2	12	299708	299719	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_013192	ATTTTT	2	12	304638	304649	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_013192	TAGATG	2	12	322628	322639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_013192	ATCTTG	2	12	322891	322902	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_013192	TTATAA	2	12	324151	324162	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_013192	TAAAAA	2	12	324752	324763	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_013192	ATTTTA	2	12	334087	334098	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_013192	AGAAAA	2	12	336177	336188	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_013192	TAAAAA	2	12	344322	344333	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_013192	GAAAAA	2	12	366512	366523	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_013192	TAGAAA	2	12	398818	398829	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_013192	TAAAAG	2	12	403553	403564	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_013192	AATAGA	2	12	406416	406427	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_013192	GCAAGA	2	12	407709	407720	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_013192	TTAAAG	2	12	413155	413166	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_013192	AAAATA	2	12	413858	413869	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_013192	TTTTAA	2	12	417990	418001	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_013192	ATTTTA	2	12	424139	424150	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_013192	AATTAT	2	12	437182	437193	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_013192	ATAATT	2	12	475030	475041	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_013192	GTGTCA	2	12	479426	479437	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_013192	TAAGCA	2	12	480566	480577	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_013192	CTTCTG	2	12	482859	482870	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_013192	TAATTT	2	12	486323	486334	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_013192	AAAAAT	2	12	498428	498439	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_013192	TAAAAT	2	12	506136	506147	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_013192	AATTTT	2	12	520936	520947	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_013192	TTAAAA	2	12	554342	554353	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_013192	ATAGTT	2	12	573421	573432	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_013192	ATTTTA	2	12	576489	576500	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_013192	TTAAAA	2	12	582141	582152	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_013192	ATAAAA	2	12	586981	586992	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_013192	GAAAAG	2	12	591271	591282	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_013192	AAATTA	2	12	605549	605560	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_013192	AAAATT	2	12	612537	612548	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_013192	TAAAAA	2	12	642018	642029	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_013192	TAAAAA	2	12	643045	643056	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_013192	AGTTAT	2	12	644336	644347	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_013192	AAAAAT	2	12	649061	649072	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_013192	AAAACA	2	12	656718	656729	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_013192	TTTTGA	2	12	657518	657529	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_013192	TTATTT	2	12	663638	663649	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_013192	TATAAA	2	12	718813	718824	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_013192	TATTTT	2	12	733045	733056	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_013192	TTTTTA	2	12	734416	734427	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_013192	TAAAAA	2	12	740783	740794	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_013192	TAGAAA	2	12	750002	750013	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_013192	GAAAAA	2	12	762930	762941	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_013192	TAAATT	2	12	763782	763793	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_013192	GATTTT	2	12	768344	768355	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_013192	CTTTTT	2	12	795861	795872	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_013192	AGGTTT	2	12	803572	803583	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_013192	TTTATT	2	12	816854	816865	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_013192	TATTTT	2	12	870381	870392	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_013192	TAACAA	2	12	882525	882536	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_013192	TTTAAA	2	12	912557	912568	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_013192	TTCATA	2	12	918529	918540	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_013192	ATAAAA	2	12	933982	933993	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_013192	TTTAAA	2	12	947434	947445	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_013192	TTATAA	2	12	948114	948125	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_013192	TATAAT	2	12	949451	949462	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_013192	AGTTTT	2	12	963149	963160	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_013192	AATAAA	2	12	963526	963537	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_013192	TAAAAA	2	12	971026	971037	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_013192	TAGTAT	2	12	980061	980072	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_013192	TATTTA	2	12	981033	981044	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_013192	CTTTTA	2	12	981718	981729	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_013192	TCTTTT	2	12	984910	984921	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_013192	TCATAT	2	12	985513	985524	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_013192	TCAAAT	2	12	986414	986425	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_013192	TCATTT	2	12	986705	986716	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_013192	GTTTTT	2	12	1049226	1049237	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_013192	ATTGTC	2	12	1051938	1051949	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_013192	TATTTA	2	12	1064834	1064845	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_013192	TTACTT	2	12	1068198	1068209	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_013192	TTATAT	2	12	1073168	1073179	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_013192	TAAATA	2	12	1076039	1076050	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_013192	AAAACA	2	12	1076133	1076144	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_013192	ATCTTT	2	12	1077185	1077196	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_013192	AAAATT	2	12	1090326	1090337	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_013192	TATTTT	2	12	1096762	1096773	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_013192	AATTAT	2	12	1122992	1123003	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_013192	ATGTAA	2	12	1131210	1131221	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
127	NC_013192	TAATAG	2	12	1167615	1167626	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
128	NC_013192	TATTTT	2	12	1171245	1171256	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_013192	ATTCTA	2	12	1174407	1174418	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
130	NC_013192	TCTTCA	2	12	1174487	1174498	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_013192	ATTTCG	2	12	1175489	1175500	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
132	NC_013192	ATGAAT	2	12	1175584	1175595	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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134	NC_013192	TTCAAT	2	12	1185218	1185229	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
135	NC_013192	TAAAAT	2	12	1213525	1213536	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_013192	TAAATT	2	12	1219188	1219199	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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141	NC_013192	AATTTA	2	12	1249966	1249977	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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163	NC_013192	AAATTT	2	12	1359993	1360004	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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257	NC_013192	TACTAA	2	12	2223882	2223893	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
258	NC_013192	TAAACT	2	12	2239667	2239678	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
259	NC_013192	TTATTT	2	12	2242000	2242011	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
260	NC_013192	TAATTT	2	12	2243052	2243063	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
261	NC_013192	TTATAT	2	12	2249183	2249194	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
262	NC_013192	TTTTAA	2	12	2255905	2255916	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
263	NC_013192	ATTTTT	2	12	2264771	2264782	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
264	NC_013192	ATCTTT	2	12	2265038	2265049	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
265	NC_013192	TATTTC	2	12	2265062	2265073	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
266	NC_013192	TATAAT	2	12	2270449	2270460	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
267	NC_013192	CTTTAA	2	12	2271133	2271144	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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274	NC_013192	TTTTTA	2	12	2330759	2330770	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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276	NC_013192	TAAAAA	2	12	2333753	2333764	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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287	NC_013192	ATTATA	2	12	2430781	2430792	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
288	NC_013192	TTAAAA	2	12	2437704	2437715	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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291	NC_013192	AAATTT	2	12	2454273	2454284	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
292	NC_013192	TTTAAA	2	12	2455697	2455708	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
293	NC_013192	ATTTTT	2	12	2463189	2463200	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.