MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Leptotrichia buccalis C-1013-b chromosome

Total Repeats: 13324

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_013192	ATAA	2	8	220598	220605	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1503	NC_013192	AGG	2	6	221296	221301	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1504	NC_013192	ATA	2	6	221896	221901	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1505	NC_013192	TATTT	2	10	221923	221932	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_013192	TCA	2	6	221944	221949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1507	NC_013192	T	7	7	221958	221964	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1508	NC_013192	TTA	2	6	221969	221974	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1509	NC_013192	A	6	6	221979	221984	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_013192	ATT	2	6	221996	222001	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_013192	TTG	2	6	222025	222030	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_013192	TAA	2	6	222041	222046	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1513	NC_013192	GGA	2	6	222480	222485	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1514	NC_013192	A	6	6	224000	224005	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_013192	A	6	6	225053	225058	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1516	NC_013192	TTGA	2	8	225069	225076	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1517	NC_013192	T	6	6	225086	225091	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1518	NC_013192	T	7	7	225299	225305	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1519	NC_013192	ATT	2	6	225306	225311	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1520	NC_013192	T	6	6	225370	225375	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1521	NC_013192	ATT	2	6	225376	225381	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1522	NC_013192	TAAA	2	8	225443	225450	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1523	NC_013192	AAT	2	6	225451	225456	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1524	NC_013192	AGGAA	2	10	225475	225484	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
1525	NC_013192	A	6	6	227427	227432	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1526	NC_013192	AATT	2	8	227452	227459	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1527	NC_013192	A	6	6	227483	227488	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1529	NC_013192	A	6	6	227518	227523	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1530	NC_013192	A	7	7	227528	227534	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1531	NC_013192	A	9	9	227559	227567	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1532	NC_013192	TGAT	2	8	227587	227594	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1533	NC_013192	AG	3	6	227603	227608	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1534	NC_013192	ATTA	2	8	227611	227618	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1535	NC_013192	TA	3	6	227628	227633	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1536	NC_013192	ATA	2	6	227637	227642	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1537	NC_013192	GAG	2	6	227667	227672	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1538	NC_013192	CT	3	6	227851	227856	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1539	NC_013192	AT	3	6	227871	227876	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1540	NC_013192	A	6	6	228530	228535	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1541	NC_013192	A	6	6	228539	228544	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1542	NC_013192	T	6	6	228553	228558	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1543	NC_013192	ATA	2	6	228574	228579	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1544	NC_013192	A	6	6	228601	228606	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1545	NC_013192	AAG	2	6	228609	228614	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1546	NC_013192	A	6	6	228619	228624	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1547	NC_013192	GTA	2	6	228626	228631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1548	NC_013192	A	6	6	228685	228690	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1549	NC_013192	A	8	8	228707	228714	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1550	NC_013192	TA	3	6	228716	228721	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1551	NC_013192	A	6	6	228746	228751	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1552	NC_013192	AGG	2	6	229418	229423	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1553	NC_013192	ATAA	2	8	230563	230570	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1554	NC_013192	TAA	2	6	230585	230590	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1555	NC_013192	TA	4	8	230619	230626	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1556	NC_013192	TAA	2	6	230629	230634	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1557	NC_013192	TTA	2	6	230635	230640	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1558	NC_013192	TAG	2	6	230653	230658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1560	NC_013192	A	7	7	231187	231193	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1561	NC_013192	ATA	2	6	231199	231204	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1562	NC_013192	A	6	6	232674	232679	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1563	NC_013192	A	6	6	232749	232754	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1564	NC_013192	AAT	2	6	233329	233334	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1565	NC_013192	TA	3	6	233351	233356	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1566	NC_013192	A	6	6	233368	233373	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1567	NC_013192	A	6	6	233408	233413	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1568	NC_013192	TAT	2	6	233419	233424	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1569	NC_013192	T	6	6	233438	233443	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1571	NC_013192	AAT	2	6	233481	233486	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1572	NC_013192	A	8	8	233496	233503	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1573	NC_013192	TTA	2	6	234026	234031	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1574	NC_013192	TAAA	2	8	234048	234055	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1575	NC_013192	TATTT	2	10	234098	234107	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1576	NC_013192	T	6	6	234115	234120	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1579	NC_013192	TAT	2	6	235625	235630	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1580	NC_013192	ATT	2	6	235643	235648	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1581	NC_013192	TAA	2	6	235663	235668	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1582	NC_013192	A	7	7	235688	235694	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1588	NC_013192	A	6	6	235847	235852	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1589	NC_013192	AGG	2	6	235857	235862	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1592	NC_013192	TA	3	6	236653	236658	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1593	NC_013192	TAA	2	6	236671	236676	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1594	NC_013192	AGG	2	6	236682	236687	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1598	NC_013192	AAT	2	6	238281	238286	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1599	NC_013192	A	6	6	238363	238368	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1600	NC_013192	A	6	6	238371	238376	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1601	NC_013192	GAA	2	6	238426	238431	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1602	NC_013192	AGTTTT	2	12	238447	238458	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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1604	NC_013192	TA	3	6	238480	238485	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1605	NC_013192	GAG	2	6	238502	238507	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1606	NC_013192	A	6	6	238894	238899	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1607	NC_013192	AGG	2	6	238903	238908	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1608	NC_013192	ATTT	2	8	239392	239399	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1609	NC_013192	T	6	6	239449	239454	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1610	NC_013192	CTT	2	6	239498	239503	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1611	NC_013192	AGG	2	6	239529	239534	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1612	NC_013192	ATA	2	6	241641	241646	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1613	NC_013192	A	7	7	241662	241668	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1614	NC_013192	A	6	6	241678	241683	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1615	NC_013192	GGA	2	6	241688	241693	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1616	NC_013192	A	6	6	242915	242920	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1617	NC_013192	ATT	2	6	242929	242934	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1620	NC_013192	AGG	2	6	243053	243058	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1621	NC_013192	AT	3	6	243413	243418	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1622	NC_013192	AGG	2	6	243421	243426	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1623	NC_013192	AG	3	6	244071	244076	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1625	NC_013192	T	7	7	245096	245102	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1626	NC_013192	ATT	2	6	245109	245114	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1627	NC_013192	ATT	2	6	245158	245163	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1628	NC_013192	AAT	2	6	245176	245181	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1629	NC_013192	AG	3	6	245207	245212	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1630	NC_013192	AAAAT	2	10	246060	246069	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1631	NC_013192	ATA	2	6	246084	246089	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1632	NC_013192	CAGA	2	8	246134	246141	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1633	NC_013192	ATAA	2	8	246213	246220	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1634	NC_013192	A	6	6	246257	246262	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1635	NC_013192	AGG	2	6	246270	246275	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1636	NC_013192	GATA	2	8	246565	246572	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1637	NC_013192	AGG	2	6	246951	246956	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1638	NC_013192	GAG	2	6	248594	248599	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1639	NC_013192	AG	3	6	249385	249390	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1641	NC_013192	TAT	2	6	249959	249964	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1919	NC_013192	A	7	7	280214	280220	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1920	NC_013192	T	6	6	280241	280246	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1921	NC_013192	T	7	7	280250	280256	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1922	NC_013192	TTTAT	2	10	280263	280272	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1923	NC_013192	TAAA	3	12	280309	280320	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1924	NC_013192	ATT	2	6	280322	280327	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1925	NC_013192	TAACT	2	10	280329	280338	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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1932	NC_013192	ATAA	2	8	281214	281221	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1933	NC_013192	TAA	2	6	281242	281247	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1941	NC_013192	A	6	6	283113	283118	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1942	NC_013192	TCA	2	6	283156	283161	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1946	NC_013192	AAT	2	6	283249	283254	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1948	NC_013192	TAT	2	6	283313	283318	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1949	NC_013192	A	6	6	283347	283352	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1950	NC_013192	T	8	8	283357	283364	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1951	NC_013192	TTA	2	6	283382	283387	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1952	NC_013192	AT	3	6	284307	284312	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1953	NC_013192	T	8	8	284350	284357	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1954	NC_013192	T	6	6	285797	285802	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1956	NC_013192	TTTAT	2	10	288467	288476	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1957	NC_013192	ATT	2	6	288501	288506	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1958	NC_013192	TAA	2	6	288518	288523	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1959	NC_013192	AAT	2	6	288547	288552	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1960	NC_013192	T	6	6	288645	288650	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1961	NC_013192	A	6	6	288729	288734	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1962	NC_013192	TATAAA	2	12	288735	288746	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1964	NC_013192	TAT	2	6	288756	288761	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1965	NC_013192	A	7	7	288780	288786	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1966	NC_013192	TTTA	2	8	288802	288809	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1969	NC_013192	ATTTT	2	10	293425	293434	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1970	NC_013192	T	8	8	293431	293438	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1971	NC_013192	A	6	6	294225	294230	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1977	NC_013192	TAT	2	6	294453	294458	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1978	NC_013192	TTA	2	6	294461	294466	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1979	NC_013192	CTTAT	2	10	294475	294484	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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1981	NC_013192	T	7	7	295205	295211	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1982	NC_013192	A	9	9	295226	295234	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1983	NC_013192	T	7	7	297128	297134	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1984	NC_013192	ATA	2	6	297157	297162	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1985	NC_013192	CAA	2	6	297185	297190	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1986	NC_013192	ATAAAA	2	12	297206	297217	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1988	NC_013192	TTA	2	6	297245	297250	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1989	NC_013192	AAC	2	6	297258	297263	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1991	NC_013192	ATA	2	6	297907	297912	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1992	NC_013192	TA	3	6	297938	297943	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2000	NC_013192	AATT	2	8	299619	299626	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

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