MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus plantarum JDM1

Total Repeats: 10967

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_012984	GAT	2	6	312093	312098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_012984	ATT	2	6	312114	312119	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_012984	GATTA	2	10	312120	312129	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_012984	TGG	2	6	312206	312211	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_012984	TAA	2	6	312237	312242	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_012984	TTA	2	6	313725	313730	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_012984	ATC	2	6	314004	314009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1008	NC_012984	T	6	6	314037	314042	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_012984	ATG	2	6	314062	314067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_012984	TGT	2	6	314083	314088	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_012984	AGG	2	6	314718	314723	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_012984	GA	4	8	316012	316019	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_012984	TAA	2	6	316082	316087	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_012984	GA	3	6	316134	316139	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_012984	AG	3	6	316165	316170	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_012984	GCA	2	6	316277	316282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1017	NC_012984	GGT	2	6	316324	316329	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_012984	GTC	2	6	316342	316347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1019	NC_012984	GAC	2	6	316369	316374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1020	NC_012984	A	6	6	316387	316392	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_012984	GAA	2	6	316418	316423	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_012984	AGGAA	2	10	318952	318961	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_012984	ATG	2	6	321149	321154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_012984	CAGT	2	8	321156	321163	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1025	NC_012984	TCA	2	6	322503	322508	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1026	NC_012984	ATT	2	6	322544	322549	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_012984	GT	3	6	322565	322570	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_012984	GTAA	2	8	322580	322587	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_012984	CTCAT	2	10	322615	322624	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
1030	NC_012984	TG	3	6	322709	322714	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_012984	CAACA	2	10	322715	322724	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
1032	NC_012984	A	6	6	322746	322751	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_012984	GAT	2	6	322761	322766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_012984	ATG	2	6	322809	322814	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_012984	T	6	6	322839	322844	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_012984	CTTT	2	8	322866	322873	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1037	NC_012984	ATA	2	6	322913	322918	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_012984	TAA	2	6	322929	322934	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_012984	A	6	6	322933	322938	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_012984	ACAT	2	8	323046	323053	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1041	NC_012984	CGG	2	6	324988	324993	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1042	NC_012984	ATTAA	2	10	325009	325018	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_012984	T	6	6	325057	325062	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_012984	TTGG	2	8	325082	325089	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_012984	TACAA	2	10	325097	325106	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
1046	NC_012984	ATT	2	6	325115	325120	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_012984	TAC	2	6	325174	325179	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1048	NC_012984	T	6	6	325251	325256	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_012984	ATT	2	6	325299	325304	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_012984	TGG	2	6	325324	325329	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_012984	GAT	2	6	325665	325670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_012984	GTC	2	6	325671	325676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1053	NC_012984	T	7	7	325690	325696	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_012984	A	6	6	325790	325795	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_012984	AT	3	6	325814	325819	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_012984	AT	4	8	325827	325834	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_012984	A	6	6	327863	327868	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_012984	GAT	2	6	327888	327893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_012984	A	7	7	327994	328000	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_012984	TCG	2	6	328030	328035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1061	NC_012984	TCT	2	6	328065	328070	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1062	NC_012984	ATT	2	6	329542	329547	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_012984	T	8	8	329561	329568	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_012984	TTG	2	6	329708	329713	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_012984	AAT	2	6	329768	329773	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_012984	G	6	6	329782	329787	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_012984	ATTA	2	8	329794	329801	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_012984	GTGC	2	8	329834	329841	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1069	NC_012984	ATG	2	6	329856	329861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_012984	ACTA	2	8	329898	329905	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1071	NC_012984	CAC	2	6	329921	329926	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1072	NC_012984	ATT	2	6	329947	329952	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_012984	TAA	2	6	329964	329969	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1075	NC_012984	TGG	2	6	331039	331044	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_012984	GCA	2	6	331324	331329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1078	NC_012984	TCA	2	6	331451	331456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1080	NC_012984	AAT	2	6	332155	332160	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_012984	AGTT	2	8	332243	332250	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_012984	ATG	2	6	332270	332275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_012984	ATG	3	9	332286	332294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_012984	TCA	2	6	332980	332985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1087	NC_012984	AAT	2	6	333042	333047	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_012984	CCA	2	6	333076	333081	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1089	NC_012984	T	6	6	333082	333087	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_012984	AAGT	2	8	334817	334824	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_012984	A	6	6	334877	334882	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_012984	TAA	2	6	335299	335304	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_012984	A	6	6	335303	335308	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_012984	GTT	2	6	335341	335346	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_012984	CTC	2	6	335896	335901	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1096	NC_012984	T	6	6	337115	337120	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_012984	TGG	2	6	337180	337185	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_012984	TAGAA	2	10	337186	337195	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_012984	AAG	2	6	338190	338195	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_012984	CCA	2	6	338207	338212	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1101	NC_012984	AATT	2	8	338251	338258	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_012984	T	6	6	338975	338980	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_012984	TTAA	2	8	338984	338991	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_012984	TCC	2	6	339936	339941	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1105	NC_012984	TAC	2	6	339981	339986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1106	NC_012984	GGA	2	6	340053	340058	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_012984	AAT	2	6	340966	340971	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_012984	TTA	2	6	341049	341054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_012984	TGT	2	6	341103	341108	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_012984	ATT	2	6	341123	341128	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_012984	ATGCT	2	10	341147	341156	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
1112	NC_012984	TAG	2	6	341183	341188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_012984	AAT	2	6	341232	341237	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_012984	ATG	2	6	341249	341254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_012984	A	6	6	341288	341293	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_012984	A	6	6	341322	341327	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_012984	TTG	2	6	341362	341367	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_012984	TGA	2	6	341380	341385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_012984	GATA	2	8	341397	341404	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_012984	TTG	2	6	343340	343345	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_012984	AGT	2	6	343358	343363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_012984	GAA	2	6	343367	343372	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_012984	TTAT	2	8	343416	343423	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_012984	TGAC	2	8	343432	343439	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1125	NC_012984	CCT	2	6	343912	343917	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1126	NC_012984	AAT	2	6	343994	343999	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_012984	AAG	2	6	344100	344105	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_012984	TTA	2	6	344106	344111	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_012984	TAA	2	6	344114	344119	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_012984	AGG	2	6	346703	346708	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_012984	TG	3	6	348049	348054	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_012984	T	7	7	348137	348143	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_012984	ATG	2	6	348180	348185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_012984	GTC	2	6	348199	348204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1135	NC_012984	A	6	6	348244	348249	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1137	NC_012984	ATTA	2	8	348292	348299	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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