MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus plantarum JDM1

Total Repeats: 10967

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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10502	NC_012984	ATA	2	6	3049713	3049718	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10503	NC_012984	A	6	6	3049773	3049778	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10504	NC_012984	T	7	7	3049784	3049790	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10505	NC_012984	ATC	2	6	3049797	3049802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10506	NC_012984	AAT	2	6	3049808	3049813	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10507	NC_012984	AAT	2	6	3049842	3049847	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10508	NC_012984	CCT	2	6	3052793	3052798	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10509	NC_012984	TAT	2	6	3053486	3053491	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10510	NC_012984	ATT	2	6	3053504	3053509	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10511	NC_012984	AGT	2	6	3053513	3053518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10512	NC_012984	TCC	2	6	3054912	3054917	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10513	NC_012984	TCC	2	6	3055705	3055710	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10514	NC_012984	AAT	2	6	3055756	3055761	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10515	NC_012984	CAA	2	6	3055775	3055780	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10519	NC_012984	TTA	2	6	3057934	3057939	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10522	NC_012984	AAT	2	6	3058023	3058028	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10523	NC_012984	C	7	7	3058687	3058693	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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10537	NC_012984	AT	3	6	3062300	3062305	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10538	NC_012984	ATT	2	6	3062309	3062314	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10539	NC_012984	ATA	2	6	3063239	3063244	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10541	NC_012984	AAT	2	6	3065693	3065698	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10542	NC_012984	AAG	2	6	3066172	3066177	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10543	NC_012984	AAT	3	9	3066221	3066229	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10544	NC_012984	TTCTGA	2	12	3066817	3066828	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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10552	NC_012984	TAA	2	6	3072153	3072158	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10555	NC_012984	AAC	2	6	3072254	3072259	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10556	NC_012984	AT	3	6	3072269	3072274	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10557	NC_012984	ATT	2	6	3072316	3072321	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10558	NC_012984	A	7	7	3072366	3072372	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10561	NC_012984	CAT	2	6	3073556	3073561	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10562	NC_012984	TAT	2	6	3073626	3073631	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10563	NC_012984	TAA	2	6	3073665	3073670	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10565	NC_012984	AATA	2	8	3073725	3073732	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10566	NC_012984	TTC	2	6	3073766	3073771	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10569	NC_012984	TACGTC	2	12	3076928	3076939	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
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10572	NC_012984	ATT	2	6	3079706	3079711	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10575	NC_012984	ATT	2	6	3080590	3080595	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10599	NC_012984	AAT	2	6	3084926	3084931	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10601	NC_012984	GTT	2	6	3084996	3085001	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10603	NC_012984	GCTAT	2	10	3085048	3085057	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
10604	NC_012984	AAT	2	6	3085058	3085063	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10609	NC_012984	CATC	2	8	3085758	3085765	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
10610	NC_012984	T	7	7	3086331	3086337	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10611	NC_012984	TAA	2	6	3086361	3086366	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10623	NC_012984	TTAAC	2	10	3087154	3087163	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
10624	NC_012984	ATT	2	6	3088739	3088744	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10627	NC_012984	A	6	6	3088845	3088850	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.