MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus plantarum JDM1

Total Repeats: 10967

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_012984	ATT	2	6	159471	159476	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
502	NC_012984	AGGA	2	8	159520	159527	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
503	NC_012984	CAA	2	6	159528	159533	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
504	NC_012984	TTG	2	6	162238	162243	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
505	NC_012984	T	6	6	162251	162256	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
506	NC_012984	TAAA	2	8	162272	162279	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
507	NC_012984	G	6	6	162355	162360	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
508	NC_012984	G	6	6	163394	163399	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
509	NC_012984	TA	4	8	166095	166102	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
510	NC_012984	TTAA	2	8	166119	166126	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
511	NC_012984	TA	3	6	166139	166144	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
512	NC_012984	ATTT	2	8	166198	166205	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
513	NC_012984	GTTAAC	2	12	166219	166230	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
514	NC_012984	ATA	2	6	166268	166273	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
515	NC_012984	AGG	2	6	166305	166310	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
516	NC_012984	ATTT	2	8	167653	167660	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
517	NC_012984	TAG	2	6	169869	169874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
518	NC_012984	TAG	2	6	172136	172141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
519	NC_012984	ACG	2	6	173288	173293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
520	NC_012984	GAG	2	6	173294	173299	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
521	NC_012984	ATTC	2	8	175648	175655	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
522	NC_012984	TCC	2	6	178646	178651	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
523	NC_012984	GCGA	2	8	178686	178693	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
524	NC_012984	ATT	2	6	178858	178863	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
525	NC_012984	TAGC	2	8	178895	178902	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
526	NC_012984	TA	3	6	178926	178931	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
527	NC_012984	GTAT	2	8	178938	178945	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
528	NC_012984	TTC	2	6	178990	178995	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
529	NC_012984	TCAA	2	8	179020	179027	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
530	NC_012984	GC	3	6	179061	179066	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
531	NC_012984	TTG	2	6	179087	179092	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
532	NC_012984	AACG	2	8	179110	179117	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
533	NC_012984	TGA	2	6	179130	179135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
534	NC_012984	GTA	2	6	179143	179148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
535	NC_012984	TAA	2	6	179149	179154	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
536	NC_012984	CTAG	2	8	179155	179162	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
537	NC_012984	ATT	2	6	179170	179175	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
538	NC_012984	CGG	2	6	179553	179558	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
539	NC_012984	T	6	6	179561	179566	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
540	NC_012984	CCT	2	6	180448	180453	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
541	NC_012984	TTAT	2	8	180472	180479	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
542	NC_012984	TAA	2	6	180480	180485	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
543	NC_012984	TCC	2	6	182685	182690	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
544	NC_012984	TAA	2	6	182691	182696	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
545	NC_012984	ATT	2	6	184680	184685	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
546	NC_012984	TTTAA	2	10	184686	184695	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
547	NC_012984	AAT	2	6	184719	184724	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
548	NC_012984	AATTG	2	10	184761	184770	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
549	NC_012984	ATATA	2	10	184817	184826	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
550	NC_012984	TAA	2	6	189169	189174	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
551	NC_012984	ACC	2	6	189178	189183	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
552	NC_012984	A	6	6	189189	189194	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
553	NC_012984	CTC	2	6	190156	190161	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
554	NC_012984	GTG	2	6	190184	190189	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
555	NC_012984	TTA	2	6	190202	190207	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
556	NC_012984	TAAA	2	8	190209	190216	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
557	NC_012984	CAG	2	6	190280	190285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
558	NC_012984	ATTAA	2	10	190340	190349	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
559	NC_012984	CAG	2	6	191796	191801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
560	NC_012984	ATA	2	6	191845	191850	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
561	NC_012984	A	6	6	191863	191868	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
562	NC_012984	ATA	2	6	191882	191887	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
563	NC_012984	GATT	2	8	191901	191908	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
564	NC_012984	ACC	2	6	191919	191924	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
565	NC_012984	CACT	2	8	191948	191955	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
566	NC_012984	GTT	2	6	191973	191978	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
567	NC_012984	CCG	2	6	191981	191986	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
568	NC_012984	GCA	2	6	192040	192045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
569	NC_012984	TCGT	2	8	192096	192103	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
570	NC_012984	ATA	2	6	192120	192125	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
571	NC_012984	AAAT	2	8	192181	192188	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
572	NC_012984	T	6	6	192275	192280	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
573	NC_012984	T	6	6	192290	192295	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
574	NC_012984	GCT	2	6	194001	194006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
575	NC_012984	CGG	2	6	194030	194035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
576	NC_012984	TG	3	6	194037	194042	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
577	NC_012984	TGA	2	6	194078	194083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
578	NC_012984	TATGAT	2	12	194162	194173	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
579	NC_012984	GTTG	2	8	195129	195136	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
580	NC_012984	TGAT	2	8	195171	195178	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
581	NC_012984	TTA	2	6	195188	195193	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
582	NC_012984	AATT	2	8	195250	195257	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
583	NC_012984	ATT	2	6	195290	195295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
584	NC_012984	TA	3	6	195360	195365	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
585	NC_012984	A	6	6	195438	195443	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
586	NC_012984	ATT	2	6	195507	195512	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
587	NC_012984	AAG	2	6	195519	195524	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
588	NC_012984	TAA	2	6	195551	195556	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
589	NC_012984	A	6	6	195563	195568	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
590	NC_012984	TA	3	6	195591	195596	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
591	NC_012984	AAT	2	6	195611	195616	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
592	NC_012984	CAT	2	6	195723	195728	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
593	NC_012984	ATT	2	6	195772	195777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
594	NC_012984	AAC	2	6	195788	195793	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
595	NC_012984	AT	3	6	195880	195885	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
596	NC_012984	ATTA	2	8	195892	195899	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
597	NC_012984	ATAA	2	8	195907	195914	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
598	NC_012984	TA	3	6	195919	195924	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
599	NC_012984	CGA	2	6	195979	195984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
600	NC_012984	TA	3	6	196063	196068	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
601	NC_012984	G	6	6	196074	196079	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
602	NC_012984	TTTA	2	8	198889	198896	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
603	NC_012984	CGA	2	6	198924	198929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
604	NC_012984	GCCA	2	8	198989	198996	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
605	NC_012984	TAA	2	6	199043	199048	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
606	NC_012984	CCT	2	6	199060	199065	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
607	NC_012984	A	6	6	199076	199081	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
608	NC_012984	TTA	2	6	199112	199117	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
609	NC_012984	ATT	2	6	199128	199133	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
610	NC_012984	TA	3	6	200059	200064	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
611	NC_012984	AT	3	6	200105	200110	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
612	NC_012984	TA	3	6	200117	200122	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
613	NC_012984	A	6	6	200122	200127	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
614	NC_012984	CGCT	2	8	200128	200135	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
615	NC_012984	C	6	6	201846	201851	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
616	NC_012984	TAA	2	6	201908	201913	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
617	NC_012984	A	7	7	201953	201959	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
618	NC_012984	TTG	2	6	201970	201975	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
619	NC_012984	ATT	2	6	203773	203778	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
620	NC_012984	T	7	7	203777	203783	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
621	NC_012984	ATT	2	6	203794	203799	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
622	NC_012984	TTAA	2	8	203842	203849	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
623	NC_012984	TCC	2	6	205478	205483	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
624	NC_012984	AGT	2	6	206579	206584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
625	NC_012984	TAA	2	6	206595	206600	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
626	NC_012984	A	6	6	206599	206604	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
627	NC_012984	ATA	2	6	206637	206642	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
628	NC_012984	GT	3	6	206733	206738	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
629	NC_012984	AGG	2	6	206744	206749	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
630	NC_012984	ATG	2	6	206757	206762	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
631	NC_012984	TTAG	2	8	206773	206780	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
632	NC_012984	CAGT	2	8	206823	206830	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
633	NC_012984	AGCA	2	8	206852	206859	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
634	NC_012984	TAT	2	6	206910	206915	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
635	NC_012984	TAA	3	9	206916	206924	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
636	NC_012984	AACG	2	8	207582	207589	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
637	NC_012984	TGG	2	6	207612	207617	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
638	NC_012984	TCAAA	2	10	207650	207659	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
639	NC_012984	GCA	2	6	207670	207675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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641	NC_012984	GGT	2	6	207708	207713	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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972	NC_012984	TAAA	2	8	307559	307566	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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