MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus plantarum JDM1

Total Repeats: 10967

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_012984	CGA	2	6	1691819	1691824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5502	NC_012984	TC	3	6	1693621	1693626	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5503	NC_012984	A	6	6	1694758	1694763	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5504	NC_012984	CGT	2	6	1694767	1694772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5505	NC_012984	CGC	2	6	1698128	1698133	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5506	NC_012984	TGA	2	6	1698254	1698259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5507	NC_012984	AT	3	6	1698276	1698281	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5508	NC_012984	GTT	2	6	1698307	1698312	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5509	NC_012984	TCA	2	6	1698331	1698336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5510	NC_012984	AAC	2	6	1698691	1698696	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5511	NC_012984	CAA	2	6	1698726	1698731	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5512	NC_012984	A	7	7	1698730	1698736	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5513	NC_012984	T	7	7	1698766	1698772	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5514	NC_012984	TG	3	6	1698775	1698780	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5515	NC_012984	GCCA	2	8	1698789	1698796	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5516	NC_012984	TGC	3	9	1698908	1698916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5517	NC_012984	T	6	6	1698976	1698981	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5518	NC_012984	TCG	2	6	1699006	1699011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5519	NC_012984	CTC	2	6	1699026	1699031	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5520	NC_012984	CGG	2	6	1699061	1699066	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5521	NC_012984	AAC	2	6	1699068	1699073	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5522	NC_012984	CAT	3	9	1699142	1699150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5523	NC_012984	AAT	3	9	1699219	1699227	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5524	NC_012984	A	7	7	1699234	1699240	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5525	NC_012984	CCT	2	6	1701954	1701959	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5526	NC_012984	TTCCT	2	10	1703308	1703317	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
5527	NC_012984	ATT	2	6	1705142	1705147	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5528	NC_012984	TAAC	2	8	1705153	1705160	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5529	NC_012984	CACG	2	8	1705161	1705168	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5530	NC_012984	TTG	2	6	1705334	1705339	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5531	NC_012984	ATC	2	6	1705344	1705349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5532	NC_012984	ACTA	2	8	1705496	1705503	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5533	NC_012984	ATA	2	6	1705545	1705550	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5534	NC_012984	ATT	2	6	1705578	1705583	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5535	NC_012984	GA	3	6	1705588	1705593	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5536	NC_012984	TCA	2	6	1706882	1706887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5537	NC_012984	AC	4	8	1706895	1706902	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5538	NC_012984	CCT	2	6	1707698	1707703	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5539	NC_012984	AT	4	8	1708685	1708692	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5540	NC_012984	ATTA	2	8	1708720	1708727	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5541	NC_012984	TGT	2	6	1708780	1708785	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5542	NC_012984	AAGAA	2	10	1708792	1708801	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
5543	NC_012984	GAATG	2	10	1708803	1708812	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
5544	NC_012984	AAAC	2	8	1709400	1709407	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5545	NC_012984	ATT	2	6	1709452	1709457	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5546	NC_012984	ATC	2	6	1711910	1711915	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5547	NC_012984	ATT	2	6	1711998	1712003	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5548	NC_012984	GAC	2	6	1712184	1712189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5549	NC_012984	CAG	2	6	1712225	1712230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5550	NC_012984	TCA	2	6	1712240	1712245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5551	NC_012984	CTG	2	6	1712246	1712251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5552	NC_012984	CTT	2	6	1713209	1713214	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5553	NC_012984	ACT	2	6	1713237	1713242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5554	NC_012984	TCA	2	6	1713264	1713269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5555	NC_012984	CAC	2	6	1713339	1713344	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5556	NC_012984	CAGT	2	8	1713415	1713422	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5557	NC_012984	TGA	2	6	1713505	1713510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5558	NC_012984	GGA	2	6	1713530	1713535	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5559	NC_012984	AAC	2	6	1714687	1714692	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5560	NC_012984	GCA	2	6	1714756	1714761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5561	NC_012984	AAT	2	6	1714869	1714874	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5562	NC_012984	TGGTC	2	10	1714929	1714938	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
5563	NC_012984	GAA	2	6	1714984	1714989	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5564	NC_012984	ACC	2	6	1716125	1716130	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5565	NC_012984	T	6	6	1716238	1716243	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5566	NC_012984	A	6	6	1716304	1716309	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5567	NC_012984	TAT	2	6	1716367	1716372	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5568	NC_012984	GGT	2	6	1716397	1716402	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5569	NC_012984	ACC	2	6	1716442	1716447	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5570	NC_012984	CGTT	2	8	1717438	1717445	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5571	NC_012984	AATT	2	8	1717488	1717495	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5572	NC_012984	CAC	2	6	1719836	1719841	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5573	NC_012984	TC	3	6	1721175	1721180	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5574	NC_012984	CTT	2	6	1721181	1721186	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5575	NC_012984	AAAAG	2	10	1721192	1721201	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
5576	NC_012984	AAAC	2	8	1721218	1721225	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5577	NC_012984	TCA	2	6	1721234	1721239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5578	NC_012984	ATT	2	6	1721252	1721257	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5579	NC_012984	AAC	2	6	1721290	1721295	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5580	NC_012984	TTAG	2	8	1722861	1722868	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5581	NC_012984	CAT	2	6	1722883	1722888	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5582	NC_012984	ACTG	2	8	1723377	1723384	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5583	NC_012984	ATCA	2	8	1723408	1723415	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5584	NC_012984	CCA	2	6	1724575	1724580	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5585	NC_012984	TTG	2	6	1724658	1724663	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5586	NC_012984	ATCA	2	8	1724681	1724688	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5587	NC_012984	A	6	6	1726231	1726236	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5588	NC_012984	AGG	2	6	1727007	1727012	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5591	NC_012984	CAA	2	6	1727732	1727737	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5592	NC_012984	TGG	2	6	1727803	1727808	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5594	NC_012984	CCT	2	6	1728239	1728244	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5595	NC_012984	TAT	2	6	1728258	1728263	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5596	NC_012984	TAT	2	6	1728281	1728286	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5597	NC_012984	A	6	6	1728335	1728340	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5598	NC_012984	T	6	6	1728348	1728353	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5599	NC_012984	AT	3	6	1728355	1728360	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5600	NC_012984	TAT	3	9	1728358	1728366	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5601	NC_012984	ATA	2	6	1728374	1728379	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5602	NC_012984	TGA	2	6	1728807	1728812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5603	NC_012984	TAC	2	6	1728973	1728978	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5604	NC_012984	TGT	2	6	1728979	1728984	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5605	NC_012984	TTA	2	6	1729762	1729767	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5607	NC_012984	ATT	2	6	1729795	1729800	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5608	NC_012984	TAA	2	6	1729893	1729898	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5609	NC_012984	TAT	2	6	1729965	1729970	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5610	NC_012984	A	6	6	1729988	1729993	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5611	NC_012984	TGC	2	6	1730060	1730065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5612	NC_012984	GCAA	2	8	1731841	1731848	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5613	NC_012984	AAG	2	6	1733231	1733236	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5614	NC_012984	ATA	2	6	1733311	1733316	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5615	NC_012984	A	7	7	1733323	1733329	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5616	NC_012984	C	6	6	1735763	1735768	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5617	NC_012984	AAT	2	6	1735774	1735779	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5618	NC_012984	ACT	2	6	1735850	1735855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5619	NC_012984	CTA	2	6	1735865	1735870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5620	NC_012984	A	6	6	1735977	1735982	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5621	NC_012984	TAA	2	6	1736962	1736967	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5622	NC_012984	GTC	2	6	1737023	1737028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5623	NC_012984	TCC	2	6	1738165	1738170	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5624	NC_012984	AGAA	2	8	1738354	1738361	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5625	NC_012984	CAC	2	6	1739287	1739292	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5626	NC_012984	AC	3	6	1739294	1739299	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5627	NC_012984	GCT	2	6	1739313	1739318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5629	NC_012984	AATTG	2	10	1739360	1739369	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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