MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Listeria monocytogenes Clip81459

Total Repeats: 364

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012488	TACAT	2	10	291	300	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_012488	ATTGT	2	10	17720	17729	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_012488	AAATG	2	10	26104	26113	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_012488	GAAAA	2	10	36435	36444	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
5	NC_012488	AGATA	2	10	36691	36700	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_012488	AAAGG	2	10	37662	37671	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
7	NC_012488	CTATT	2	10	38158	38167	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
8	NC_012488	GACTT	2	10	53455	53464	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
9	NC_012488	ATGGT	2	10	55707	55716	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
10	NC_012488	AAATA	2	10	57763	57772	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_012488	TAAAA	2	10	58745	58754	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_012488	TTATG	2	10	60951	60960	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_012488	TTTTA	2	10	64863	64872	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_012488	TTTTA	2	10	82178	82187	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_012488	TTTTA	2	10	82283	82292	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_012488	AACAA	2	10	86756	86765	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
17	NC_012488	ATTTT	2	10	88987	88996	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_012488	ATATC	2	10	110936	110945	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
19	NC_012488	AGAGA	2	10	121762	121771	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
20	NC_012488	TTACT	2	10	123201	123210	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
21	NC_012488	AAAGT	2	10	125442	125451	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
22	NC_012488	AGTAG	2	10	147150	147159	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
23	NC_012488	TAAAA	2	10	148205	148214	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_012488	GATAA	2	10	150866	150875	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_012488	ATATG	2	10	157846	157855	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_012488	TCTAA	2	10	160210	160219	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
27	NC_012488	AAACA	2	10	160821	160830	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
28	NC_012488	TTGTA	2	10	169931	169940	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
29	NC_012488	ATAGA	2	10	190635	190644	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_012488	TTGTC	2	10	196161	196170	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
31	NC_012488	ACAAA	2	10	196523	196532	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
32	NC_012488	ATATA	2	10	204269	204278	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_012488	GTGAG	2	10	208000	208009	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
34	NC_012488	GAGTG	2	10	212294	212303	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
35	NC_012488	AGCCG	2	10	220471	220480	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
36	NC_012488	GAAAA	2	10	228611	228620	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_012488	GAAAA	2	10	229020	229029	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_012488	GAATA	2	10	232109	232118	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_012488	AAATT	2	10	233794	233803	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_012488	TAATT	2	10	233995	234004	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_012488	TCGTG	2	10	235154	235163	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
42	NC_012488	AAGGT	2	10	236622	236631	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
43	NC_012488	TAATT	2	10	240014	240023	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_012488	TCGTG	2	10	241173	241182	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
45	NC_012488	AAGGT	2	10	242641	242650	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
46	NC_012488	GGCAT	2	10	259933	259942	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
47	NC_012488	AGTGA	2	10	282049	282058	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
48	NC_012488	AATTA	2	10	284207	284216	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_012488	AGGTA	2	10	288349	288358	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
50	NC_012488	TGGCT	2	10	294349	294358	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
51	NC_012488	ACTAA	2	10	295725	295734	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
52	NC_012488	TATAA	2	10	300951	300960	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_012488	AAAGA	2	10	304179	304188	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
54	NC_012488	TTATT	2	10	326735	326744	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_012488	TAGAT	2	10	329162	329171	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
56	NC_012488	AATAA	2	10	345602	345611	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_012488	ATTGT	2	10	346960	346969	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
58	NC_012488	TTTTA	2	10	356967	356976	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_012488	AGGAG	2	10	360088	360097	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
60	NC_012488	ATAGA	2	10	360392	360401	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
61	NC_012488	AAATG	2	10	369270	369279	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
62	NC_012488	CACAC	2	10	370204	370213	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
63	NC_012488	AAATT	2	10	370834	370843	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_012488	GTGAT	2	10	385484	385493	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
65	NC_012488	GAAAC	2	10	390615	390624	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
66	NC_012488	TTTGG	2	10	392395	392404	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
67	NC_012488	AAAAG	2	10	392462	392471	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
68	NC_012488	ATTTT	2	10	405944	405953	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_012488	TAAAT	2	10	406388	406397	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_012488	CAAAA	2	10	413272	413281	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
71	NC_012488	ATAAA	2	10	418952	418961	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_012488	TAGAT	2	10	422360	422369	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
73	NC_012488	AGGTG	2	10	444412	444421	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
74	NC_012488	GGAAA	2	10	449537	449546	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
75	NC_012488	CTTAT	2	10	475432	475441	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
76	NC_012488	TTTAT	2	10	485760	485769	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_012488	TTTCT	2	10	490133	490142	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
78	NC_012488	AATTT	2	10	506420	506429	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_012488	ATAGT	2	10	506455	506464	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
80	NC_012488	TTATT	2	10	510518	510527	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_012488	CTATG	2	10	510684	510693	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
82	NC_012488	ATACA	2	10	516603	516612	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
83	NC_012488	AAAAC	2	10	541434	541443	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
84	NC_012488	GTTTT	2	10	541456	541465	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
85	NC_012488	AAACA	2	10	543962	543971	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
86	NC_012488	TATAG	2	10	562177	562186	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
87	NC_012488	GAAAA	2	10	566287	566296	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
88	NC_012488	TAGAC	2	10	582497	582506	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
89	NC_012488	TAAAA	2	10	588426	588435	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_012488	CTATG	2	10	595862	595871	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
91	NC_012488	AAAGA	2	10	601316	601325	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
92	NC_012488	ATAAA	2	10	616288	616297	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_012488	AGAAT	2	10	617158	617167	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
94	NC_012488	TGGAA	2	10	617286	617295	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
95	NC_012488	AATCA	2	10	620289	620298	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
96	NC_012488	TATAA	2	10	628227	628236	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_012488	ATTGA	2	10	628265	628274	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
98	NC_012488	ATTAA	2	10	641573	641582	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_012488	ATATA	2	10	673042	673051	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_012488	ATTTT	2	10	675744	675753	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_012488	TACAT	2	10	676181	676190	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
102	NC_012488	TATAA	2	10	677235	677244	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_012488	TATAA	2	10	696821	696830	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_012488	GAAAT	2	10	703518	703527	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
105	NC_012488	TTACT	2	10	711541	711550	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
106	NC_012488	ATTTA	2	10	717192	717201	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_012488	GGGGA	2	10	726945	726954	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
108	NC_012488	TATTT	2	10	733183	733192	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_012488	AGAGA	2	10	733334	733343	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
110	NC_012488	CTTTT	2	10	734309	734318	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
111	NC_012488	CTTTT	2	10	783665	783674	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
112	NC_012488	TAGTT	2	10	783678	783687	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
113	NC_012488	TGAAA	2	10	802572	802581	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
114	NC_012488	AATGA	2	10	819665	819674	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
115	NC_012488	GTATA	2	10	839182	839191	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
116	NC_012488	AATAA	2	10	845620	845629	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_012488	ATTTT	2	10	849206	849215	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_012488	GTTTT	2	10	862140	862149	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
119	NC_012488	AAATT	2	10	863217	863226	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_012488	AGGAA	2	10	863740	863749	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
121	NC_012488	GATGA	2	10	875831	875840	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
122	NC_012488	ATAGA	2	10	884507	884516	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
123	NC_012488	ATCTT	2	10	885687	885696	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
124	NC_012488	TAATT	2	10	889896	889905	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_012488	ATTTT	2	10	890163	890172	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_012488	AATGT	2	10	897565	897574	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
127	NC_012488	TTATA	2	10	921303	921312	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_012488	ATAAC	2	10	937294	937303	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
129	NC_012488	TTTTA	2	10	938759	938768	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_012488	ATAGA	2	10	942671	942680	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
131	NC_012488	TATAA	2	10	956932	956941	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_012488	TGAAA	2	10	966424	966433	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
133	NC_012488	TTTTA	2	10	972760	972769	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_012488	TTTAT	2	10	973052	973061	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_012488	ATGAG	2	10	992827	992836	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
136	NC_012488	TTTTA	2	10	999959	999968	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_012488	TAAAA	2	10	1000024	1000033	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_012488	TTTTA	2	10	1007795	1007804	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_012488	TATAA	2	10	1014495	1014504	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_012488	TCTAT	2	10	1027266	1027275	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
141	NC_012488	AGATA	2	10	1030956	1030965	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
142	NC_012488	GAGAG	2	10	1039897	1039906	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
143	NC_012488	AAATG	2	10	1044555	1044564	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
144	NC_012488	TTCTA	2	10	1044570	1044579	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
145	NC_012488	CAAAC	2	10	1044736	1044745	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
146	NC_012488	TTTTC	2	10	1048455	1048464	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
147	NC_012488	AGTTT	2	10	1058349	1058358	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
148	NC_012488	CAAAA	2	10	1060715	1060724	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
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274	NC_012488	CACTT	2	10	2119451	2119460	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
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284	NC_012488	GAAAA	2	10	2227563	2227572	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
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291	NC_012488	TTAAA	2	10	2311073	2311082	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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330	NC_012488	AAAAG	2	10	2611932	2611941	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
331	NC_012488	ATTAT	2	10	2614301	2614310	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
332	NC_012488	ATCAT	2	10	2623468	2623477	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
333	NC_012488	TTATA	2	10	2635408	2635417	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
334	NC_012488	TTTTA	2	10	2635823	2635832	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.