MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Listeria monocytogenes Clip81459

Total Repeats: 3960

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012488	TAT	2	6	4581	4586	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_012488	TGA	2	6	5999	6004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_012488	AAT	2	6	6022	6027	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_012488	TAA	2	6	7986	7991	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_012488	TTA	2	6	7997	8002	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_012488	TAA	2	6	12835	12840	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_012488	AAC	2	6	15896	15901	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_012488	GTT	2	6	15914	15919	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_012488	TAT	2	6	15977	15982	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_012488	ATT	2	6	15996	16001	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_012488	CCA	2	6	16051	16056	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_012488	ATA	2	6	16060	16065	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_012488	ATA	2	6	16076	16081	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_012488	ATA	2	6	16093	16098	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_012488	TAT	2	6	16122	16127	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_012488	ATC	2	6	16841	16846	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_012488	TCA	2	6	16857	16862	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_012488	TTG	2	6	16874	16879	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_012488	AAT	2	6	16882	16887	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_012488	ATT	2	6	16895	16900	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_012488	TAT	2	6	17028	17033	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_012488	ATA	2	6	17047	17052	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_012488	TTG	2	6	17061	17066	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_012488	ATT	2	6	17081	17086	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_012488	ATA	2	6	17296	17301	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_012488	AAG	2	6	17598	17603	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_012488	AAT	2	6	17640	17645	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_012488	GTT	2	6	17735	17740	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_012488	CAT	2	6	17797	17802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_012488	ATC	2	6	17819	17824	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_012488	TAT	2	6	17878	17883	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_012488	ATT	2	6	17926	17931	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_012488	CTT	2	6	18220	18225	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_012488	CTC	2	6	23512	23517	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_012488	ATT	2	6	23654	23659	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_012488	GAG	2	6	23716	23721	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_012488	TCA	2	6	25186	25191	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_012488	TTA	2	6	26153	26158	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_012488	AAG	2	6	27925	27930	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_012488	GGA	2	6	29560	29565	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_012488	ATT	2	6	30303	30308	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_012488	GGA	2	6	30322	30327	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_012488	TCA	2	6	31042	31047	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_012488	GTC	2	6	31171	31176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_012488	TAA	2	6	33092	33097	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_012488	TCC	2	6	35437	35442	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_012488	AGT	2	6	36411	36416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_012488	AAG	2	6	36475	36480	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_012488	TTA	2	6	36522	36527	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_012488	CAA	2	6	36655	36660	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_012488	TAG	2	6	36680	36685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_012488	AGA	2	6	36858	36863	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_012488	ATA	2	6	40727	40732	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_012488	CAA	2	6	40786	40791	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_012488	TCT	2	6	46701	46706	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_012488	ATG	2	6	46811	46816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_012488	AGG	2	6	47926	47931	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_012488	AGA	2	6	47932	47937	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_012488	AGG	2	6	51492	51497	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_012488	ATA	2	6	55620	55625	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_012488	ATT	2	6	55647	55652	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_012488	AGG	2	6	55749	55754	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_012488	GAG	2	6	56097	56102	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_012488	AGG	2	6	56680	56685	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_012488	AAG	2	6	57013	57018	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_012488	TTA	2	6	57908	57913	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_012488	GGA	2	6	58798	58803	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_012488	TGA	2	6	60898	60903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_012488	ATA	2	6	60924	60929	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_012488	TGA	2	6	60931	60936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_012488	TGG	2	6	64987	64992	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_012488	ATA	2	6	66429	66434	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_012488	TGT	2	6	66532	66537	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_012488	TAT	2	6	66550	66555	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_012488	ATA	2	6	66648	66653	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_012488	CAA	2	6	66967	66972	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_012488	TAA	2	6	79859	79864	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_012488	CAG	2	6	79871	79876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_012488	ACT	2	6	79889	79894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_012488	AAC	2	6	79895	79900	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_012488	AGG	2	6	79925	79930	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_012488	ATT	2	6	80842	80847	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_012488	TAG	3	9	81179	81187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_012488	TTA	2	6	81909	81914	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_012488	ATA	2	6	82048	82053	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_012488	ATT	2	6	82058	82063	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_012488	TGT	2	6	82233	82238	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_012488	TCA	2	6	82330	82335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_012488	TAT	2	6	82359	82364	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_012488	GGA	2	6	82550	82555	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_012488	GAA	2	6	82679	82684	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_012488	ACT	2	6	82759	82764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_012488	GAG	2	6	85524	85529	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_012488	GTT	2	6	86584	86589	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_012488	AGC	2	6	86604	86609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_012488	CTT	2	6	86723	86728	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_012488	CTT	2	6	86778	86783	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_012488	ATA	2	6	86813	86818	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_012488	ACC	2	6	86919	86924	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
100	NC_012488	TGT	2	6	87392	87397	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_012488	TGT	2	6	88892	88897	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_012488	GAT	2	6	88979	88984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_012488	TAG	2	6	89075	89080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_012488	ATA	3	9	89190	89198	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_012488	ATG	2	6	89202	89207	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_012488	ACA	2	6	98209	98214	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_012488	ACA	2	6	98236	98241	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_012488	ACA	2	6	105049	105054	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_012488	AAT	2	6	105071	105076	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_012488	AGG	2	6	105235	105240	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
111	NC_012488	AGG	2	6	106225	106230	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_012488	GGA	2	6	107052	107057	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_012488	TAA	2	6	108064	108069	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_012488	ATA	2	6	108552	108557	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_012488	AGG	2	6	108600	108605	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_012488	GCT	2	6	108990	108995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_012488	TGC	2	6	110974	110979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_012488	TAT	2	6	110987	110992	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_012488	GTT	2	6	111032	111037	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_012488	AGG	2	6	112059	112064	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
121	NC_012488	AAG	2	6	112731	112736	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_012488	GAG	2	6	119682	119687	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
123	NC_012488	AAT	2	6	121682	121687	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_012488	GAT	2	6	121782	121787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_012488	CAA	2	6	123282	123287	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_012488	TTC	2	6	123320	123325	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_012488	ATA	2	6	125361	125366	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_012488	GGA	2	6	125454	125459	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
129	NC_012488	AGG	2	6	126472	126477	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
130	NC_012488	GAA	2	6	126823	126828	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_012488	AGG	2	6	131929	131934	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
132	NC_012488	AGG	2	6	132962	132967	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
133	NC_012488	GCT	2	6	134125	134130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_012488	ATA	2	6	136619	136624	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_012488	AGG	2	6	136673	136678	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
136	NC_012488	CTT	2	6	139024	139029	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_012488	TAT	2	6	139060	139065	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_012488	AGG	2	6	139166	139171	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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140	NC_012488	AAT	2	6	139822	139827	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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