MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Listeria monocytogenes HCC23 chromosome

Total Repeats: 4189

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011660	TGC	2	6	17	22	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_011660	GTC	2	6	66	71	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_011660	ATA	2	6	97	102	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011660	AAT	2	6	158	163	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011660	TAT	2	6	170	175	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011660	GTA	2	6	191	196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011660	TAA	2	6	219	224	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011660	TTG	2	6	1165	1170	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011660	TAT	2	6	1191	1196	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011660	TCC	2	6	3615	3620	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_011660	ACC	2	6	3704	3709	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_011660	GTT	2	6	3795	3800	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011660	GTT	2	6	3845	3850	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011660	CAG	2	6	3864	3869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_011660	CGT	2	6	3897	3902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_011660	TAA	2	6	3924	3929	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011660	TAG	2	6	3990	3995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011660	ATG	2	6	8423	8428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011660	CTT	2	6	10551	10556	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_011660	AAC	2	6	12470	12475	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_011660	TAG	2	6	12564	12569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011660	GAG	2	6	12693	12698	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011660	ATT	2	6	15213	15218	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011660	TAG	2	6	15258	15263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011660	TTA	2	6	15393	15398	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011660	AAC	2	6	15407	15412	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_011660	GGA	2	6	15423	15428	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011660	TCC	2	6	18751	18756	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_011660	TTA	2	6	18765	18770	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011660	ATA	2	6	19700	19705	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011660	CTT	2	6	19757	19762	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_011660	ATT	2	6	21135	21140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011660	TAA	2	6	25890	25895	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011660	CAA	2	6	25902	25907	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_011660	GTT	2	6	26622	26627	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011660	TAA	2	6	26757	26762	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011660	GGA	2	6	26778	26783	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011660	CTT	2	6	28987	28992	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_011660	AGG	2	6	29247	29252	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011660	TTC	2	6	29957	29962	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_011660	ATG	2	6	32198	32203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011660	TAA	2	6	32211	32216	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011660	GCT	2	6	32224	32229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_011660	AAG	2	6	32339	32344	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011660	TAG	2	6	33134	33139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011660	CAG	2	6	33312	33317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_011660	TAA	2	6	34976	34981	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011660	CTT	2	6	35609	35614	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_011660	ATT	2	6	36884	36889	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011660	ACA	2	6	36904	36909	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_011660	CAA	2	6	36937	36942	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_011660	TAA	2	6	37056	37061	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_011660	ATC	2	6	37123	37128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_011660	AGA	2	6	37156	37161	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_011660	TCA	2	6	38113	38118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_011660	CGG	2	6	38171	38176	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_011660	ATG	2	6	39105	39110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_011660	TTG	2	6	39136	39141	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_011660	TTA	2	6	39202	39207	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_011660	TAA	2	6	39242	39247	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_011660	AAT	2	6	39306	39311	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_011660	AAT	2	6	39363	39368	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_011660	ATG	2	6	39376	39381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_011660	CTT	2	6	42841	42846	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_011660	ATT	2	6	44244	44249	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_011660	GGT	2	6	44277	44282	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_011660	TAC	2	6	45569	45574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_011660	ATT	2	6	45610	45615	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_011660	GAT	2	6	46102	46107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_011660	AAT	2	6	46397	46402	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_011660	CTA	2	6	46456	46461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_011660	AAT	2	6	46579	46584	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_011660	AGG	2	6	46586	46591	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_011660	GCG	2	6	49829	49834	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_011660	AAG	2	6	52448	52453	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_011660	TGT	2	6	52497	52502	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_011660	TAA	2	6	52528	52533	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_011660	AAG	2	6	52580	52585	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_011660	TTA	2	6	52604	52609	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_011660	ATA	2	6	52701	52706	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_011660	ATT	2	6	54247	54252	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_011660	ATA	2	6	54257	54262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_011660	GAG	2	6	56409	56414	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_011660	AGG	2	6	56425	56430	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_011660	TCT	2	6	57614	57619	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_011660	TTA	2	6	57713	57718	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_011660	AGA	2	6	57759	57764	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_011660	CCG	2	6	57789	57794	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_011660	AAT	2	6	58082	58087	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_011660	ATA	2	6	58143	58148	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_011660	TAG	3	9	58187	58195	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_011660	TGT	2	6	58241	58246	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_011660	ATC	2	6	58433	58438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_011660	TCA	2	6	58440	58445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_011660	TCG	2	6	58538	58543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_011660	ACT	2	6	58553	58558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_011660	TGA	2	6	58874	58879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_011660	TTC	2	6	58901	58906	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_011660	TAT	2	6	58995	59000	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_011660	TAA	2	6	59560	59565	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_011660	AGG	2	6	59587	59592	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_011660	AAT	2	6	59868	59873	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_011660	GGT	2	6	62520	62525	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_011660	GAG	2	6	63451	63456	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_011660	AAT	2	6	63458	63463	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_011660	AGG	2	6	64896	64901	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_011660	GAG	2	6	65406	65411	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_011660	GAG	2	6	65423	65428	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_011660	GTA	2	6	65684	65689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_011660	AAC	2	6	65713	65718	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_011660	TAA	2	6	65803	65808	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_011660	TTA	2	6	65828	65833	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_011660	TGT	2	6	67209	67214	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_011660	GTA	2	6	69606	69611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_011660	GCT	2	6	69708	69713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_011660	ATT	2	6	69730	69735	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_011660	AGG	2	6	69750	69755	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_011660	AAT	2	6	69758	69763	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_011660	ATA	2	6	70689	70694	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_011660	CAA	2	6	73640	73645	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_011660	ATT	2	6	73649	73654	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_011660	GTT	2	6	73656	73661	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_011660	TTG	2	6	74777	74782	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_011660	TTA	2	6	74837	74842	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_011660	GAT	2	6	74875	74880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_011660	TAA	2	6	76203	76208	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_011660	ACT	2	6	76211	76216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_011660	GAT	2	6	76410	76415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_011660	AGG	2	6	76457	76462	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
130	NC_011660	AGT	2	6	76463	76468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_011660	AGT	2	6	78089	78094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_011660	GGT	2	6	78099	78104	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
133	NC_011660	TCT	2	6	80205	80210	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_011660	CTT	2	6	80275	80280	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_011660	AAG	2	6	80334	80339	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_011660	CTT	2	6	80346	80351	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_011660	AGG	2	6	80376	80381	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
138	NC_011660	ATA	2	6	80959	80964	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_011660	TAA	2	6	81077	81082	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_011660	TTA	2	6	81129	81134	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_011660	TGA	2	6	81149	81154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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145	NC_011660	TGA	2	6	85824	85829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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147	NC_011660	TAA	2	6	86044	86049	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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321	NC_011660	TTA	2	6	217904	217909	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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