MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Listeria monocytogenes HCC23 chromosome

Total Repeats: 8769

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011660	TGC	2	6	17	22	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_011660	AAGG	2	8	57	64	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011660	GTC	2	6	66	71	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_011660	ATA	2	6	97	102	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011660	T	7	7	139	145	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011660	AAT	2	6	158	163	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011660	TAT	2	6	170	175	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011660	GTA	2	6	191	196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011660	TAA	2	6	219	224	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011660	GGGTG	2	10	231	240	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011660	TTG	2	6	1165	1170	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011660	T	7	7	1174	1180	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011660	TAT	2	6	1191	1196	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011660	TCC	2	6	3615	3620	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_011660	TAAAA	2	10	3639	3648	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011660	A	7	7	3662	3668	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011660	ACC	2	6	3704	3709	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_011660	ATTT	2	8	3713	3720	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011660	GTT	2	6	3795	3800	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011660	CTTA	2	8	3802	3809	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_011660	GTT	2	6	3845	3850	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011660	T	6	6	3849	3854	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011660	CAG	2	6	3864	3869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_011660	CT	3	6	3876	3881	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_011660	A	6	6	3887	3892	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011660	CGT	2	6	3897	3902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_011660	TAA	2	6	3924	3929	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011660	GA	3	6	3977	3982	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011660	TAG	2	6	3990	3995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011660	TAAG	2	8	4040	4047	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011660	TATAA	2	10	4054	4063	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011660	TA	3	6	4087	4092	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011660	AG	3	6	7612	7617	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011660	ATG	2	6	8423	8428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011660	CTT	2	6	10551	10556	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_011660	G	6	6	12372	12377	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011660	T	7	7	12383	12389	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011660	TTAT	2	8	12392	12399	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011660	AAC	2	6	12470	12475	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_011660	A	6	6	12528	12533	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011660	TAG	2	6	12564	12569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011660	AATA	2	8	12597	12604	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011660	T	6	6	12635	12640	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011660	ATTA	2	8	12661	12668	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011660	TA	3	6	12667	12672	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011660	GAG	2	6	12693	12698	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011660	A	6	6	15202	15207	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011660	ATT	2	6	15213	15218	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011660	A	6	6	15244	15249	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011660	TAG	2	6	15258	15263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011660	AT	3	6	15314	15319	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011660	T	7	7	15372	15378	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_011660	TTA	2	6	15393	15398	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_011660	AAC	2	6	15407	15412	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_011660	GGA	2	6	15423	15428	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_011660	AG	3	6	17542	17547	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011660	T	7	7	17553	17559	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_011660	TCC	2	6	18751	18756	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_011660	TTA	2	6	18765	18770	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_011660	ATA	2	6	19700	19705	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_011660	CTT	2	6	19757	19762	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_011660	T	7	7	19761	19767	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_011660	TA	3	6	19792	19797	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_011660	ATGAT	2	10	20772	20781	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
65	NC_011660	T	6	6	21117	21122	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_011660	ATT	2	6	21135	21140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_011660	T	7	7	25805	25811	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_011660	GAAA	2	8	25818	25825	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_011660	T	6	6	25872	25877	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_011660	TAA	2	6	25890	25895	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_011660	CAA	2	6	25902	25907	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_011660	A	6	6	25906	25911	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_011660	A	6	6	26264	26269	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_011660	A	6	6	26483	26488	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_011660	T	7	7	26541	26547	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_011660	ATGAAA	2	12	26589	26600	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_011660	A	6	6	26598	26603	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_011660	GTT	2	6	26622	26627	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_011660	ATCA	2	8	26630	26637	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
80	NC_011660	A	7	7	26666	26672	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_011660	TAA	2	6	26757	26762	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_011660	GGA	2	6	26778	26783	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_011660	CTT	2	6	28987	28992	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_011660	AC	3	6	28993	28998	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_011660	T	7	7	29204	29210	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_011660	AGG	2	6	29247	29252	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_011660	TATAA	2	10	29939	29948	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_011660	TTC	2	6	29957	29962	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_011660	A	6	6	32180	32185	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_011660	ATG	2	6	32198	32203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_011660	TAA	2	6	32211	32216	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_011660	GCT	2	6	32224	32229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_011660	CTTTT	2	10	32309	32318	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
94	NC_011660	AAG	2	6	32339	32344	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_011660	A	6	6	32419	32424	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_011660	TAAA	2	8	32432	32439	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_011660	AGAT	2	8	33024	33031	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
98	NC_011660	GTCT	2	8	33054	33061	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
99	NC_011660	T	8	8	33064	33071	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_011660	ATAAA	2	10	33101	33110	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_011660	GACTT	2	10	33111	33120	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
102	NC_011660	TAG	2	6	33134	33139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_011660	TATTT	2	10	33140	33149	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_011660	T	6	6	33221	33226	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_011660	CAG	2	6	33312	33317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_011660	AGGA	2	8	33352	33359	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_011660	T	7	7	33365	33371	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_011660	TAA	2	6	34976	34981	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_011660	A	6	6	34980	34985	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_011660	T	6	6	35012	35017	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_011660	CTT	2	6	35609	35614	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_011660	AGTT	2	8	35622	35629	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
113	NC_011660	TAAA	2	8	36870	36877	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_011660	ATT	2	6	36884	36889	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_011660	ACA	2	6	36904	36909	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_011660	CAA	2	6	36937	36942	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_011660	T	6	6	36961	36966	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_011660	TAA	2	6	37056	37061	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_011660	T	6	6	37067	37072	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_011660	ACAA	2	8	37082	37089	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
121	NC_011660	ATC	2	6	37123	37128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_011660	AGA	2	6	37156	37161	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_011660	TCA	2	6	38113	38118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_011660	TGTT	2	8	38135	38142	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
125	NC_011660	CGG	2	6	38171	38176	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_011660	GAGG	2	8	38222	38229	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
127	NC_011660	ATG	2	6	39105	39110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_011660	TTG	2	6	39136	39141	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_011660	T	6	6	39155	39160	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_011660	TA	3	6	39178	39183	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_011660	TTA	2	6	39202	39207	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_011660	TAA	2	6	39242	39247	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_011660	AAT	2	6	39306	39311	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_011660	TAGT	2	8	39324	39331	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
135	NC_011660	GTTAT	2	10	39353	39362	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
136	NC_011660	AAT	2	6	39363	39368	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_011660	AT	3	6	39367	39372	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_011660	ATG	2	6	39376	39381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_011660	AG	3	6	39398	39403	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
140	NC_011660	T	7	7	42826	42832	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_011660	CTT	2	6	42841	42846	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_011660	ATT	2	6	44244	44249	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_011660	TATT	2	8	44259	44266	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_011660	GGT	2	6	44277	44282	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
145	NC_011660	TAC	2	6	45569	45574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_011660	AGAA	2	8	45577	45584	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
147	NC_011660	ATT	2	6	45610	45615	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_011660	CTTG	2	8	46032	46039	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
149	NC_011660	TG	3	6	46070	46075	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
150	NC_011660	GAT	2	6	46102	46107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
151	NC_011660	TGTA	2	8	46381	46388	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
152	NC_011660	ACGA	2	8	46389	46396	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
153	NC_011660	AAT	2	6	46397	46402	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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156	NC_011660	CTA	2	6	46456	46461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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158	NC_011660	T	7	7	46529	46535	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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163	NC_011660	T	7	7	49839	49845	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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291	NC_011660	GTT	2	6	85807	85812	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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442	NC_011660	AGG	2	6	146096	146101	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
443	NC_011660	ACC	2	6	146354	146359	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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460	NC_011660	ATT	2	6	151373	151378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
461	NC_011660	T	7	7	151413	151419	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
462	NC_011660	TACA	2	8	151484	151491	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
463	NC_011660	TAA	2	6	151512	151517	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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468	NC_011660	GGA	2	6	159853	159858	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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470	NC_011660	T	6	6	160977	160982	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
471	NC_011660	T	6	6	161000	161005	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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476	NC_011660	TAA	2	6	161164	161169	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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481	NC_011660	T	6	6	161463	161468	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
482	NC_011660	AT	3	6	161478	161483	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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485	NC_011660	AAT	2	6	161527	161532	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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